BlendedICUデータセットの紹介

昨年末、ダウンロードしたけど読んでいない文献が200を超えてしまい、年末年始で読むぞー、と頑張ったけど15くらい残ってしまった。この連休でその残りを読んでいたら、その中にヤバイやつがあったのに気がついた。

Oliver M, Allyn J, Carencotte R, et al.
Introducing the BlendedICU dataset, the first harmonized, international intensive care dataset.
J Biomed Inform. 2023 Oct;146:104502. PMID: 37769828.

AmsterdamUMCdb, eICU, HiRID, and MIMIC-IVをまとめて、30万例以上、158項目のデータベースを作成。しかも、4つのデータベースと同様、登録すれば誰でも利用できるようになっている。それだけじゃなくて、生データとは別に、1時間ごとに集約してmissing valueもimputationして、異常なデータを除いた、つまりはクリーニングの終了しているデータも提供されるらしい。
ただし、４つのデータベース全てに登録してデータを取得し、かつpythonのコードを自分で動かさないといけないので、ハードルはちょっと高いけれど。

Githubはこちら。
頑張ってみようと思う人は是非。
利用者が増えれば作成者もバージョンアップしてくれるだろうし。


タイトル：Introducing the BlendedICU dataset, the first harmonized, international intensive care dataset
ちょっとカッコいい。でも相変わらず英語のスペルは苦手なChatさん。

ちなみに、このデータベース、ICUでよく使う113の薬剤がリストアップされているのだけど、そのうちオピオイドは、fentanyl, morphine, hydromorphone, sufentanilで、remifentanilはありません。