Memorandums

知覚・認知心理学の研究と教育をめぐる凡庸な日々の覚書

Wichmann & Hill: The psychometric function

2005-11-09 | Research
Percept Psychophys. 2001 Nov;63(8):1293-313.

The psychometric function: I. Fitting, sampling, and goodness of fit.

Wichmann FA, Hill NJ.

University of Oxford, England.

The psychometric function relates an observer's performance to an independent variable, usually some physical quantity of a stimulus in a psychophysical task. This paper, together with its companion paper (Wichmann & Hill, 2001), describes an integrated approach to (1) fitting psychometric functions, (2) assessing the goodness of fit, and (3) providing confidence intervals for the function's parameters and other estimates derived from them, for the purposes of hypothesis testing. The present paper deals with the first two topics, describing a constrained maximum-likelihood method of parameter estimation and developing several goodness-of-fit tests. Using Monte Carlo simulations, we deal with two specific difficulties that arise when fitting functions to psychophysical data. First, we note that human observers are prone to stimulus-independent errors (or lapses). We show that failure to account for this can lead to serious biases in estimates of the psychometric function's parameters and illustrate how the problem may be overcome. Second, we note that psychophysical data sets are usually rather small by the standards required by most of the commonly applied statistical tests. We demonstrate the potential errors of applying traditional chi2 methods to psychophysical data and advocate use of Monte Carlo resampling techniques that do not rely on asymptotic theory. We have made available the software to implement our methods.
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Klein, A. Psychometric function

2005-11-09 | Research
Percept Psychophys. 2001 Nov;63(8):1421-55.

Measuring, estimating, and understanding the psychometric function: a commentary.

Klein SA.

School of Optometry, University of California, Berkeley 94720-2020, USA.

The psychometric function, relating the subject's response to the physical stimulus, is fundamental to psychophysics. This paper examines various psychometric function topics, many inspired by this special symposium issue of Perception & Psychophysics: What are the relative merits of objective yes/no versus forced choice tasks (including threshold variance)? What are the relative merits of adaptive versus constant stimuli methods? What are the relative merits of likelihood versus up-down staircase adaptive methods? Is 2AFC free of substantial bias? Is there no efficient adaptive method for objective yes/no tasks? Should adaptive methods aim for 90% correct? Can adding more responses to forced choice and objective yes/no tasks reduce the threshold variance? What is the best way to deal with lapses? How is the Weibull function intimately related to the d' function? What causes bias in the likelihood goodness-of-fit? What causes bias in slope estimates from adaptive methods? How good are nonparametric methods for estimating psychometric function parameters? Of what value is the psychometric function slope? How are various psychometric functions related to each other? The resolution of many of these issues is surprising.
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PSYCHONOMIC SOCIETY

2005-11-08 | Research
46th ANNUAL MEETING of the PSYCHONOMIC SOCIETY

Sheraton Centre, Toronto
Thursday, November 10 - Sunday, November 13, 2005
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NASA Vision Group

2005-11-07 | Research
<NASA Vision Group>
NASA Ames Research Center

Publications から文献閲覧が可能
Probability summation over time (1979) Andrew B. Watson, Vision Research, 19, 515-52
など
References
http://vision.arc.nasa.gov/
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What does the eye see best?

2005-11-07 | Research
What does the eye see best?

Watson AB, Barlow HB, Robson JG.

Our eyes see so much in such varied conditions that one might consider the question posed in the title to be meaningless, but we show here that, within the range that we have been able to test, there is a particular spatiotemporal pattern of light that is detected better than any other. At least two plausible theories of visual detection predict that a stimulus will be seen best (will have greatest quantum efficiency) when it matches the weighting function of the most efficient detector. We have measured quantum efficiency for detecting a wide variety of spatiotemporal patterns using foveal vision in bright light. The best stimulus found so far is a small, briefly exposed circular patch of sinusoidal grating having a spatial frequency of approximately 7 c deg-1, drifting at approximately 4 Hz. We propose that this is the weighting function of the most efficient human contrast detector. We believe this answer to the question is unexpected and may have fundamental implications with regard to the mechanisms of visual perception.

References
Nature. 1983 Mar 31-Apr 6;302(5907):419-22.
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Watson, A. B. & Ahumada, A. J., Jr. (2005)

2005-11-07 | Research: V. Interp.
Watson, A. B. & Ahumada, A. J., Jr. (2005). A standard model for foveal detection of spatial contrast. Journal of Vision, 5(9), 717-740.
Keywords
vision, spatial, pattern, detection, threshold, contrast, contrast sensitivity, model, ModelFest


References
http://journalofvision.org/5/9/6/

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Watson, AB (1979)

2005-11-07 | Research: V. Interp.
Watson, A. B. (1979 ). Probability summation over time. Vision Research, 19, 515-522.

