goo blog サービス終了のお知らせ 

goto_note

西東京市・北海道富良野の森林を舞台にした遺伝,育種,生態などに関する研究ノートの一部を紹介します

樹冠から

2009-02-28 | フィールドから
・高所作業車をレンタルして枯れ枝処理。今回は鉄道架線専用車ということで、バケットが通常よりも3倍くらい大きい。ということで二人で乗っても悠々である。クスノキは思ったよりも枝がぼろっと折れる。それにしてもクスノキの樹冠というのは、お互いに重ならないようにうまく配置されている。



・懸案となっていた見学路上の枯れ枝を取る。と、ヤブツバキの花にメジロが訪れているのが目にとまる。そういえば、今日は、コゲラも見ることができた。久しぶりの晴れ間のせいか、鳥がさかんにさえずっていた。

・2月だというのに、ハクモクレンやコブシの花芽はだいぶ膨らんでいる。アオキの花芽も目立ってきた。春遠からじである。3月になったら、あっという間に時間が過ぎていきそう・・・だ。



・樹冠からみたLTERプロット。歩道から見るのとは、また違った雰囲気である。当試験地では高所作業車が使いやすい環境なので、何かこの特色を生かした研究ができないか、と思ったりして・・・。少し視点が変わるだけで別世界である。

初雪

2009-02-27 | フィールドから
・この1週間、東京では日照時間が0。こう天気が悪い日が続くと気分がめいってしまうが、この時期悪いのは例年のことのようである。今日は雪になるという予想だったが、予想どおり、ついに雪らしい雪が降ってきた。富良野ではおなじみの雪だったのだが、東京でみると感慨深いものもある。しかし、こっちの雪は水分が多くて、傘を差さないと濡れてしまうのでかえって寒い感じがする。



・地がき論文のデータ解析をやり直す。I君に書いてもらっていたコードでは結果がそのまま表として出来上がるようになっていた(ということに今更気がついた)。GLMとGLMMの両方を試してみたが、樹種によっては微妙に違うものも・・・。色々と試行錯誤したものの、結局、今のままでいいような気がしてきた。図の見せ方を少し変える必要はありそうだが・・・。

地がき論文、修正

2009-02-26 | 研究ノート
・久しぶりに地がき論文の修正作業を行う。イントロと考察を中心にもう一度大きく構成を考える。一度、記憶が途切れてしまっているので、復活させるまでに多大なる時間を要してしまった。今更ながら、解析について気になるところがあり、自分でやり直してみたり・・・。

・当試験地の歴代の業績についての調べもの。2時間ほど格闘してはみたのだが、なかなか全貌を掴むのは難しい。それにしても先人達は実によく論文を発表していて驚かされる。意外な人が意外な業績を残していたりして、ちょっとした発見もある。

水位計データ

2009-02-23 | 研究ノート
・朝から雨が降っており、外作業は断念。Qst関連の論文を読み込む。生態学会誌に総説があり、理解に役立った。QstとFstの比較をするにはFstをいかに正確に求めるかがポイントになるらしい。が、こいつは奥が深い。

・湿地でデータを回収した水位計の電圧を水位に変換する作業。マニュアルではなく、1枚のメモ紙のようなものがぺらっと入っており、電圧と水位の関係が図示されている。忘れないようにメモしておくと、水位(センサーから水面までの距離cm)をY、電圧をX(V)とすると、Y=50(X-1)という関係にある。つまり、電圧が2Vならば水位は50cmというわけだ。

・後は土壌表面からセンサーまでの深さを引けば、土壌表面から水面までの距離が計算できる。ということで早速試してみると、何となくそれっぽい値が得られた。これが本当ならば、前山下湿地は水面が土壌表面のすぐ下にあるようで、実は地下水位がかなり低そうである。13林班と上湿地はあまり変わらないようで、感覚的には合っている。

・10日くらいで20cm近く上下しているのが本当だとすると、結構地下水位というは変動があるのかもしれない。ふうむ、あのロガー・・・意外(?)といけてるのかもしれない。春先のデータが楽しみである。

いかる

2009-02-22 | その他あれこれ
・別の公園に鳥を見に行く。早速入り口でバーダーらしき人がたむろしていると思ったら、珍しいイカルの群れ。幸先よいスタートである。



・サンクチュアリ方面の池は本当に小さくて、水鳥はいなかった。と、思いがけず、ヤマゲラが遊びにきた。エゴノキの実らしきものをくわえている。



・ツグミもみられる。本日の鳥は、イカル、カワラバト、ハシブトガラス、ヒヨドリ、ヤマゲラ、ムクドリであった。場所が変わると、新しい種類が見れて楽しい。



・穏やかな天気で、梅祭りも行われていたせいか、公園には多くの人が訪れていた。しばらく遊具で遊んだ後、久しぶりに凧揚げ(といっても公園で買ったポケモンのカイト)。風が吹くと気持ちよくあがる。



・そういえば、はるか昔にお気に入りのゲイラカイト(と呼んでいた、と思う)を飛ばしていたら、糸が突然切れて、そのままどっかにいってしまったことがある。少し切ない思い出である。

バーダー情報

2009-02-21 | その他あれこれ
・先週に引き続き、鳥を見に行く。さすがに3週目だともはや新しい鳥は見られないかと思ったが、いきなりハクセキレイが現れる。なぜか前回までの観察では見られなかったので初めてである。



・カワセミ・スポットでは相変わらず多くの人が大きな望遠カメラを抱えている。今日は対岸にジョウビタキも現れ、しばらく姿を見せてくれていた。いつもの枝に止まったカワセミも再びみることができた。



・結構、”バーダー”の間では情報交換がなされており、こちらにも”ゴイサギがあそこにいるよ”などと教えてもらう。




・カイツブリは相変わらず甲高い声で鳴いている。くろりと回ってくると、前回ゴイサギが陣取っていたスペースに、今度はコサギが鎮座している。緑のバックなのですごく目立ってしまうのだが、”いい場所”なんだろうか・・・。



・そんなこんなで本日見られた鳥は・・・。カルガモ、オナガガモ、マガモ、カイツブリ、ゴイサギ、コサギ、シジュウカラ、ヒヨドリ、オナガ、カワセミ、ジョウビタキ、ハクセキレイ、ハシブトガラス、カワラバトであった。新しくみられたのは、ハクセキレイとジョウビタキ。名前が分かるとそれだけで楽しい。

トドマツ交雑論文、受理!

