危険回避行動？？？

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Windows(に限らないかな？)で、なにかデータ処理をすると、
大抵の場合、窓(Window)が現れますネ。(出ないものも有りますが)

この窓には、(大抵)右上に３つのボタン(と云うのかな)が並んでいますネ。
（気の利いたソフトでは、出来ない／触ってはいけないボタンは無いケド）

（一例：２つの窓を重ねて見た）


それで、窓を隠したい場合この中の左端(ですか)をクリックしますネ。
ここに危険が潜んで居る。(終了させたく無い場合です)

間違って、右端の「×」をクリックした場合、
気の利かないソフトでは、即 終了しますネ。
（でも、一々問い合わせられるのもウザイ時があるカモ？）


そんな時の為に、日頃から、
危険回避の動作を身につけておくと良いカモね？？？

それは、窓の右上を触らない(見ない)コトですネ。


で、どうする？？？

（上記の例なら）ビデオ・スクリーン全体でみると、下のようですね。


ここで、絶対に赤丸部に触れずに青丸部をクリックする。
って、絶対はナイヨ。
それなら、スクリーンの下に見える、緑丸部をクリックするようにする！
緑丸部のクリックで、窓の最小化／アクティブ化がトグルスイッチ出来る！

これだって、絶対はあり得ないが、目を右上に持って行くのでは無くて
左下に持って行くように自分を「躾」ることが、
危険回避の行動ではないでしょうか？？？

コンナコト？？？　何かの参考になりましたら ウレシイ。　 　　　　



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MOPAC2009：pKa 精度

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「生体分子設計学 ２限目？」で(抜け出して)知った、
「MOPAC2009」の「PM6法」で追加されたパラメータ「pKa」について、・・・・・

本家のサイトに、「Accuracy of Prediction of pKa」がありました。

「pKa」パラメータで計算する「pKa」値は、どの位の精度があるか？
ってことですね。


この表の横軸は経験値(実験で求めた値：真の値？)で、
縦軸は「PM6」法で計算した値。
＜紙＞のレベルではパーフェクトと云えますね。


下の方に具体的な、分子ごとの値が載っています。

例によって、「Acetic acid」＝酢酸 だと、
真値＝4.76 で、計算で求めた値＝5.00 とあります。

＜紙＞の計算(生体分子設計 2限目補習)では、5.029 でした。
また、ものの本では、4.72 とありました。

微妙に異なる！　ま、いぃっか。

と云うことで、今日の 部活動 は終了です。　 　　　　



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護謨の分子構造？

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護謨(特に、天然ゴム)について、その構造を調べていたら、
フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』の「イソプレン」には、
　　天然ゴムはほぼ cis-1,4-ポリイソプレンで表すことの出来る、
　　10万～100万のイソプレン分子からなる付加重合体である。
とありました。
そして、「イソプレン」の構造図(２Ｄ)が載っていました。


炭素と水素だけから成っているんですネ。
驚きました。勉強になりました。


そこで、３Ｄ構造を「WinMostar」＋「MOPAC2009」で作ってみました。

先ず、「WinMostar」で作画：
原子(団)の「Add」「Rep」「Del」コマンドでそれらしく作り、

計算パラメータを、
「PM6 EF PRECISE」として、
一旦、「isoprene.dat」で保存。

「MOPAC2009」で計算(構造最適化)する。
アッと云う間です。

完成！


炭素５つは、ある一平面上にあるのですね。



ゴムの名称には、“ポリ”が付いているので、
この「イソプレン」がいっぱい繋がっているのですネ。
と云うことで、今日の 部活動 は終了です。　 　　　



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生体分子設計 2限目補習

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「生体分子設計学 ２限目？」はハチャメチャに成ってしまったので、
補習をすることになりました。
なお、“学”はハズスことにしました。(＜紙＞には無理です。)


エタノールやメタノールでなく、授業の後半にある「酢酸」でやってみました。

「WinMostar」で構造を作り、(「MOPAC2009」の「PM6」法です)

一旦「CH3COOH.dat」として保存しておいて、
「MOPAC2009」で計算実行、・・・・・ 結果は、
　　HOF = -95.31320 KCAL
です。

この構造から水素を削除して、

「CH3COOH-.dat」として保存しておいて、
「MOPAC2009」で計算実行、・・・・・ 結果は、
　　HOF = -130.19648 KCAL
です。

