新年あけましておめでとう御座います
今年も本ブログよろしくお願いします
今度の臨床微生物学会で、ワークショップの感染症症例ツアーをお手伝いすることになりました。細菌検査提出までの臨床の流れと、培地でのコロニー所見など微生物所見、技師より臨床側への情報提供、抗菌薬選択、といった流れについて議論していくものです。私の担当はエルシニアということで文献を調べました。 今回は微生物学的なことについて、次回は臨床的事項について。
細菌特性
・Y.enterocoliticaによるヒト感染はまずSchleifsteinとColemanで報告(1939）そのとき細菌は、Bacterium enterocoliticum呼ばれた。1963年にPasteurella Xに改名（DanielsとGoudzwaard）。1964年にエルシニア属に編入（Frederiksen、1964）。
・エルシニアは、多くの場合、創傷、糞便、痰、および腸間膜リンパ節を含む臨床検体から単離される小棒状、グラム陰性球桿菌
・正常ヒト細菌叢の一部ではない
・増殖は、培地上で好気性および嫌気性培養条件下で 25～28 ℃で最適、0℃-45℃の間の増殖可
・冷蔵庫内温度でも発育可能。この点でサルモネラや大腸菌などの他の腸内細菌科に属している菌とは異なる
・分離培地 にはSS寒天、マッコンキー寒天、CIN 寒天などを用いる。また、菌数の少ない材料では、リン酸緩衝液を用いた低温増菌法を併用することが望まれる。
・エルシニア選択寒天として知られているCIN寒天（セフスロジン、イルガサン、ノボビオシン）上の成長にて鑑別。 37℃で24時間で培養し、コロニー同定はマクロスコープの特徴に応じて。
・特徴的な半透明でシャープな縁取りのコロニーは、マンニトール発酵による深赤色の中央を示し、これは通常 ”雄牛の目bull's eyes”のコロニーと呼ばれ識別できる。
・Y.enterocoliticaはより遅い乳糖発酵と、通常存在する他の腸の細菌種と比較してより遅い成育をする。そのためマッコンキープレート上で増殖した(直径の小さい)ピンポイントで無色コロニーは、より急速に増殖する細菌を背景に識別困難となる。
・同定を裏付ける具体的な生化学的特性： 37℃での運動性である（25℃ではない）、ウレアーゼを産生する、オキシダーゼ活性がない、そしてKliglerの鉄寒天上でガスや硫化水素のいずれも生成しない。
分類
・ヒトに対する病原性の三つの主要エルシニア種は、Y.pestis, Y.pseudotuberculosis, Y.enterocolitica
・加えてエルシニア属は現在、17種が含まれている（ Euze'by,1997 ; Murros-Kontiainenら,2011A,B）
・Y.enterocoliticaは血清型と一緒に生化学的特性を用いて分類。指定された6つの主要なバイオタイプがあり、 1A（非病原型）と、 病原性型のIB、2,3,4、5がある
・Y.enterocoliticaバイオタイプIB （主に血清型O：8が臨床現場に関連）が 高病原性として知られており、通常、ほとんどの致命的なイベントを発生する。
・生物型IB株がPYVと表記病原性プラスミド、および十分に特徴付けられたいくつかの染色体にコードされた病原性決定因子を運ぶ
・血清群0:3と0:9（それぞれ、生物型4および2に属する）は 世界的にエルシニア感染症の最も一般的な原因であまり破壊的ではない
・Y.enterocoliticaおよび関連種は、それらの熱安定性の体細胞抗原に基づく血清学的グループに分離することができる。現在、血清型O:l, 2, 3; O:2,3; O:3; O:8; O:9; O:4,32; 0:5,27; O:13a,13b; 0:18; O:20; and O:21に属する病原性株は確認
・人の病気に支配的なバイオ血清型は、4/O：3、1B/O：8、2/O：9、および 2/0：5,27 が含まれる
・多くの欧州諸国の中で最も重要なY.enterocoliticaは、血清群0:3で続いて 0:9。一方、血清群0:8は主に米国で検出。
・日本では、起因菌のほとんどが血清型O:3、生物型4であることが特徴である。しかし、1980 年代を境に、散発事例から分離される血清型O:3菌の生物型は3 に移行している。また、1987 年以降青森県を中心に東北地方各地で、病原性が強いとされる血清型O8、生物型1の菌株による散発事例が多く報告されている
