Systematic Localization of Common Disease-Associated Variation in Regulatory DNA
Published Online September 5 2012
Science 7 September 2012:
Vol. 337 no. 6099 pp. 1190-1195
DOI: 10.1126/science.1222794
Abstract
Genome-wide association studies have identified many noncoding variants associated with common diseases and traits. We show that these variants are concentrated in regulatory DNA marked by deoxyribonuclease I (DNase I) hypersensitive sites (DHSs). Eighty-eight percent of such DHSs are active during fetal development and are enriched in variants associated with gestational exposure–related phenotypes. We identified distant gene targets for hundreds of variant-containing DHSs that may explain phenotype associations. Disease-associated variants systematically perturb transcription factor recognition sequences, frequently alter allelic chromatin states, and form regulatory networks. We also demonstrated tissue-selective enrichment of more weakly disease-associated variants within DHSs and the de novo identification of pathogenic cell types for Crohn’s disease, multiple sclerosis, and an electrocardiogram trait, without prior knowledge of physiological mechanisms. Our results suggest pervasive involvement of regulatory DNA variation in common human disease and provide pathogenic insights into diverse disorders
研究室のJCで紹介された論文です。
シビれた。
久しく味わっていなかった興奮を感じた。
分子生物学的な解析、特にゲノムgenome sequenceからの意味合いを拾い上げるということ。
今までの論文における主に遺伝子変異の有無を解析するだけにすぎなかったGWAS解析が、
この論文によって病態と結び付く予感を感じさせるものとなった。
分子生物学はこれから行った解析の意味を要求される時代となると思います。
遺伝子変異があるから、どのような影響があるのか？
病気の発症にどのような影響をあたえるのか？
分子生物学の階層から、細胞生物学の階層に影響を及ぼすのか？
興味深い論文は、重要な問題提起を内在している。
ゲノムというものは、これまでの人間の認識を劇的に変更させる力を有していると思います。