149
出願番号 : 特許出願2000-123448 出願日 : 2000年4月25日
公開番号 : 特許公開2001-305104 公開日 : 2001年10月31日
出願人 : タイテック株式会社 発明者 : 西垣 功一 外3名
発明の名称 : ゲノムプロフィリング画像から特徴点を抽出する方法、並びに該方法で得られた特徴点群を用いた遺伝子型による種同定方法および類縁性同定方法
【課題】 遺伝子型による微生物の種の同定を定量的な手法で正確に且つ簡便に行うことを可能にするための中間的な処理方法として、ゲノムプロフィリング画像から特徴点を抽出する方法を提供する。
【解決手段】 生物の遺伝子を増幅し、増幅したDNAを電気泳動させて得られるゲル電気泳動物をゲノムプロフィリング画像として取り込む取込工程と、取り込んだゲノムプロフィリング画像を温度方向および移動度方向に沿ってそれぞれ規格化する規格化工程と、規格化されたゲノムプロフィリング画像の各バンドに対応して複数の肉付き線分を抽出する肉付き線分抽出工程と、抽出された複数の肉付き線分の各々について複数の特徴点を抽出する特徴点抽出工程とを含む。
出願番号 : 特許出願2000-123448 出願日 : 2000年4月25日
公開番号 : 特許公開2001-305104 公開日 : 2001年10月31日
出願人 : タイテック株式会社 発明者 : 西垣 功一 外3名
発明の名称 : ゲノムプロフィリング画像から特徴点を抽出する方法、並びに該方法で得られた特徴点群を用いた遺伝子型による種同定方法および類縁性同定方法
【課題】 遺伝子型による微生物の種の同定を定量的な手法で正確に且つ簡便に行うことを可能にするための中間的な処理方法として、ゲノムプロフィリング画像から特徴点を抽出する方法を提供する。
【解決手段】 生物の遺伝子を増幅し、増幅したDNAを電気泳動させて得られるゲル電気泳動物をゲノムプロフィリング画像として取り込む取込工程と、取り込んだゲノムプロフィリング画像を温度方向および移動度方向に沿ってそれぞれ規格化する規格化工程と、規格化されたゲノムプロフィリング画像の各バンドに対応して複数の肉付き線分を抽出する肉付き線分抽出工程と、抽出された複数の肉付き線分の各々について複数の特徴点を抽出する特徴点抽出工程とを含む。