ペイリス論文では、5′-GCCGGAGCTCTGCAGAATTCNNNNNN-3′ でRNAをｃDNAに逆転写した後、5′-GCCGGAGCTCTGCAGAATTC-3′をプライマーとして逆転写産生物を増幅しています。
この逆転写産生物反応液の中に、このプライマーと相同する配列をもっているDNAがあったら、それも増幅されることになるのではと思い、BLASTで遊んでみましたら、致死性の肺炎を起こすオウム病のゲノムの中に、３’末端から15個相同する配列を見つけました。
感染研のサイトに「オウム病はオウム病クラミジア（Chlamydia psittaci 以下C. psittaci）による人獣共通感染症」と書いてありました。
それから、肺炎クラミジアとも、３’末端が１０塩基相同である部分が見つかりました。
（↑逆方向だとどうなるのだろう。５’を検討すべきか）
３’末端が何塩基同じだったら増幅できるのでしょうか？
香港のｃDNA増幅物の中には、クラミジア由来の配列が含まれている可能性があり、この配列を使ってSARSのRT-PCRアッセイを作れば、クラミジア肺炎の患者さんがSARS患者として陽性になるわけですね。
「ぬるい仕事」ってこういうのでしょうか。
追記 その他、以下のような微生物が増幅する可能性があります。
国立医薬品食品衛生研究所が作ったプライマー交差性解析システム
Legionella nagasakiensis
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