疫学
・過去10年間で80～150症例がノルウェーで毎年記録された （Grahekら、2007）
・1996年から2007年の間に1,903件の食中毒例は米国の７州からFoodNetサーベイランスプログラムを介して報告された。これは、0.55 cases/100,000人年の粗発生率を表す
・Y.enterocolitica感染の主な経路は、汚染された食物や水を介して。
・これまでの動物における保菌実態から、ブタ、イヌ、ネコ、ネズミが最も重要である。
・ブタは人の病原性株の主要なリザーバー
・イギリスの病原性エルシニアの有病率に関する2年間の研究では、 Y.enterocoliticaのためのブタの630のうち278が陽性（44％）であるのを発見
・スイスの食肉処理場で研究で、リアルタイムPCRを用いた病原性Y.enterocolitica検査で豚扁桃の212のうち148が陽性（ 70％ ）であることを発見し、最も一般的なbioserotypeは4/O:3
・Y.enterocolitkaとY.pseudotuberculosisは、豚、鳥、ビーバー、ネコ、及びイヌから分離（Murphyら、2010）
・Y.enterocolitkaはまた、肉料理、アイスクリーム、牛乳などの食料源と一緒に、池や湖などの環境源から、検出 （グリーンウッドら、1990; FDA、2005）
・いくつかの特定の食品は、米国におけるエルシニアベースの発生にリンクされている。これらは、チョコレートミルク（Blackら、1978）、粉ミルク（Shayeganiら、1983）、低温殺菌牛乳（Tacketら、1984）、豆腐、湧水汚染（Tacketら、1985）を含む、様々な食品。
・肉から（豚肉、牛肉、子羊を含む）培養だけでなく、カキ、魚、生乳、チーズ （Reaら、1992; Daviesら、2001; Fredriksson-Ahomaaら、2004）
・英国の研究のみで、魚が30の7（23％）で、陽性サンプルが得られたが見つかり隔離する。 分離株のうち4つは、サケ由来で、 そして3つはマスから。
・バイオタイプ1AのY.enterocolitkaは多くの国で生乳raw milkから培養される。
・低温殺菌牛乳の汚染の原因は、障害を有する処理ではなく、株の耐熱性。
・Grahek -オグデンら（ 2007 ）は、1つのアウトブレイクにて、クリスマスに消費される伝統的な食べ物で、 ブラウンbrawnとして知られている即席加工食品ready-to-eatの豚肉製品から、11個人がY.enterocolitica に感染していたとのハイライト報告がある
・高い脂肪含有量のため、 ラードは、細菌の生存を増強することができる。
・最近では1997 年に、徳島県の病院や学校の寮で患者数66 名の発生があった。
参考文献
・Foodborne Pathog Dis. 2012 Mar;9(3):179-89.
Yersinia enterocolitica: a brief review of the issues relating to the zoonotic pathogen, public health challenges, and the pork production chain.
・Enferm Infecc Microbiol Clin. 2012 Jan;30(1):24-32.
Yersinia enterocolitica: pathogenesis, virulence and antimicrobial resistance.
・J Antimicrob Chemother. 2004 Jun;53(6):1068-71. Epub 2004 Apr 29.
Characterization of the molecular mechanisms of quinolone resistance in Yersinia enterocolitica O:3 clinical isolates.
・J Med Microbiol. 1996 Oct;45(4):302-9.
Clinical features and antibiotic treatment of septic arthritis and osteomyelitis due to Yersiniaenterocolitica.
