Moonshot m710 と H2O 問題

Moonshot m710 で以下の SDP(H2O)問題を解いてみました。180コアで 14304秒ぐらいの実行時間です。

問題名 : H2O.1A1.DZ.pqgt1t2p.dat-s


参考
◯SGI UV2000
CPU : Intel(R) Xeon(R) CPU E5-4650 v2 @ 2.40GHz
メモリ 64TB 搭載

◯320 コア使用時
ELEMENTS : 25269.58秒
CHOLESKY : 3593.60秒
全体：31417.07秒


◯ HP ProLiant m710 サーバーカートリッジ (45カートリッジ)
プロセッサー Intel® Xeon® E3-1284L v3（1.8-3.2GHz/8コア/6MB/47W）
キャッシュメモリ 6MB共有Level 3
メモリ タイプ HP 32GB（4x8GB）PC3L-12800（DDR3-1600）SODIMM低電圧メモリ
ネットワークコントローラー Mellanox Connect-X3 Pro　デュアル10GbE NIC。RDMA over Converged Ethernet（RoCE）をサポート
最大内蔵ストレージ　(Moonshotサーバーあたり) M.2 2280ソリッドステートデバイス 480GB
OS : CentOS 7.2


SDPA start at [Tue May 17 15:54:07 2016]
param is ./param.sdpa
data is /home/fujisawa/data/H2O.1A1.DZ.pqgt1t2p.dat-s : sparse
out is out.H2O
NumNodes is set as 45
NumThreads is set as 4
Schur computation : DENSE
mu thetaP thetaD objP objD alphaP alphaD beta
0 1.0e+04 1.0e+00 1.0e+00 -0.00e+00 -3.68e+05 8.6e-01 1.0e+00 2.00e-01
1 2.0e+03 1.4e-01 8.9e-15 -1.62e+00 -5.54e+05 8.1e-01 8.1e-01 2.00e-01
2 5.3e+02 2.7e-02 1.0e-14 -2.54e+01 -7.10e+05 6.9e-01 6.9e-01 2.00e-01
3 2.2e+02 8.3e-03 1.2e-14 -2.43e+01 -8.09e+05 5.4e-01 1.1e+00 2.00e-01
4 1.2e+02 3.8e-03 1.7e-14 -2.30e+01 -7.38e+05 8.8e-01 1.8e+00 2.00e-01
5 2.5e+01 4.7e-04 2.9e-14 -2.15e+01 -3.23e+05 8.0e-01 1.1e+00 2.00e-01
6 3.7e+00 9.2e-05 2.4e-14 -2.14e+01 -5.27e+04 8.7e-01 1.0e+00 2.00e-01
7 6.3e-01 1.2e-05 6.7e-14 -2.22e+01 -9.40e+03 8.7e-01 1.0e+00 2.00e-01
8 1.2e-01 1.6e-06 6.4e-12 -2.73e+01 -1.78e+03 6.9e-01 8.9e-01 2.00e-01
9 3.5e-02 4.8e-07 7.6e-11 -4.47e+01 -5.64e+02 4.5e-01 7.7e-01 2.00e-01
10 1.5e-02 2.7e-07 4.9e-10 -5.85e+01 -2.69e+02 7.0e-01 5.1e-01 2.00e-01
11 8.2e-03 8.2e-08 9.9e-10 -7.14e+01 -1.94e+02 8.9e-01 8.2e-01 2.00e-01
12 2.7e-03 8.8e-09 1.3e-09 -7.78e+01 -1.20e+02 5.8e-01 7.5e-01 2.00e-01
13 1.1e-03 3.7e-09 4.7e-08 -7.98e+01 -9.71e+01 4.9e-01 5.1e-01 2.00e-01
14 6.7e-04 1.9e-09 2.3e-07 -8.14e+01 -9.17e+01 6.0e-01 3.9e-01 2.00e-01
15 4.2e-04 7.7e-10 7.7e-07 -8.28e+01 -8.94e+01 7.2e-01 3.3e-01 2.00e-01
16 2.7e-04 2.1e-10 3.1e-07 -8.39e+01 -8.81e+01 6.8e-01 4.5e-01 2.00e-01
