・朝飯前の論文読み．Hufford and Mazer 2003で気になったハワイの固有植物，silverswordの緑化に関するものである．Hufford and Mazer 2003の総説では，緑化に用いる時の母樹数が少ないと，将来的に近交弱勢が問題になろう・・・という文脈で使われていた．その総説によれば，ハワイ島で緑化された導入集団は，2か3の創始者（母樹）だった，と読んだのだが，原著を読んで確認．
・イントロの中で，ハワイ島マウナケア火山のSilversowrdは，50個体を下回るくらいに個体数が減少し，（緑化目的の）導入に際しても深刻なボトルネックを受けた，とある．1973年の導入プログラムは，3個体から種子を採種したが，1個体は上手く苗が作れず，結局，なんとたった2個体が創始者になっているとある．この植物は多年生草本なのだが，虫媒で自家不和合性を示すらしく，1個体が結実しなかったのは，ポリネータが飛んで来れないほど孤立していたからかもしれない，などと．
・ところで，Hufford and Mazerの総説を読んだときには，導入集団の遺伝解析を雄行い，例えばStructureのような統計手法を用いて（よく考えたら，2000年ではまだ世に出ていないね）創始者数の推定を行った，というような内容なのかと想像したのだが，最初から創始者数が完全に分かっていたのであった．やはり，原著を読まないと，とんでもない誤解をしてしまうことがあるもんだ．
・さてさて，この論文ではマウイ島のHaleakale火山に自生する亜種（こちらはたくさん個体があるらしい），ハワイ島マウナケア火山の自生集団（極端に個体数が減少している）と導入集団の3集団（母樹2個体の子供たち）を対象に，マイクロサテライトマーカーを用いて遺伝的多様性を調べている．既に，RAPDマーカーでの報告があるので，追認している感じである．マテメソの材料で，個体数などが記載されておらず，以前の論文を読め，などとなっていて，どうにも分かりにくい．
・マイクロサテライトは8座を使っているのだが，アレル数は2-5と多型性は低い．さらに結果はAo, Ae, He, Hoくらいしか記載されておらず，Heで見るとマウイ島の亜種（大きな個体群サイズ）が0.287，ハワイ島の自生集団が0.250，導入集団が0.074となっている．思ったよりも，ハワイ島の自生集団が遺伝的多様性が下がっていないが，結果自体は想定の範囲内である．
・さてここからどうなる？と思っていたら，結果はもう終わりである．Discussionも特に目新しいものがなく，「なんでこんな論文がMol Ecolに掲載されているんだ（俺の論文を2度もリジェクトしながら・・・）！」と叫びたくなってしまう．しっかし，これだけの材料を持ちながら，この解析はひどいね．せっかくの超高級食材を，めちゃくちゃにまずく作った感じ．せめて，導入集団の個体サイズとか生存状況くらいはデータとして示して欲しかった．あるいは，同じマイクロサテライトのデータでも，なんかできることがあるだろう（いくら2000年といえど・・・）．
・ということで，今回はあまり参考になりません．導入集団のボトルネックの影響について読むならば，Williams 2001 Ecol Appl, 11, 1427-1488の方が面白そうなのでそのうちに・・・．ただ，Silverswordは一度見てみたい憧れの植物になった．あー，ハワイに行きたい．
・昼前に，近所のお祭りに行く．と，やたらと知り合いに会ってしまう．さすがに，7年目ともなると地元民という感じ．とあるコーナーに，盲導犬にさわれるところが・・・．我が家は全員，超犬好きなのだが，ゴールデンレトリバーでPR犬のフーちゃんはおとなしく，触っているこっちが癒される．
・北海道盲導犬協会のPRということなんだが，この協会はTVの「動物奇想天外」でもよく紹介されている．PR誌を読むと，盲導犬を引退した老犬や，逆に盲導犬になる前の1年間だけ育てるボランティア募集などとある．アパートじゃなければ飼いたいところなんだけど，どちらにしてもちょっと切ない場面がありそうです．
