【論】Reiner,2003,Identifying differentially express～

Anat Reiner, Daniel Yekutieli and Yoav Benjamini
Identifying differentially expressed genes using false discovery rate contolling procedures
Bioinformatics, 19(3), 368-375, 2003.
[PDF][Web Site]

・マイクロアレイデータを用いたFDRの性能評価。
・データ：マウス[Dudoit,2002]
・解析法
1.Resampling upper limit (FDR)
2.Resampling point-estimate (FDR)
3.BH point-estimate (FDR)
4.BH LSU - No Resampling (FDR)
5.Westfall-Young (FWE)

・FDRとは「The FDR is the expected proportion of erroneously rejected null hypotheses among the rejected ones.」
・目的「The goal of the experiment was to identify genes with altered expression in the livers of mice with very low HDL cholesterol levels compared to inbred control mice.」

・そう難しいことをやっているわけではなさそうだけど、何をどうしているのか、さっぱり内容つかめず。お手上げ。「FDRをcontrolする」イメージが湧かない。