今年も本ブログよろしくお願いします
今度の臨床微生物学会で、ワークショップの感染症症例ツアーをお手伝いすることになりました。細菌検査提出までの臨床の流れと、培地でのコロニー所見など微生物所見、技師より臨床側への情報提供、抗菌薬選択、といった流れについて議論していくものです。私の担当はエルシニアということで文献を調べました。 今回は微生物学的なことについて、次回は臨床的事項について。
細菌特性
・Y.enterocoliticaによるヒト感染はまずSchleifsteinとColemanで報告(1939）そのとき細菌は、Bacterium enterocoliticum呼ばれた。1963年にPasteurella Xに改名（DanielsとGoudzwaard）。1964年にエルシニア属に編入（Frederiksen、1964）。
・エルシニアは、多くの場合、創傷、糞便、痰、および腸間膜リンパ節を含む臨床検体から単離される小棒状、グラム陰性球桿菌
・正常ヒト細菌叢の一部ではない
・増殖は、培地上で好気性および嫌気性培養条件下で 25～28 ℃で最適、0℃-45℃の間の増殖可
・冷蔵庫内温度でも発育可能。この点でサルモネラや大腸菌などの他の腸内細菌科に属している菌とは異なる
・分離培地 にはSS寒天、マッコンキー寒天、CIN 寒天などを用いる。また、菌数の少ない材料では、リン酸緩衝液を用いた低温増菌法を併用することが望まれる。
・エルシニア選択寒天として知られているCIN寒天（セフスロジン、イルガサン、ノボビオシン）上の成長にて鑑別。 37℃で24時間で培養し、コロニー同定はマクロスコープの特徴に応じて。
・特徴的な半透明でシャープな縁取りのコロニーは、マンニトール発酵による深赤色の中央を示し、これは通常 ”雄牛の目bull's eyes”のコロニーと呼ばれ識別できる。
・Y.enterocoliticaはより遅い乳糖発酵と、通常存在する他の腸の細菌種と比較してより遅い成育をする。そのためマッコンキープレート上で増殖した(直径の小さい)ピンポイントで無色コロニーは、より急速に増殖する細菌を背景に識別困難となる。
・同定を裏付ける具体的な生化学的特性： 37℃での運動性である（25℃ではない）、ウレアーゼを産生する、オキシダーゼ活性がない、そしてKliglerの鉄寒天上でガスや硫化水素のいずれも生成しない。
分類
・ヒトに対する病原性の三つの主要エルシニア種は、Y.pestis, Y.pseudotuberculosis, Y.enterocolitica
・加えてエルシニア属は現在、17種が含まれている（ Euze'by,1997 ; Murros-Kontiainenら,2011A,B）
・Y.enterocoliticaは血清型と一緒に生化学的特性を用いて分類。指定された6つの主要なバイオタイプがあり、 1A（非病原型）と、 病原性型のIB、2,3,4、5がある
・Y.enterocoliticaバイオタイプIB （主に血清型O：8が臨床現場に関連）が 高病原性として知られており、通常、ほとんどの致命的なイベントを発生する。
・生物型IB株がPYVと表記病原性プラスミド、および十分に特徴付けられたいくつかの染色体にコードされた病原性決定因子を運ぶ
・血清群0:3と0:9（それぞれ、生物型4および2に属する）は 世界的にエルシニア感染症の最も一般的な原因であまり破壊的ではない
・Y.enterocoliticaおよび関連種は、それらの熱安定性の体細胞抗原に基づく血清学的グループに分離することができる。現在、血清型O:l, 2, 3; O:2,3; O:3; O:8; O:9; O:4,32; 0:5,27; O:13a,13b; 0:18; O:20; and O:21に属する病原性株は確認
・人の病気に支配的なバイオ血清型は、4/O：3、1B/O：8、2/O：9、および 2/0：5,27 が含まれる
・多くの欧州諸国の中で最も重要なY.enterocoliticaは、血清群0:3で続いて 0:9。一方、血清群0:8は主に米国で検出。
・日本では、起因菌のほとんどが血清型O:3、生物型4であることが特徴である。しかし、1980 年代を境に、散発事例から分離される血清型O:3菌の生物型は3 に移行している。また、1987 年以降青森県を中心に東北地方各地で、病原性が強いとされる血清型O8、生物型1の菌株による散発事例が多く報告されている
