TSUBAME 2.0 と SDPA, SDPARA

東工大のスパコン TSUBAME 2.0 上で SDPA と SDPARA のバイナリ作成を行った。

例えば SDPA 7.4.0 は Intel Compiler を用いて以下のように configure & make することができる。

◯ SDPA 7.4.0

export SDPA_HOME=$(HOME)/sdpa7.intel
export INTEL_LIB=/usr/apps/isv/intel/11.1.072/mkl/lib/em64t
export INTEL_LIB2=/usr/apps/isv/intel/11.1.072/lib/intel64
export CC=icc
export CXX=icpc
export F77=ifort
export CFLAGS="-O2 -openmp -DDIMACS_PRINT"
export CXXFLAGS="-O2 -openmp -DDIMACS_PRINT"
export FFLAGS="-O2 -openmp -i8"
./configure --with-blas="-L${SDPA_HOME}/lib -lgoto2 -L${INTEL_LIB} -liomp5" --with-lapack="-L${SDPA_HOME}/lib -lgoto2 -L${INTEL_LIB} -lpthread -lgoto2 -lstdc++ -lifcore -limf -lifport"
make

SDPARA は OpenMPI でも MVAPICH でもどちらでも良いが、今回は MVAPICH2 を使用した。