2011年6月のブログ記事一覧-福井　学の低温研便り

初めまして。そして、お久しぶり。

2011-06-30 18:00:53 | 大学院時代をどう過ごすか

雪国出身者は口が重い。その上、人見知り。こうした性格とずうっとつきあい続けている私だが、外国人を前にすると余計に緊張してしまう。程度の差こそあれ、研究室の大学院生も同様なのかもしれない。

学会４日目。小休止で濃いめのコーヒーを頂いていると、イギリス人女性が向かいの席につく。すると、お気に入りのiPhoneを取り出し、英日翻訳アプリを起動させて、『初めまして。』と日本語音声が鳴り響く。オヨヨ。極度の外国人恐怖症が一気に氷解し、その方と会話が弾む。おまけに、甘～いチョコレートまで頂いた。

今回、旧知の友達に会うことができ、旧交を温める。なかには１６年ぶりの友も。研究上の問題点は世界共通で、「いやはやお互いに大変だよね」と愚痴をこぼし合う。それから、共通の友達の消息に関する情報交換。彼らもそれぞれの道を歩んでいる。

大学院生の皆さんには、海外で開催される国際学会に是非とも参加して欲しい。そこで、まだ公表されていない第一線の研究に触れながら、海外研究者と研究の議論などをして欲しい。きっと、今後の研究のプラスになるはず。

さあ、勇気を出して研究の紹介をしよう！　AさんもBさんも積極的に海外研究者と交流できたようで、何より。

とても刺激的で示唆に富む学会であった。さあ、札幌に帰ろう。

小さきものの大きな力

2011-06-29 16:09:08 | 大学院時代をどう過ごすか

ジュネーブは沸騰しそうな暑さ。蒸発し続ける体内水分。休憩の度に補給するミネラルウォーター。

２日目の基調講演は、マックスプランク海洋微生物学研究所のRudolf Amannさん。演題は下記の通り。

『Small microbes, Big oceans, and Global element cycling』

彼の講演はいつもエクセレント。今回のキーワードのひとつは、「FISH to -OMICS」。研究室の人たちには、その真意が良く理解できるはず。

夜１０時を過ぎても明るい。夏至を祝う懇親会『Midsummer’s Night Party』。暑くて、熱いが、時より吹く風はさわやか。

研究室メンバーのAさんもBさんも、初めての国際学会参加。極めて充実しているようだ。帰国後の参加報告書が楽しみ。

Something to pick me up

2011-06-27 05:55:41 | 大学院時代をどう過ごすか

仕事が立て込んでいて、旅立つ前夜はほぼ徹夜。なんとか、早朝発の成田便に搭乗。飛行中、爆睡してしまった。客室乗務員の方から、「随分とお疲れのようですね」と声をかけて頂く。ロンドンヒースロー空港経由でジュネーブ入り。直にてっぺんごえしそうな時刻に、ようやくホテル着。

翌日から、ヨーロッパ微生物学連合の国際会議（FEMS2011）に参加。私たちの研究室からは、AさんとBさんも。彼らはGCOEの「学会参加支援」を受けての参加のため、帰国後、GCOEのウェブページ公開用参加報告書を提出しなければならない。

具体的なことは書けないのだが、この学会ですこぶる刺激を受けている。「Something to pick me up」だ。

企業展示会では、ロッシュの卓上型次世代シーケンサーも紹介されている。いやはや。今、微生物生態学は熱い時代が到来している。ジュネーブもすこぶる暑い。外に出ると、クラっとする。寝不足の我が身には、ちと辛いが、この学会には我が身を奮い立たせるものがある。

夏至BBQ

2011-06-22 23:31:03 | 低温研のことごと

今日は夏至。午後２時、激しい雨が降り始める。今日はダメか？　いやいや、雨が止むのを祈ろう。

夕方、幸運にも雨が止む。さあ、毎年恒例生物環境部門バーベキューパーティーだ。小島さんが炭をおこす。

さあさあ、頂きましょう。

北海道名物チャンチャン焼きも。

笠原さんも熱弁を振るう。

飲みながら、そして、食べながら、研究に関する白熱議論。

お子様たちは、やっぱり、サッカーだよね。そして、日が暮れたら花火大会さ！

非常に盛り上がったBBQパーティーでしたね。幹事長の伊藤さん、そして、いろいろ準備をして頂いた院生の皆さんに感謝いたします。

大量データとどう向き合うか？

2011-06-21 16:33:50 | 学問

高林先生の情報によれば、イルミナのデスクトップ型次世代シーケンサーが誕生したとのこと。１７、８年前までは、トレーサーを使ったオートラジオグラフィーでX線フィルムに感光したバンドを注意深く読み取っていた。１つの微生物菌株の16S rRNAの配列を決定するのに１ヶ月は要していた。

