遺伝子型による生物の同定方法

出願番号 : 特許出願２０００－１２３７５５ 出願日 : ２０００年４月２５日
公開番号 : 特許公開２００１－２９９３９８ 公開日 : ２００１年１０月３０日
出願人 : タイテック株式会社 発明者 : 西垣 功一 外２名

発明の名称 : 遺伝子型による生物の同定方法

【課題】 ある程度簡便で現実に実行可能である、遺伝子型による微生物等の生物について、種や類似性等を同定する方法を提供すること。
【解決手段】 (1)同定対象である生物のゲノムの一部又は全部を鋳型としてランダムＰＣＲにより、１種又は２種以上の2本鎖ＤＮＡ断片を調製し、(2)(1)で調製した2本鎖ＤＮＡ断片を温度勾配ゲル電気泳動（ＴＧＧＥ）または変性剤濃度勾配ゲル電気泳動（ＤＧＧＥ）に付し、(3)(2)で得られた電気泳動パターンから各ＤＮＡ断片の同定ポイントを抽出し、(4)(3)で得られた同定ポイント群からＰａＳＳ及び/又はゲノム準距離を求め、(5)(4)で得られたＰａＳＳ及び/又はゲノム準距離に基づいて、微生物の同定を行う方法であって、ＴＧＧＥまたはＤＧＧＥによる電気泳動の際に、同定ポイントの基準点として、スタンダードＤＮＡを共存させ、スタンダードＤＮＡとの位置関係から同定ポイントの疑絶対位置を決定する方法。