17 1.6e-04 2.1e-10 3.9e-06 -8.45e+01 -8.70e+01 6.7e-01 4.0e-01 2.00e-01
18 1.0e-04 2.1e-10 3.3e-06 -8.48e+01 -8.64e+01 6.7e-01 3.4e-01 2.00e-01
19 6.6e-05 2.1e-10 2.5e-06 -8.50e+01 -8.61e+01 6.9e-01 3.1e-01 2.00e-01
20 4.5e-05 2.1e-10 1.6e-06 -8.52e+01 -8.59e+01 7.7e-01 3.1e-01 2.00e-01
21 3.1e-05 2.1e-10 1.3e-06 -8.52e+01 -8.57e+01 7.3e-01 4.3e-01 2.00e-01
22 1.9e-05 2.1e-10 7.6e-07 -8.53e+01 -8.56e+01 7.2e-01 3.8e-01 2.00e-01
23 1.3e-05 2.1e-10 4.2e-07 -8.53e+01 -8.55e+01 8.1e-01 3.5e-01 2.00e-01
24 8.5e-06 2.1e-10 2.6e-07 -8.53e+01 -8.55e+01 7.1e-01 4.8e-01 2.00e-01
25 5.1e-06 2.1e-10 1.2e-07 -8.53e+01 -8.54e+01 6.2e-01 3.9e-01 2.00e-01
26 3.4e-06 2.1e-10 8.3e-08 -8.53e+01 -8.54e+01 6.8e-01 3.4e-01 2.00e-01
27 2.4e-06 2.1e-10 5.4e-08 -8.53e+01 -8.54e+01 7.5e-01 4.5e-01 2.00e-01
28 1.5e-06 2.1e-10 3.0e-08 -8.53e+01 -8.54e+01 7.8e-01 4.2e-01 2.00e-01
29 9.6e-07 2.1e-10 1.8e-08 -8.53e+01 -8.54e+01 7.9e-01 6.1e-01 2.00e-01
30 4.9e-07 2.1e-10 6.8e-09 -8.53e+01 -8.54e+01 7.2e-01 4.9e-01 2.00e-01
31 2.9e-07 2.1e-10 3.5e-09 -8.53e+01 -8.53e+01 8.3e-01 5.3e-01 2.00e-01
32 1.7e-07 2.1e-10 1.6e-09 -8.53e+01 -8.53e+01 8.2e-01 5.8e-01 2.00e-01
33 9.0e-08 2.1e-10 7.0e-10 -8.53e+01 -8.53e+01 9.4e-01 7.3e-01 2.00e-01
34 3.7e-08 2.1e-10 1.9e-10 -8.53e+01 -8.53e+01 8.3e-01 7.3e-01 2.00e-01
35 1.5e-08 2.1e-10 5.2e-11 -8.53e+01 -8.53e+01 8.2e-01 7.4e-01 2.00e-01
36 6.1e-09 2.1e-10 1.3e-11 -8.53e+01 -8.53e+01 8.9e-01 8.0e-01 1.00e-01
37 1.7e-09 2.1e-10 2.5e-12 -8.53e+01 -8.53e+01 8.0e-01 7.7e-01 1.00e-01
38 5.2e-10 2.1e-10 7.7e-13 -8.53e+01 -8.53e+01 8.0e-01 7.7e-01 1.00e-01

phase.value = pdOPT
Iteration = 38
mu = +5.1893852558402975e-10
relative gap = +1.6651098299132361e-16
gap = +1.4210854715202004e-14
digits = +1.5778557115339556e+01
objValPrimal = -8.5344849089879474e+01
objValDual = -8.5344849089879489e+01
p.feas.error = +3.1172520315383907e-08
d.feas.error = +2.2496564611174108e-09
total time = 14055.847863
main loop time = 14048.877913
total time = 14055.847863
file check time = 0.000000
file change time = 0.004326
file read time = 6.965624
SDPA end at [Tue May 17 19:52:32 2016]
ALL TIME = 14304.279338