それが、今では。研究室に１台次世代型シーケンサー、と言う時代が到来。MiSeqは、特にゲノムサイズの小さな生物種（バクテリアなど）に威力を発揮するようだ。

一方で、読まれた大量な塩基配列データをどのように処理したら良いのであろう？　そのことを真剣に考えなければならない時代とも言える。

さあ、一緒にゲノミクスの勉強を始めませんか？

無駄な情熱

2011-06-20 00:05:00 | 大学院時代をどう過ごすか

今月、生物環境部門恒例のバーベキューパーティーがある。打ち合わせを重ねながら、パーティーを成功させようとする院生たちの情熱は微笑ましい。

あれやこれやと趣向を凝らし、なにやら秘めた計画があるらしい。そんな彼らをみていると、若さとはいいもんだな、と無条件に思う。

私も若気の至りとか、赤面したくなるような数々の失敗を繰り返してきた。ドイツで研究生活を送っていた頃のこと。８月末にデンマークで缶詰会議があった。ちょうど中日、つまり、ハンプな日になって、夕方、ラボのみんなで近くの海岸へ海水浴に出かけことになった。水温１５℃。ヒェ～、冷たい。心臓マヒになりそう。

私たちの愚行をジッと観察していたRonald Atlas先生。「クレージーだねえ」と微笑みながら写真を撮ってくれた。微生物生態学の重鎮による貴重な写真である。

（デンマークの <style> &amp;amp;lt;!-- /* Font Definitions */ @font-face {font-family:&amp;amp;quot;ＭＳ明朝&amp;amp;quot;; panose-1:2 2 6 9 4 2 5 8 3 4; mso-font-charset:78; mso-generic-font-family:auto; mso-font-pitch:variable; mso-font-signature:1 0 16778247 0 131072 0;} @font-face {font-family:Century; panose-1:2 4 6 4 5 5 5 2 3 4; mso-font-charset:0; mso-generic-font-family:auto; mso-font-pitch:variable; mso-font-signature:3 0 0 0 1 0;} @font-face {font-family:&amp;amp;quot;\@ＭＳ明朝&amp;amp;quot;; panose-1:2 2 6 9 4 2 5 8 3 4; mso-font-charset:78; mso-generic-font-family:auto; mso-font-pitch:variable; mso-font-signature:1 0 16778247 0 131072 0;} @font-face {font-family:&amp;amp;quot;ヒラギノ角ゴ Pro W3&amp;amp;quot;; panose-1:2 11 3 0 0 0 0 0 0 0; mso-font-alt:&amp;amp;quot;ヒラギノ角ゴ Pro W3&amp;amp;quot;; mso-font-charset:78; mso-generic-font-family:auto; mso-font-pitch:variable; mso-font-signature:16777216 0 117702657 0 131072 0;} @font-face {font-family:&amp;amp;quot;\@ヒラギノ角ゴ Pro W3&amp;amp;quot;; panose-1:2 11 3 0 0 0 0 0 0 0; mso-font-charset:78; mso-generic-font-family:auto; mso-font-pitch:variable; mso-font-signature:1 0 16778247 0 131072 0;} /* Style Definitions */ p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal {mso-style-parent:&amp;amp;quot;&amp;amp;quot;; margin:0mm; margin-bottom:.0001pt; text-align:justify; text-justify:inter-ideograph; mso-pagination:none; font-size:12.0pt; font-family:&amp;amp;quot;Times New Roman&amp;amp;quot;; mso-ascii-font-family:Century; mso-ascii-theme-font:minor-latin; mso-fareast-font-family:&amp;amp;quot;ＭＳ明朝&amp;amp;quot;; mso-fareast-theme-font:minor-fareast; mso-hansi-font-family:Century; mso-hansi-theme-font:minor-latin; mso-bidi-font-family:&amp;amp;quot;Times New Roman&amp;amp;quot;; mso-bidi-theme-font:minor-bidi; mso-font-kerning:1.0pt;} /* Page Definitions */ @page {mso-page-border-surround-header:no; mso-page-border-surround-footer:no;} @page Section1 {size:612.0pt 792.0pt; margin:99.25pt 30.0mm 30.0mm 30.0mm; mso-header-margin:36.0pt; mso-footer-margin:36.0pt; mso-paper-source:0;} div.Section1 {page:Section1;} --&amp;amp;gt;</style>Helsingørにて。左から２番目が、ノースキャロライナ大学のAndreas Teske）

