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西東京市・北海道富良野の森林を舞台にした遺伝,育種,生態などに関する研究ノートの一部を紹介します

車、発掘20分

2007-01-10 | 研究ノート
・札幌の朝は風もなく、穏やかである。富良野に比べると雪の量は圧倒的に少ない。札幌駅北口はこんな感じ。



・今回は“じゃらん”で予約したので、朝食はついていないため、朝食を取るために、例によってカフェ・デンマルクへ向かう。出勤の人たちとは逆行していると、なんだかアウトローになったような気分。世の中の流れに逆行してるぜ、みたいな気分になるから単純なものである。

・札幌駅でRさんと合流し、北大のKさんの研究室を訪ねる。トドマツ種子散布モデルのご相談ということで来たわけなのだが、のっけからTINN-Rをダウンロードし損ねたことに気がついて、いきなりお手数をおかけしてしまう(そういえば、今回は結局使わなかった)。

・今までの経緯とお願いしたい内容をご説明したのだが、Kさんの鋭い質問に答えているうちに、結局、今回の論文の中で、種子散布と呼んでいたものは、実は単なる種子散布ではなく、散布、定着、生存を経た結果であり、年齢のデータを無視して単にモデリングしても何をフィットしているのか分からない、ということが浮き彫りになってきた。ということで、モデリングも定着と生存のプロセスを考慮した複雑なものになりそうで、さらにKさんにご負担をかけてしまうことになってしまったわけだけど、背後にあるプロセスに迫ることができれば面白いことになりそうである。

・昼食をはさんで、さらに打ち合わせ。途中、R上で使える遺伝解析の各種パッケージ、MaserBasye、WinBUGSなども少しデモンストレーションしていただいた。おそらく、すごいスピードで使えるパッケージが充実、拡大しているであろうことは察しがつく。講義が終わって以来、そういえばRを触っていないな、いかん・・・。帰り間際になり、Rさんから遺伝構造を二次元的な等高線図のような形で示したいという突然の希望があり、3人であーでもない、こーでもないとジタバタする。まずはMol Ecolの最新号のユーカリの遺伝構造の論文で使われている指標PCOなるものをしっかり理解しないといけないようで・・・。 相変わらず、新しい解析法やプレゼン方法がどんどん出現する分野である。

・富良野に戻ると、一日放置した車はすっかりと雪に埋もれていた。掘り出すのに20分もかかる。同じ北海道とはいえ、違うもんですなあ。

ホイコーローおにぎり

2007-01-09 | 研究ノート
・久しぶりの職場復帰。本日は新車ではなく、もう一台の車シビックで通勤。国道もなかなか“つるつる”した感じである。年始の挨拶をしたと思ったら、早速、急ぎの連絡調整にあたふたと。バタバタと今週から来週にかけての日程が決まる。

・いきなり12時すぎに職場を後にして、富良野駅へ。コンビニでおにぎりと黒ウーロン茶を買い込んで、根室本線へと乗り込む。普段は梅、シャケ、シーチキンマヨネーズなどの無難なものを購入するのだが、なぜか今日は“ホイコーロー”を購入してしまった。うーむ、なかなか微妙なお味で・・・。

・場所を富良野から札幌に移して、トドマツ親子解析データのデータセットをチェックする作業。他人が作成したエクセルファイルは本当に解読するのは大変。細かいところに問題があったりして、データセットの体裁を整えるのに時間がかかる。Rさんと合流し、さらにデータをチェックする。さらにミスが発見されたり、謎が解き明かされたり・・・。やはりメールと電話だけでは限界があるようで・・・。

・親のデータ、倒木のデータも体裁を整え、ようやく完成した(と思われる)。もうチェックしないぞ・・・。平均種子散布距離は24mと、値自体はほとんど変わっていない。アップロードしてメールにてご連絡し、ようやく終了。

新春ブログ初め

2007-01-08 | その他あれこれ
・新年明けましておめでとうございます.遅くなりましたが、ようやく今年もブログをはじめました。無理のないように、ぼちぼちと続けたいと思っています。

・元旦に長崎から北九州へと移動していたのだが、ネットにつながりにくい環境だったために、投稿する余裕もなく随分と期間が空いてしまった。それにしても、九州の実家はどちらも屋内が冷え冷えとしている。本当にあんな厳しい環境の中で生きていたんだろうか・・・。今回は、結局、最後までその寒さに慣れずに大苦戦。もはや、こちらの穏やかな屋内気候に体が退化してしまったのか!

・富良野には6日に戻ってきたわけだが、年末から年始にかけての不在時期は“それはもう”穏やかな気候だったらしい。たしかに、我々が千歳空港に到着してときにも空港内に雪が全くなくて驚いたわけだが・・・・。しかし、そんなに甘い時期が続くわけもなく、到着した翌日から例の“爆弾低気圧”なるものが居座り、富良野も当然のように荒れた天気が続いている。雪の量はたいしたことはないのだが、風が舞っているときの体感気温というのはとてつもなく・・・寒い。



・それにしても、久しぶりに記事を書こうとすると、色んなニュースがあったようでいて、案外、何から書いていいのか分からないものだ。しかしまあ、我が家に新車が来たというのが一大ニュースであることは間違いなかろう。その車とは、スバルのステラである。とても「軽」とは思えないほど屋内がゆったりとしており、実に快適である。新車の香りってやつも久しぶりに嗅いだ気がする。何といっても、冬道を走行しているときの安心感が全然違う。CDもFMも聞けるようになり、通勤ライフが楽しくなりそうだ。



・我が家の恒例行事。今年も遅ればせながら、近くの富良野神社に初詣に行く。そうそう、ドラマ「北の国から」で吉岡秀隆と内田有紀が結婚したという有難い(?)神社である。北風が舞う中、境内を100mも進むと震え上がるほどである。特有の挨拶の方法に従い、家族の健康を祈願。良い年になりますように・・・。