Nema Dean and Andrian E Raftery
Normal uniform mixture differential gene expression detection for cDNA microarrays
BMC Bioinformatics 2005, 6:173
[PDFダウンロード][Webサイト]
・サンプル間で発現量が有意に異なる遺伝子を抽出するための新しい手法として、Normal Uniform Differential Gene Expression (NUDGE)を提案する。
・比較した手法:unadjusted and Bonferroni-adjusted t tests, Significance Analysis of Microarrays (SAM), and Empirical Bayes for microarrays (EBarrays) with both Gamma-Gamma and Lognormal-Normal models
・'R'のパッケージとして使用可能。
・比較の手順がなんだかよくわからないが、結果の数値だけ見ると、提案法(NUDGE)だけが完璧な結果となっている。あまりに完璧だと、それはそれで疑わしい感じ。
・結局、肝心のNUDGEの計算法が理解できない。数式が読めない。
・全体的にものすご~く読みづらい~~
Normal uniform mixture differential gene expression detection for cDNA microarrays
BMC Bioinformatics 2005, 6:173
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・サンプル間で発現量が有意に異なる遺伝子を抽出するための新しい手法として、Normal Uniform Differential Gene Expression (NUDGE)を提案する。
・比較した手法:unadjusted and Bonferroni-adjusted t tests, Significance Analysis of Microarrays (SAM), and Empirical Bayes for microarrays (EBarrays) with both Gamma-Gamma and Lognormal-Normal models
・'R'のパッケージとして使用可能。
・比較の手順がなんだかよくわからないが、結果の数値だけ見ると、提案法(NUDGE)だけが完璧な結果となっている。あまりに完璧だと、それはそれで疑わしい感じ。
・結局、肝心のNUDGEの計算法が理解できない。数式が読めない。
・全体的にものすご~く読みづらい~~
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