出願番号 : 特許出願２００９－５１７０９９ 出願日 : ２００７年６月１５日
公表番号 : 特許公表２００９－５４０８４５ 公表日 : ２００９年１１月２６日
出願人 : ディーエスエム アイピー アセッツ ビー．ブイ． 発明者 : ルーボス， ヨハネス， アンドリアス 外１名
本発明は、所与の宿主細胞中での発現のためにタンパク質コード配列を最適化する方法に関する。本方法は、遺伝的アルゴリズムを当てはめて、所定のアミノ酸配列をコードする単一コドン適合および／またはコドンペア適合配列を最適化する。アルゴリズムでは、変異体コード配列が単一コドン適合および／またはコドンペア適合の最小値に達するまで、新しい配列変異体の生成および適合変異体の引き続く選択が反復される。本発明はまた、プロセッサーおよびメモリーを含んでなるコンピューターにも関し、プロセッサーはメモリーから読み取ってそれに書き込むように構成され、メモリーは単一コドン適合および／またはコドンペア適合の最適化のための遺伝的アルゴリズムを遂行する能力をプロセッサーに提供するように構成されたデータおよび命令を含んでなる。本発明はさらに、所定のアミノ酸配列のためのコード配列を含んでなる核酸と、このような核酸を含んでなる宿主細胞と、その中でこれらの宿主細胞が使用されるポリペプチドおよびその他の発酵産物を生成する方法とに関し、コード配列は本発明の方法において、特定の宿主のために単一コドン適合および／またはコドンペア適合について最適化される。 ekouhou 特許公開・明細書（全文）
