イメージング覚書006：ImageJ で等高線表示をするには？

このサイトにもあるように、ImageJで等高線表示（Contour plot）をするには、

１）Image->Adjust->Threshold
２）Plugins->Contour->Yawi2D
３）Plugins->Contour->Contour Plotter
４）Plugins->Contour->IsoPhotContour

の４つの方法があるらしいが、一番有名なものはContour Plotterというもの。

このインストールは非常に簡単で、ソースのJarファイルをダウンロードして、ImageJのフォルダの中にあるPluginsフォルダにいれ、ImageJを立ち上げなおすと、Pluginツールバーの中にContour Plotterメニューがでてくる。

これは手軽に等高線表示できるのだが、問題はその画像をどうやってもセーブできないこと。

セーブするには、IsoPhotContour（グレースケール）もしくはIsoPhotContour２（マルチカラー）というPluginsを使うと便利である。

ダウンロードはG.Landiniさんのサイトから行う。例えばIsoPhotContour２はこのZIPファイルをダウンロード、解凍して中身をImageJのフォルダの中にあるPluginsフォルダに入れるとインストールができる。

ちなみに以前使った徳島大学のオープンキャンパスのサンプルCT画像を等高線表示し見ると、

（元画像）


（等高線のオーバーレイ）


　となる。あまりわかりよい図でないので恐縮ですが。。
お試しあれ。