・しばらくフーちゃんに遊んでもらったのち，キーフォルダーを購入．早速，キーチェーンとして使用することにする．
・イントロの中で，ハワイ島マウナケア火山のSilversowrdは，50個体を下回るくらいに個体数が減少し，（緑化目的の）導入に際しても深刻なボトルネックを受けた，とある．1973年の導入プログラムは，3個体から種子を採種したが，1個体は上手く苗が作れず，結局，なんとたった2個体が創始者になっているとある．この植物は多年生草本なのだが，虫媒で自家不和合性を示すらしく，1個体が結実しなかったのは，ポリネータが飛んで来れないほど孤立していたからかもしれない，などと．
・ところで，Hufford and Mazerの総説を読んだときには，導入集団の遺伝解析を雄行い，例えばStructureのような統計手法を用いて（よく考えたら，2000年ではまだ世に出ていないね）創始者数の推定を行った，というような内容なのかと想像したのだが，最初から創始者数が完全に分かっていたのであった．やはり，原著を読まないと，とんでもない誤解をしてしまうことがあるもんだ．
・さてさて，この論文ではマウイ島のHaleakale火山に自生する亜種（こちらはたくさん個体があるらしい），ハワイ島マウナケア火山の自生集団（極端に個体数が減少している）と導入集団の3集団（母樹2個体の子供たち）を対象に，マイクロサテライトマーカーを用いて遺伝的多様性を調べている．既に，RAPDマーカーでの報告があるので，追認している感じである．マテメソの材料で，個体数などが記載されておらず，以前の論文を読め，などとなっていて，どうにも分かりにくい．
・マイクロサテライトは8座を使っているのだが，アレル数は2-5と多型性は低い．さらに結果はAo, Ae, He, Hoくらいしか記載されておらず，Heで見るとマウイ島の亜種（大きな個体群サイズ）が0.287，ハワイ島の自生集団が0.250，導入集団が0.074となっている．思ったよりも，ハワイ島の自生集団が遺伝的多様性が下がっていないが，結果自体は想定の範囲内である．
・さてここからどうなる？と思っていたら，結果はもう終わりである．Discussionも特に目新しいものがなく，「なんでこんな論文がMol Ecolに掲載されているんだ（俺の論文を2度もリジェクトしながら・・・）！」と叫びたくなってしまう．しっかし，これだけの材料を持ちながら，この解析はひどいね．せっかくの超高級食材を，めちゃくちゃにまずく作った感じ．せめて，導入集団の個体サイズとか生存状況くらいはデータとして示して欲しかった．あるいは，同じマイクロサテライトのデータでも，なんかできることがあるだろう（いくら2000年といえど・・・）．
・ということで，今回はあまり参考になりません．導入集団のボトルネックの影響について読むならば，Williams 2001 Ecol Appl, 11, 1427-1488の方が面白そうなのでそのうちに・・・．ただ，Silverswordは一度見てみたい憧れの植物になった．あー，ハワイに行きたい．
・昼前に，近所のお祭りに行く．と，やたらと知り合いに会ってしまう．さすがに，7年目ともなると地元民という感じ．とあるコーナーに，盲導犬にさわれるところが・・・．我が家は全員，超犬好きなのだが，ゴールデンレトリバーでPR犬のフーちゃんはおとなしく，触っているこっちが癒される．
・北海道盲導犬協会のPRということなんだが，この協会はTVの「動物奇想天外」でもよく紹介されている．PR誌を読むと，盲導犬を引退した老犬や，逆に盲導犬になる前の1年間だけ育てるボランティア募集などとある．アパートじゃなければ飼いたいところなんだけど，どちらにしてもちょっと切ない場面がありそうです．
・しばらくフーちゃんに遊んでもらったのち，キーフォルダーを購入．早速，キーチェーンとして使用することにする．