無駄な情熱は、美しい！

*****

いのちの根、そして志

2011-06-19 23:02:26 | 旅行記

小島さんと東京出張。用務先へ向かう途中、相田みつを美術館を発見。

「第４７回企画展」のポスターに少しだけ釘付け。

「いのちの根」

なみだをこらえて

かなしみにたえるとき

ぐちをいわずに

くるしみにたえるとき

いいわけをしないで

だまって批判にたえるとき

いかりをおさえて

じっと屈辱にたえるとき

あなたの眼のいろが

ふかくなり

いのちの根が

ふかくなる

　　　　　みつを

さて、思いがけず、かつての同僚AさんとBさんにお会いする（特に、Bさんの毒舌は相変わらずで、「福井さんの頭のハードディスクはまだ壊れていませんでしたね」と）。お二人とも、お元気の様子で、新たな研究の展開に情熱を燃やしておられる。我が身のことのように嬉しくなる。

札幌に赴任して、もうすぐ７年になる。北の地で研究と教育を始めるにあたり、心に決めたことがある。むしろ、志と言った方が良いかもしれぬ。その基盤づくりがようやくできた。これからが飛躍のフェーズである。

微生物生態学の根がふかくなり

あなたの眼のいろがふかくなる

　　　　　　　　まなぶ

大学院生募集

2011-06-17 22:21:36 | 教育

当研究室の教員（福井、笠原、小島）は、大学院の教育組織として、環境科学院に属しています。具体的には、生物圏科学専攻生態系生物学コースです。

入試に関する情報はこちらをご参照ください。

出願期間：７月１９日より７月２９日

試験日：８月２５、２６日

受験生の研究室見学は、大歓迎です。お気軽にご連絡ください。

せんちゅう

2011-06-10 10:43:02 | 旅行記

スタバ（スターバックスのこと）好きの研究員Aさんの話は面白い。関西方面に明るいと言うことで、大阪のライフセンターへの行き方を教えて頂きました。

「せんちゅうへは、伊丹空港からすぐですよ」とAさん。

生物学者にとって、「せんちゅう」と言えば、線虫のことで、瞬間に強烈なイメージが湧いてくる。Aさんの「せんちゅう」は、その線虫ではなく「千里中央駅（せんりちゅうおうえき）」のこと。今時の若い人たちが使うように、短縮した通称なのです。ところが、現地に赴いてみると、あちらこちらに「せんちゅう」という看板を見かけるのです。関西では、「せんちゅう」は定着しているようです。

大阪は蒸し暑いですね。汗が吹き出るように流れてきます。さてさて、「せんちゅう」の「スタバ」で「レイコ」（関西では、アイスコーヒーのこと）を飲んで、心身をクールダウンしましょうか。

公募案内：助教

2011-06-09 10:54:10 | 低温研のことごと

北海道大学低温科学研究所では、生物環境部門微生物生態学分野の助教を公募することになりました。

詳細は、こちらをご覧下さい。

異文化を知る旅

2011-06-05 21:37:59 | 日記・エッセイ・コラム

とある空港のとある場所にはカフェマシーンがある。ある朝、そこへ立ち寄り、カフェマシーンの前に立つ。迷わず、カプチーノのボタンを押し、ジュワッと突沸しそうなミルクが飛び出し、カップに注がれる。続いて、濃厚なコーヒーが泡立ったミルクの中に入る。

上唇の上にひげを生やしたようなミルクの泡を付けながら、一口すする。朝飯を抜いた胃に重く沈殿するかのうのようにカプチーノが入り込む。

１７年前、ドイツに住んでいた頃、日本語で書かれた情報誌『ドイツニュースダイジェスト』を愛読していた。なかでも、戸田光太郎のコラム「欧州の路上で」が楽しみだった。カプチーノについて、シャレたことを紹介していた。

以前ミラノの老舗出版社モンダドーリに務めるイタリア人と昼食をしたとき、「我が国で外食するには高級な『リストランテ』、家庭的な『トラットリア』、居酒屋『オステリア』があります」と英語のできるスタッフの説明を受けながら、そのトラットリアの中庭でヘヴィーな昼食を取った。で、食後に私が「カプチーノ」と知ったかぶりで注文したところ、テーブルを囲むイタリア人たちの目が一瞬（わかってないな）という風に変化した。案の定彼らは次々にエスプレッソを注文する。私のテーブル前に、大きなカップでたっぷりのクリームにシナモンの振られたカプチーノが登場した。