疫学
・過去10年間で80～150症例がノルウェーで毎年記録された （Grahekら、2007）
・1996年から2007年の間に1,903件の食中毒例は米国の７州からFoodNetサーベイランスプログラムを介して報告された。これは、0.55 cases/100,000人年の粗発生率を表す
・Y.enterocolitica感染の主な経路は、汚染された食物や水を介して。
・これまでの動物における保菌実態から、ブタ、イヌ、ネコ、ネズミが最も重要である。
・ブタは人の病原性株の主要なリザーバー
・イギリスの病原性エルシニアの有病率に関する2年間の研究では、 Y.enterocoliticaのためのブタの630のうち278が陽性（44％）であるのを発見
・スイスの食肉処理場で研究で、リアルタイムPCRを用いた病原性Y.enterocolitica検査で豚扁桃の212のうち148が陽性（ 70％ ）であることを発見し、最も一般的なbioserotypeは4/O:3
・Y.enterocolitkaとY.pseudotuberculosisは、豚、鳥、ビーバー、ネコ、及びイヌから分離（Murphyら、2010）
・Y.enterocolitkaはまた、肉料理、アイスクリーム、牛乳などの食料源と一緒に、池や湖などの環境源から、検出 （グリーンウッドら、1990; FDA、2005）
・いくつかの特定の食品は、米国におけるエルシニアベースの発生にリンクされている。これらは、チョコレートミルク（Blackら、1978）、粉ミルク（Shayeganiら、1983）、低温殺菌牛乳（Tacketら、1984）、豆腐、湧水汚染（Tacketら、1985）を含む、様々な食品。
・肉から（豚肉、牛肉、子羊を含む）培養だけでなく、カキ、魚、生乳、チーズ （Reaら、1992; Daviesら、2001; Fredriksson-Ahomaaら、2004）
・英国の研究のみで、魚が30の7（23％）で、陽性サンプルが得られたが見つかり隔離する。 分離株のうち4つは、サケ由来で、 そして3つはマスから。
・バイオタイプ1AのY.enterocolitkaは多くの国で生乳raw milkから培養される。
・低温殺菌牛乳の汚染の原因は、障害を有する処理ではなく、株の耐熱性。
・Grahek -オグデンら（ 2007 ）は、1つのアウトブレイクにて、クリスマスに消費される伝統的な食べ物で、 ブラウンbrawnとして知られている即席加工食品ready-to-eatの豚肉製品から、11個人がY.enterocolitica に感染していたとのハイライト報告がある
・高い脂肪含有量のため、 ラードは、細菌の生存を増強することができる。
・最近では1997 年に、徳島県の病院や学校の寮で患者数66 名の発生があった。
参考文献
・Foodborne Pathog Dis. 2012 Mar;9(3):179-89.
Yersinia enterocolitica: a brief review of the issues relating to the zoonotic pathogen, public health challenges, and the pork production chain.
・Enferm Infecc Microbiol Clin. 2012 Jan;30(1):24-32.
Yersinia enterocolitica: pathogenesis, virulence and antimicrobial resistance.
・J Antimicrob Chemother. 2004 Jun;53(6):1068-71. Epub 2004 Apr 29.
Characterization of the molecular mechanisms of quinolone resistance in Yersinia enterocolitica O:3 clinical isolates.
・J Med Microbiol. 1996 Oct;45(4):302-9.
Clinical features and antibiotic treatment of septic arthritis and osteomyelitis due to Yersiniaenterocolitica.
