発酵食品は、微生物なしにはつくれない。
一方、各種の病原性細菌は、たくさんの研究者の方々の命を奪い、その研究過程で解明された多くの発酵の原理から工業用エタノールの生産にいたるまで、現在では大規模な発酵工業を創出するに至っている。
一部の微生物は地球環境の保持にも重要な役割を担っており、人間や動物に利用されたあとの有機物は微生物によって更に分解され、最終的には炭素ガス、窒素ガスとして無機化され、地球環境の定状性を保っているといわれている。
現在まで多くは分離培養した微生物を対象に研究が進められてきたが、分離培養が困難な微生物もたくさん生息し(微生物の90㌫もしくはそれ以上)ていることから、今後は更に酵素を活用した増殖方法や塩基配列決定方法の開発が必要になってくるようだ。
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