ヤチダモのマイクロサテライト

・本日，またもや東京である．新しく開発したヤチダモ4プライマーを試すために，3100にかける．今回試した4つのうち，１つ（赤）は，ピークの形もきれいで多型性も申し分ない．もう1つ（緑）も多型的だが，微妙にサイズが振れていて，サイジングで苦労しそう．その他の２つのうち，１つは,マルチバンド，もう一つはピークの形が悪く，これまた使いにくいようだ．結局，このまま使えそうなのは１つだけということで，ちょっと残念な結果である．

・ただし，プライマーを開発するときに，同じ座でもう1つの組合せが試せるように設計しているので，今度は新しい組合せを試すことにする．東京でもヤチダモの研究をする予定の留学生がいるということで，学生，Sさんと研究打ち合わせ．学生の実験練習も兼ねて，プライマー濃度などの調整などは任せることに．当方にとっても，こうした実験を頼めることは非常に有難い．

・今回，高価なLA-Taqという酵素を使い，SATL2という超多型遺伝子座を増幅した（はず）だったのだが，ほぼ完全に全滅であった．どうやら，プライマーが劣化してしまっていたらしい．久しぶりに実験をやると，こういう無駄が多くてどうにもいかん．幸い，アカエゾマツの大量SSR解析は上手くいったようで，そちらは一安心．最初，増幅していないものからスタートしたので，もしかして全てのサンプルが完全に駄目かと思って，頭がくらくらした．



・さて，今回のホテルは品川プリンス新館である．福岡ソフトバンクのドームが併設されているシーホーク・ホテルと雰囲気がそっくりである．品川プリンスホテルには，水族館（面白そう！），ボーリング場，ブランドのショップなどの複合アミューズメント施設となっている．どうでもいいけど，高校生の修学旅行らしき団体が3組ぐらい宿泊しているようで，ごったがえしている．とにかく，ホテルはでかすぎるし，宿泊者の数が多すぎて，あまり好きにはなれない．ただし，部屋から東京タワーを望むことができ，夜景だけは素晴らしかった．