ぴかりんの頭の中味

主に食べ歩きの記録。北海道室蘭市在住。

【練】千歳~小樽 吹雪通行止

2007年02月04日 23時38分33秒 | 練習記録
♪札幌市民オケ練習 2/4(日)14:00-20:15@Kitara大リハ室
曲 アンタール → 禿山 → ハイドン63番

 今日を逃すと残りは本番しか参加できないので、なんとしても行かねばならん。登別~苫小牧は良い天気で快適ドライブでしたが、高速道路の状況を示す電光掲示板には【千歳~小樽 吹雪通行止】の表示。いったいどんだけ降っとんねん。しかし札幌に入ると強かった雪はだんだん収まり、思ったよりスムーズに会場につけました。
 早くついたので部屋が開くまでロビーでボーッとしていると、通りがかりの人に声をかけられた。見ると某オケ所属でキタラ職員の方でした。あら奇遇。今日はオルガン演奏会の譜めくりの仕事だそうです。そんな仕事もあるんだ…
 時間になって事務所で鍵を借りて会場一番乗り。指揮台、イス、譜面台をならべたところで体力の限界。ありがとうございました。
 禿山の終結部の5度打たれる鐘の音のモチーフは、朝の5時なんだそうです(常識?)。妖怪たちの宴の終わり、夜明けを知らせる鐘の合図。なるほど。先日も弾いたけど全然わかってなかった。
 帰りは良い天気のツルツル路面をクタクタの体を引きずりつつ、無事帰りつきました。おつかれさまでした。

♪本番 札幌市民オケ アトリエコンサート 2007.2.18(日)14:00開演@ちえりあ(札幌・宮の沢)
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【論】Ge,2005,Interpreting expression profiles of ~

2007年02月04日 17時17分29秒 | 論文記録
Ge X, Yamamoto S, Tsutsumi S, Midorikawa Y, Ihara S, Wang SM, Aburatani H.
Interpreting expression profiles of cancers by genome-wide survey of breadth of expression in normal tissues.
Genomics. 2005 Aug;86(2):127-41.
[PDF][Web Site]

・ヒトの各組織のアレイデータについて、手持ちのデータに加え、過去研究のデータも網羅的に解析し、組織特異的遺伝子(tissue-specific genes)を抽出する。
・データ
1.(オリジナルデータ)Adult human tissues, 35サンプル(3 fetal/33 normal, すべて別な器官の組織), 約20000遺伝子 → Tissue-specific genes を1956個、Tissue-selective genes を920個抽出
2.(既存データ)Normal tissue (HuGe Index database), Normal tissue (Gene Expression Atlas database), Multiple cancer types [Su], Liver cancer [Midorikawa], Breast cancer [Perou], Breast cancer [Sorlie], Lung cancer [Bhattacharjee] 他
・遺伝子抽出法
1.Tissue-specific : t test and several empirical criteria(→謎)
2.Tissue-selective : Sprent's nonparametric method[19]
・遺伝子クラスタリング法 : Average linkage hierarchical clustering [Eisen]

・問題点「A critical difficult part of studying cancer with DNA microarrays is data interpretation.
・概要「In this paper, we performed additional microarray experiments of normal tissues to search extensively for tissue-specific genes and then systematically reanalyzed previously published DNA microarray data of various cancers.
・研究の意義「Knowing how genes are expressed under normal physiological conditions is important for dissecting complicated cancer transcriptomes.
・特異的遺伝子の定義「We consider a gene specific to a tissue type if it is exclusively highly expressed in this tissue.
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