bootstrap by psignifit 3

閾値の信頼区間

>>help psych_options

Measures of interest
====================

#CONF
Cumulative probability levels at which confidence interval boundaries are
calculated: range (0, 1).

default: [0.023 0.159 0.841 0.977]
(equivalent coverage to [-2 -1 +1 +2] std's from the mean of a Normal)

bootstrap by psignifit 2

bootstrap法の適用例２
>>psych_tool_demo

prefs =

#shape weibull
#n_intervals 2
#runs 999


psi(x) = gamma + (1 - gamma - lambda) * F(x, alpha, beta)
using Weibull function for F, and assuming 2AFC design (gamma = 0.5)
lambda is constrained within [0, 0.05]
fitting to original data
initial: {alpha = 3.03854, beta = 4.02624, gamma = 0.5, lambda = 0.01}
final: {alpha = 3.06836, beta = 4.00961, gamma = 0.5, lambda = 3.09818e-07}
running 999 simulations using fitted parameters
Stats for generating distribution:
D = 3.94028, r_pd = 0.0307317, r_kd = 0.0371656
random seed: 952971489
1.3 seconds.
---
解説は以下で。
>>help psych_options

bootstrap by psignifit

サンプルデータによるbootsrap法の適用例１
>>pfit(dat)
psi(x) = gamma + (1 - gamma - lambda) * F(x, alpha, beta)
using logistic function for F, and assuming 2AFC design (gamma = 0.5)
lambda is constrained within [0, 0.05]
fitting to original data
initial: {alpha = 2.75851, beta = 0.47464, gamma = 0.5, lambda = 0.01}
final: {alpha = 2.78305, beta = 0.482604, gamma = 0.5, lambda = 1.02053e-06}
running 1999 simulations using fitted parameters
Stats for generating distribution:
D = 4.63268, r_pd = 0.148682, r_kd = 0.0515378
random seed: 952975053
2 seconds.

running sensitivity analysis (8 points)
15 seconds

% PARAMETERS:
% alpha beta gamma lambda
2.783 0.4826 0.5 1.021e-06 % (MLE)

% THRESHOLDS:
% 0.2 0.5 0.8 conf
2.1140 2.7830 3.4521 % (MLE)
% BOOTSTRAP THRESHOLD LIMITS:
-0.5973 -0.2997 -0.2913 % 0.023
-0.2767 -0.1396 -0.1336 % 0.159
+0.2114 +0.1419 +0.1941 % 0.841
+0.4185 +0.2585 +0.4110 % 0.977
% WORST-CASE THRESHOLD LIMITS:
-0.6944 -0.3078 -0.3261 % 0.023
-0.3423 -0.1603 -0.1543 % 0.159
+0.2422 +0.1756 +0.2691 % 0.841
+0.5012 +0.3245 +0.5809 % 0.977
以下省略

bootstrap についてのメモ

bootstrapということばをめぐる、なかなか面白い話が紹介されている。

References
"bootstrap"という名称についての話題
http://www.littera.waseda.ac.jp/faculty/stok/menu06/6_naming.html

反応手続きとしての強制選択法

反応の手続きとしての強制選択法(FC: forced-choice method)は、極限法、恒常法、信号検出(SDT)などさまざまな測定法で用いられる。乳幼児の精神物理学における選好注視（強制偏好視: forced preferential looking）もそのひとつである。
この方法では、検出刺激をふくむ２つ以上の選択肢が空間的あるいは時間的に提示される。選択肢を同時的に提示する空間的強制選択(spatial forced choice method)と、継時的提示をおこなう時間的強制選択(temporal forced choice method)が区別される。

References
苧阪直行 (1993). 精神物理学的測定法 （大山、今井、和気(編)感覚・知覚心理学ハンドブック　誠信書房

SDT with AFC data

References 参照
2AFC事態では、試行の正反応率P(c)が感受性の測度となる。観察者が選択肢を偏りなく選択すればP(c)からd'が得られる。
d'=sqrt(2)・z(c)
この方法はyes-no実験よりも扱いが簡単で効率も良い。2AFCはmAFC(m>2)事態にも拡張できる。

References
苧阪直行 (1993). 精神物理学的測定法 （大山、今井、和気(編)感覚・知覚心理学ハンドブック　誠信書房）pp.38

psignifit -> matlab toolbox

psignifit toolbox for Matlab 5 and up

Overview

The toolbox is in two parts:

Most important is the psignifit engine, which is a mex-file (a compiled binary plug-in to Matlab). This does all the serious number-crunching, fitting functions to a large number of simulated data sets. The engine works with Matlab versions 4 and up. On its own, the functionality of the engine is similar to that of the standalone application, except that its input/output interface uses Matlab matrices rather than text streams.
The rest of the toolbox consists of m-files (text files) which carry out many of the peripheral tasks involved in fitting psychophysical data, and provide a convenient input/output interface with the engine, including graphics functions.

Installation からQuick-startまで。

References
psignifit - > matlab toolbox

論理演算子

Reference 参照
------
表示
A & B
A | A

MATLAB は、|演算子より、&演算子を優先します。MATLAB は、通常、左から右に式を計算しますが、優先順の関係で、式 a|b&c は、a|(b&c)と同じ計算になります。& と |の混在しているものに対して、ステートメントの優先順を明示的に識別するために、括弧を使うことは良い考えです。
-----

References

MATLAB Function Reference 論理演算子

作業メモ

　勘違いで、今月中に書かねばならないものがひとつ増えそうだ。あわせて２つは予定外だが、なんとかこれまでのペースでこなしたい。いずれにせよ、実験のほうはひとくぎりつけておきたい。このような時に限って世の中は Thanksgiving で連休モードである。
　夕方、Brian の実験に参加。知覚学習の実験は疲れるが、確かに学習効果はあるようだ。「注意」だけでは説明は不十分だろう。
　

Bach: English Suites No.1

Murray Perahia
Bach English Suites No.1 in A Major, BWV806

　最近Cableでよくかかるので聴くことが多い。下記サイト（INSPIRED MINDS: The Lyrical Poet of the Piano）のインタビューで彼の音楽観を直接に聞くことができる。

References
Music Choice, Classical Masterpieces
murrayperahia.com
INSPIRED MINDS: The Lyrical Poet of the Piano

screen copywindow

>>screen copywindow?

Usage:

Screen('CopyWindow',srcWindowPtr,dstWindowPtr,[srcRect],[dstRect],[copyMode])

Copy images, very quickly, between two windows (on- or off- screen).

srcWindowPtr →　dstWindowPtr

Benny Goodman@MET

Holiday in Central Park (NYC)

作業メモ

Experiment: preliminary
　Ceiling effects は解決したが、予想した傾向はまだ現れていない。手続きも含め、program 修正検討。

Article: a
　Results の途中まで。

Article: b
　pending.

English as a Second Language Podcast!補足

iTunes からの登録についての補足
iTunes → MusicStore →（ジャンル） PodCasts →（カテゴリー） 教育 → English as a Second Language

References
Apple.com/jp
iTunes 無償ダウンロード　Mac + Windows
ただし、現在 iTunes に「深刻な脆弱性」が指摘されており、少し様子を見た方がよいかもしれない。