Abstract

Frequency-of-seeing and sensitivity-duration curves were collected for temporal signals of limited spectral extent. A comparison of the two sorts of data suggests that a stimulus is detected whenever the excursions of its linearly filtered, noise-perturbed temporal waveform exceed some fixed magnitude.

References
Elsevier.com - Vision Research
http://www.elsevier.com/wps/find/journaldescription.cws_home/263/description#description

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アスキー形式のsave

2005-11-07 | MATLAB
行列Aをアスキー形式で保存
>> save 'A.mat' A -ascii
ファイル名を指定するときに 拡張子 .mat をつける必要があることに注意

データの読み込み
>> load 'A.mat' -ascii
ファイル名から拡張子をとった名前の変数にロードした結果が代入される

References
MATLAB入門編
http://feedback.mech.fukui-u.ac.jp/matlab/matlab0.htm
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R による統計処理--データなどの入出力法

2005-11-07 | R
1. 作業ディレクトリを指定する
"Misc" メニューから,"Change Working Directory..." を選択し,作業ディレクトリを選ぶ。

2. テキストファイルからデータを読む
(データはテキストファイルとして用意するほうが汎用性が高い)
個々の変数の値が区切り文字(タブ,スペース,カンマなど)で区切られているテキストファイルからデータを読み込む
> x <- read.table("out.data", header=FALSE)
> x
1 行目からデータならば,header=FALSE

References
R による統計処理--データなどの入出力法
http://aoki2.si.gunma-u.ac.jp/R/io/index.html
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R -- ワイブル分布のパラメータの最尤推定

2005-11-06 | Research: V. Interp.
目的
ワイブル分布のパラメータを最尤推定する。

使用法
weibull.par(x, epsilon=1e-7)

引数
x データベクトル
epsilon 収束判定値(省略時には 1e-7 が仮定される)
max.loop 収束計算の上限回数(省略時には 500 回が仮定される)

このプログラムで計算される尺度パラメータは,
分布関数が F(x) = 1 - exp(- (x/b)^a) と表現されるときの b である.

cf.
http://blog.goo.ne.jp/hideunuma/e/b9f92b3183c7eef5767d94867fc90b1b

References
ワイブル分布のパラメータの最尤推定
http://aoki2.si.gunma-u.ac.jp/R/weibull-par.html
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R による統計処理

2005-11-06 | R
References
青木繁伸(群馬大学) R による統計処理
http://aoki2.si.gunma-u.ac.jp/R/index.html
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R : nlm()

2005-11-06 | Computer & Network
汎用最適化関数 nlm() の使用法

統計学では、最尤推定や最小自乗法等、ある目的関数の最適化を行なう必要がしばしば起こる。関数 nlm (Non-Linear Minimization)はニュートン法に基づく非線形関数の最小化関数で、r-help 記事によればしばしば optim() 関数の諸手法よりも良い結果を与えるらしい。

References
汎用非線形最小化関数 nlm - RjpWiki
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R: optim()

2005-11-06 | Computer & Network
汎用最適化関数 optim() の使用法

統計学では、最尤推定や最小自乗法等、ある目的関数の最適化を行なう必要がしばしば起こる。optim() は R の汎用最適化関数で、複数の代表的手法をオプションで選べる便利な道具である。

References
関数の最大・最小化 - RjpWiki
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Arts, Labour, and Science

2005-11-06 | Life
ある家のエントランスに掲げられたことば。
欧米の受け継がれてきた教養規範ではあろうが、Labour というところがプロテスタント的か。
三者に順序はないのであろう。しかし表現としては、 Labour が最初では押しつけがましい。Science が文頭では、いかにも説教くさくなってしまう。
芸術、労働、科学、と訳したのでは、あまりにも表面的な羅列でなんのことやらわからない。学芸、勤労、合理精神とでも訳せば少しは原意に近いのであろうか。
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Cog Forum: Week 5: Don MacKay

2005-11-05 | Research
Week 5: Cog Forum - (3:30 PM - 5:00 PM)

Title: Relations between memory and emotion: Theories versus Data.

Speaker: Donald G. MacKay

References
MacKay DG, Ahmetzanov MV.
Emotion, memory, and attention in the taboo Stroop paradigm.
Psychol Sci. 2005 Jan;16(1):25-32.
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