最適化問題に対する超高速&安定計算

大規模最適化問題、グラフ探索、機械学習やデジタルツインなどの研究のお話が中心

新クラスタ計算機との性能比較

2010年12月28日 02時02分54秒 | Weblog
今は停電中なので全サーバが停止しているが、以前行った数値実験の結果を用いて他の計算サーバとの性能比較を行う。

○問題1: esc32a_r2.dat-s (QAP に対する DNN 緩和問題)
○計算サーバ
実行時間 : 128989.8秒 = 35.8時間
SCM の作成 : 6870.4秒 : 5.3%
SCM のCholesky 分解 : 119750.7秒 : 92.8%
○新クラスタ計算機
実行時間 : 13994.3秒 = 3.8時間
SCM の作成 : 162.1秒 : 1.1%
SCM のCholesky 分解 : 13496.4秒 : 96.4%

○問題2: (量子化学に対するSDP緩和問題)
○SDPAクラスタ計算機
実行時間 : 49037.9秒 = 13.6時間
SCM の作成 : 46730.8秒 : 95.3%
SCM のCholesky 分解 : 617.0秒 : 1.2%
○新クラスタ計算機
実行時間 : 32379.1秒 = 8.99時間
SCM の作成 : 30735.4秒 : 94.9%
SCM のCholesky 分解 : 390.6秒 : 1.2%

○新クラスタ計算機
1:PowerEdge M1000e(ブレードエンクロージャー) x 1台
2:PowerEdge M710HD(ブレードサーバ) x 16台
ブレードサーバの仕様:
CPU : インテル(R) Xeon(R) プロセッサー X5670(2.93GHz、12MB キャッシュ、6.4 GT/s QPI) x 2個
メモリ: 128GB (16X8GB/2R/1333MHz/DDR3 RDIMM/CPUx2)
Disk : 73GB x 2(1台のみ 300GB x 2)
NIC : GbE x 1 & Inifiniband QDR(40Gbps) x 1
OS : CentOS 5.5 for x86_64



○計算サーバ (4 CPU x 6 コア = 24 コア)
CPU : AMD Opteron 8439 (2.80GHz / 6MB L3) x 4
Memory : 128GB (32 x 4GB / 800MHz)
OS : Fedora 14 for x86_64

○ SDPA クラスタ
16 Nodes, 32 CPUs, 128 CPU cores;
CPU : Intel Xeon 5460 3.16GHz (quad cores) x 2 / node
Memory : 48GB / node
Disk : 6TB(RAID 5)
NIC : GbE x 2 and Myrinet-10G x 1 / node
OS : CentOS 5.5 for x86_64

コメント
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