それをフーフー言いながら懸命に飲んでいるうち、デミタスカップのエスプレッソをアッという間に飲んでしまったイタリア人たちの好奇の視線が集中したので、私はカップを置いて言った。「わかりました。イタリアでは昼にカプチーノを飲まないんですね」

「そう」と英語のできる社員が説明した。「昼食後も夕食後も、エスプレッソ。カプチーノを飲むのは朝だけです」

それ以来、カプチーノを飲むのは朝だけと決めている。

それにしても、軽妙洒脱なコラムを書いてきた戸田光太郎氏は、今なにをしているのであろう？

（戸田光太郎「欧州の路上でー異文化を知る旅」アルク）

呑川（のみがわ）

2011-06-02 00:52:00 | 低温研のことごと

一昨日のエントリー「流行には乗らない」で書いた最後の一文。「さてと、立川へ行くか。でも、立川よりも呑川がいいな」

大学院生から、「あの一文はどんな意味なんですか？」と質問されました。そうですね、とても難解でしたね。

茅野春雄先生のご著書「昆虫の謎を追う」で、こんな文章を見つけました。1953年、茅野先生が25歳の頃のこと。

大学の近く、戦後間もなく建てたかという小さな家に住むことになった。ガスも水道もなかった。水は手押しの井戸から、炊事はプロパン、風呂は石炭。隣の家は山羊とニワトリを飼い、家の前は呑川という名の小川が流れ、その土手には桜の並木、魚がいたかどうかは覚えがないが、カワセミが時々やって来た。大学までは、緩い坂を歩けば十分たらず、そんな所がその小さな家の周辺だった。

そして、当時の研究室の人たちの溜まり場の「路地」が紹介されています。

（「路地」は）川にどぶ板を渡して建っていた。大学院生の津末玄夫君が見つけた飲み屋だ。その川の上流に我が家があった。それが呑川だ。さんざん安ウィスキーを飲み、天下国家を論じ、サイエンスを語り、時には殴り合い寸前もあった。むろん、私はいつもその仲裁役であった。夜風に吹かれて呑川の土手を歩けば我が家に辿り着いた。この「路地」は、それから実に二十年以上も私の交友の場となる。一体、ここで何人の良き友と飲み、語ったことか。

呑川は、東京の世田谷区深沢や目黒区八雲あたりを流れる二級河川。茅野先生宅付近の呑川は、すでに埋め立てられ、緑道となっています。いつだったか、飲み屋「路地」を探す旅に出かけたことがあります。くまなく歩き回ったのですが、残念ながら見つけることができませんでした。しかし、「ちもと」を発見。甘党の人には憧れの和菓子店です。栗蒸し羊羹がお勧めです。

春の呑川は、桜が咲き、散歩や花見にお勧めです。大学院生の皆さん、機会がありましたら、茅野先生がこよなく愛した呑川を訪れてみてはいかがでしょう。

聖橋（ひじりばし）

2011-06-01 19:00:10 | 旅行記

立川での会議を終え、夕方、羽田空港へ向かう。中央線の快速電車に乗り、東京経由で浜松町、そして羽田空港を目指す。

少々くたびれた頭を癒すために中野あたりからiPodにおさめている「私花集」を聴き始める。新宿駅を過ぎ、まもなくお茶の水駅といったところで、「檸檬＜レモン＞」に曲が変わる。

♫喰べかけの檸檬　聖橋から放る　　　　快速電車の赤い色がそれとすれ違う♫

電車の窓からは、向こうに聖橋が見えた。おお、何と言うタイミングの良さか。

８年くらい前だろうか。研究室にお茶の水女子大学出身の学生が院生として入った時、「檸檬＜レモン＞」の話題を彼女にしたことがある。湯島聖堂、聖橋、スクランブル交差点、青春の姥捨山などの言葉が出てくる歌なんだよ、と彼女に対して自慢げに説明しても、彼女の反応は冷ややかだったかな。ところが、翌日、彼女から一言、「うちのお母さんがその唄を良く知っていました！」。

今時の大学院生はどんな音楽を聴くのであろう？　今度教えてくださいな。　まさか、「ハートのエースが出てこない」じゃないよね。

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北海道大学 低温科学研究所 微生物生態学分野 大学院：環境科学院 生物圏科学専攻 分子生物学コース

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大学院：環境科学院　生物圏科学専攻　分子生物学コース