従って、HOF の差は、-34.8833 となり、かなり強い酸とでました。


ついでに、pKa を計算してみました。

すると、5.029 とでました。
本によると、4.72 とあります。

「MOPAC2009」の「pKa」パラメータによる計算精度は、・・・・・
２～６ ％でしょうか？
(常用対数ですから、５～１５％ となりますか？)

まあ、モグリ大学生？＜紙＞ですから、
この位で、良いでしょうかネ？


ところで、
この章の目的(？)は、
　　酸の強さをはかる指標に pH がありますが，
　　これは解離したプロトン濃度を測定しています。
　　すなわち酸の強さは，基質の解離しやすさに依存します。
　　言い換えれば，分子が解離してプロトンを放出することによって得られる
　　エネルギーを比較することにより，酸の強度を比較することが出来ます。
でした。

「解離しやすさ」は、生成熱の差で測る。
だから、「基質」とその「解離型」の両方を「MOPAC」で計算し、
結果の「生成熱」を求めることで、測ることが出来る！


と云うことで、何とか、先に進めますかネ？　 　　　



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２０万IPアクセスに到達！

ご訪問ありがとうございます。


「今日は、クリスマス」から１ヶ月が経過しました。
今日は、ブログを始めてから５８１日目です。

これが、４１５件目の記事になります。(前回から２９件増加)


この１ヶ月のトピックスとしては、
junk ＰＣ を買って、
Windows XP と Windows 7 のデュアルブート環境を作ったこと？
いや、
もぐりで、大学の講義に参加し始めたこと？

あと、右サイドにあった「通信簿」は削除しました。(面白みが無い！)

そして、
昨日(1月25日)で２０万IPアクセスに達しました。

ブログ開設から(１年７ヶ月目)580日目です。

１０万IPアクセスは、昨年7月16日(ブログ開設から387日目)でした。

この１０万増加は、丁度半分の193日目！

皆様のアクセスに深く感謝致します。
誠に、有り難う御座います。
今後とも、どうかよろしくお引き立ての程、お願い致します。



と云うことで、定例(？)の 最近の状況についてまとめます。



＜閲覧履歴機能＞
　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　日当たりの数値は直近１週間の平均値

１．「gooあしあと」

「友達」は、先月と変わらず４名です。
２０人の方に「注目」されています。(先月より２名増。)

「あしあと会員」分
日当たりのアクセス(ＰＶ)数：２３０(先月より１増)。
日当たりの訪問者(ＩＰ)数　：２１６(先月より３減)。
変わらず？

「あしあとランキング」では、５～７位。(若干下がったナ)


２．「あし＠」

「あし＠」会員アクセス数：５１３ＰＶ／日(先月より１１８増)。
　　　　　　　　　ユーザ数：２２６ＵＵ／日(先月より１７増)。
アクセス数は大幅 増！


「あしとも」は、先月と変わらず３名です。
「読者」には、１２２名載っています(先月より１１名増で３名減)。

「アクセスランキング」
　　総数は 88,065 件で、４９位(少し上がった！)
「読者ランキング」
　　総数は 51,658 件で、１３４位(少し上がった！)


＜「gooブログ」標準アクセス＞

日当たりアクセス数：１５０６ＰＶ(先月より２１０増)。
　　　ＩＰベースでは、６３７ＩＰ(先月より７１増)。
大幅 増！
ＩＰベースでは、７００を越えた日が１回(773)ありました。
それは、gooアクセスランキングでは初めての６００位台(669位)でした。

７日移動平均では、５２０～６４４ＩＰでしょうか。
(ＰＶベースでは、１,３００～１,５９２とかなり増！)

ランキングでは、669～1,231位(135万6千件中)。（変わらず？）


ＩＰベースの内訳で見ると、
gooアクセス(６３７)＝gooあしあと(２１６)＋あし＠(２２６)＋一般(１９５)
と云う状況でしょうか。(「gooあしあと」と「あし＠」に重複がありますが・・・)
（あし＠が付かない、gooブログ直アクセスの方もいらっしゃいます。）

因みに
１２月は、５６６＝２１９＋２０９＋１３８
１１月は、５４４＝２０９＋１９９＋１３６
１０月は、５５３＝２０５＋２２９＋１１９
　９月は、４４２＝１５１＋１４７＋１４４

と云うことは、
合計・・・・・・・大幅増？
gooあしあと・・・変わらず？
あし＠・・・・・・微増？
一般・・・・・・・大幅増？
と云ったところでしょうか？？？
これからも頑張ります。　　　　　　



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