2009-02-19 | 研究ノート
・会議ウィーク。会議の合間にRestoration EcologyのManaging editorから嬉しいメールが届いた。おっと、ついにトドマツ交雑論文がアクセプト(!)である。Restoration Ecologyという雑誌には、いつか自分の論文を載せてみたいと思っていたので、久しぶりにこいつは嬉しいニュースである。

・この雑誌に初稿を投稿したのは10月9日、マイナー修正の結果が届いたのが12月20日だから、悪くないペースである。しかーし、最初の雑誌に投稿したのは2008年1月31日なので、そこから考えれば実に1年以上かかっている。こういうとき、ブログ内検索をしていると、いかにこの論文を通すまでに苦労をしたかが分かる。”簡単に通る論文なんてない”ってことだよねえ。

・しかし、最初の雑誌の審査結果はリジェクトだったものの、いい雑誌だけあって極めて重大なコメントがあった。振り返れば、そのコメントがあったからこそ今日のこの日があるともいえる。そう思うと、そのときのReviewerには大感謝!である。こういう瞬間には、自分が論文を査読するときにも、どんな結果であれ、論文をImproveできるようなコメントを書きたいと思うわけだが、これがなかなか難しかったりするのである。

気合のデータ整理

2009-02-17 | 研究ノート
・標高別試験地のデータ解析続く。GLMMに変えてみると、なるほどAICは劇的によくなる。ただし、樹種によっては反復をランダム効果にする意味がそれほどないものもあり・・・。二次曲線で回帰する場合と直線回帰する場合を比較した結果は、GLMとほぼ同じ。ちなみに温度を説明変数にした場合には、あまりAICは良くならない。試行錯誤する中で、大体固まってきたというか、これ以上は仕方ないというべきか・・・。

・アカエゾ打合せに向けたデータ整理。エクセル・データセットを力技かつ気合で整える。とにかく毎木データだけでも何とかしなければ・・・。今までどうも蓄積が高すぎると思っていたら、当方の計算ミスだったということがようやく判明。いくらなんでも700m3を超えるわけはないか・・・。

・どうにかこうにか、データ整備が進み、同時に記憶もよみがえってきた。改めて眺めてみると、アカエゾがあるサイトはいずれも樹種が偏っていて、0.25haでみれらる樹種数(DBH>6cm)は十数種であることが多い。特に、湿地林は樹種が極めて限定され、4-8種しか胸高直径が6cm以上の樹木がみられない。

・個体密度を計算してみると、中径木(26cm以上)のアカエゾマツでも結構な密度で、中には100本/haを超えるところもある。集団自体の面積は小さいのだが、それにしても高密度である。やっぱり具体的な数値がでると実感がある。

トドマツ交雑論文、再修正

2009-02-16 | 研究ノート
・トドマツ交雑論文の審査結果が戻ってきた。今回はさらにマイナーな修正だったので、指摘事項を反映させて改訂稿を作成。例によって投稿ステップでは少々手間取ったが、何とか投稿完了。後は祈るのみである。

・いつしか時間が過ぎてゆき、気がついてみれば夕方・・・。20日のアカエゾ打合せのためのデータ確認。しばらくデータを触っていないと恐ろしいほどに忘れていることに気づかされる。毎木調査データについては途中までやりかけたまま放置されているような。ううむ、我ながら情けない。

・こちらもなかなか進まない標高別造林試験地の論文執筆。とりあえず、イントロのロジックを考える。学術的な背景から応用的な背景へと進める、という話にはなっているのだが、どうしても強引さが否めない。他の論文を見るとさらっとうまく流しているものもあり、もう少し検討が必要である。

都会キツツキ

2009-02-15 | その他あれこれ
・バスケットの試合を観にいくために、武蔵境から白糸台へ。バスと西武線を乗り継いで行く。相手はシード校だったのだが、第1、第2Qは一進一退の展開。しかし、第3Qで相手がゾーンディフェンスに変わった途端、攻め崩せなくなり、一気に14点差をつけられてしまう。

・第4Qには再び巻き返し、4点差まで詰め寄ったのだが、結局、そのまま押し切られてしまった。なんとも悔しい勝負であったが、選手達はもっと悔しかったのであろう。シュート精度を上げて、もっと自分達の得点パターンができるように、今後に期待したいところだ。



・がっくりしながら、帰りがけに公園でしばらく遊ぶ。どうにも鳥が気になるのだが、やっぱりハト、スズメ、ヒヨドリくらいしかいないなと思っていたら、シジュウカラを発見。おやっ、木に止まっているのはもしやと思って近づいてみると、間違いない、コゲラではないか・・・。Iさんから教えてもらって以来のお目見えだが、実にかわいい鳥である。

・妻と子どもの目の前でも、何を探しているのか、せわしなく動き回り、サクラの枝をあちこちつついている。姿に似合わず、ギューっと鳴くところも面白い。こんな都会の公園に、キツツキがいるとは思わなかった。なんか、ラッキーな感じである。