<紙>さんLOG

「パソコンヲタクの雑記帳」
 PC/Linux系/物理・化学で遊んでいます。
思いついたことを綴っています。

ZINC:化合物DB

2009年10月31日 | 理科部 部活
ご訪問ありがとうございます。


ZINC」なる、フリーで検索できるサイトを見つけました。
UCSF:University of California, San Francisco のサイトですね。
1千3百万件以上の市販の化合物を納めたデータベースとのことです。


「Search and Browse」をクリックすると、・・・


JMEエディタ窓付きの検索画面がでる。



検索サイト:ChemIDplus」で検索した、
「SODIUM DICHLOROISOCYANURATE(C3Cl2N3O3)」を
JMEエディタで描き(適当にそこらここらをクリックしてみました)、


最初は、「Save SMILES」ボタンを押してみました。
(赤線)
SMILES文字列「O=c1nc([O-])n(Cl)c(=O)n1Cl」が得られますね???

次は、「QUERY DATABASE」ボタンを押してみました。
(青線)
検索結果画面になります。


非常に多くの結果が出てきました。

とりあえず、1番目のものについて、右欄をクリックしてみました。


「Jmol」で3D表示(グリグリ)出来ました。




目出度しメデタシ???

と云うことで、今日の 部活動 は終了です。     



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検索サイト:C@ROL

2009年10月30日 | 理科部 部活
ご訪問ありがとうございます。


2D表記を3D構造化」で書いた
Molecular networks/inspiring Chemical Discovery」の、
「demos」タブをクリックすると、
「Online Demonstrations and Services」が現れる。
この中の、
「Software」の1番目に「CORINA」がありました。

更に下の「Databases」の2番目に
C@ROL」と云う検索サイトがありました。
(CAROL のようです。)


左側は、JME Molecular Editor ですね。
そして、
  Database status:
  Database with 897144 molecules available from Specs and Ambinter is ready.
と、約90万件有るようです。


そこで、
「日化辞Web」で調べた、ビタミンB2酸(C18H20N4O8)
を調べて見ました。




結果は、2件でました。




上の方の「706576」(物質名は不明ですが)をクリックし、
出てきたページで3D構造表示をさせると、

「Jmol Applet」で、グリグリできますね。


これが、ビタミンB2酸?
(分からないけど、ま、いいっか???)
と云うことで、今日の 部活動 は終了です。     



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csh(Cシェル)を導入

2009年10月29日 | Linux系
ご訪問ありがとうございます。

andLinux に、slice シリーズをインストールして、
「slicePVR」コマンドで、プログラムが起動することを確認しました。

そこで、「File Manager」で覗いてみると、
/usr/local/bin
には、「sliceなんたら」と云うexecutableがいっぱいある。
しかし、一部「C shell script」がある。
( それらのファイルの先頭行は、当然ながら、
  「#!/bin/csh」
  ですね。 )




ところが、なんと、
「andLinux」では、シェルは「bash」であって、
(こっちの方が機能はある のかなナ?)
「csh」(Cシェル)は入っていない!!!
(機能が無いから?要らない?)

でも、それでは、「slice シリーズ」を簡単に使えない?

調べてみると、
「bash」と「csh」では、文法が大違いのようですね。
簡単に移行(ちょこちょこと手で直すこと)は出来ない?

しようがないので、「csh」を導入することにしました。

でも簡単にできるのですね。

andLinuxの初期設定をした時に見つけた、
「Synaptic」を使うと、“ちょちょいのちょい”です???



必要なPackageに対する、
左端のチェックボックス(赤○の列)をonにして(クリックして)、
上にある青○部分の「Apply」ボタンを押すと、
・・・・・程なく・・・・・
緑○部分の様にインストールされる。

これで、「csh」の導入は お し ま い 。
簡単でした。(嬉しい。私にも出来ました。)


これからは、「bash」でも「csh」でも、
「shell script」が実行出来るようになりました。

目出度しメデタシ

それからどうするの?????
ま、今日のところは、ここまでです。     



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拡張子(.pbx)の対応付け

2009年10月28日 | PCクリニック
ご訪問ありがとうございます。


PictBear を導入しましたが、拡張子の対応付けがされていない!

「PictBear Standard ファイル」は「.pbx」に成っている。
しかし、これはどのプログラムとも対応付けされていない


これでは不便なので、対応付けすることにしました。

こういう結果になりますね。


それで、手順は?

(Windows のエクスプローラで作業する。)

1.「ツール」メニューの「フォルダオプション(O)」を開く。

2.「ファイルの種類」タブを押してみると、
 「登録されているファイルの種類(T)」の拡張子欄に「pbx」が無い。

3.そこで、「新規」ボタンを押し、

4.「ファイルの拡張子」に「pbx」と入力し、「OK」ボタンを押す。

5.「拡張子'pbx'の詳細」で、「変更」ボタンを押す。
 「このファイルを開けません」と仰るので、
 「一覧からプログラムを選択する」ことにする。

6.「このファイルの種類を開くプログラムを選択してください」
 とでるので、「PictBear」を選ぶ。
 ----- 選びたかったが、
 「PictBear」のインストール先が「C:¥Program Files」では無いので、
 出てこない。--->
 「参照」ボタンを押して、インストール先ディレクトリを開き、
 (「D:¥PictBear Second Edition」ですが)
 「PictBear.exe」を指定する。
 (「PictBear.exe」として、「OK」ボタンを押す)

以上で終了です。





さらに操作法を勉強して、活用しよう!

と云うことで、今日はここまでです。    



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490日目です。

2009年10月27日 | Weblog
ご訪問ありがとうございます。


1年3ヶ月と2日」から30日が経過しました。 始めてから490日目です。

これが、343件目の記事。 27件増加とは、3日を除き毎日でした。
これが効いた(?)のか、今回は、大きな変化がありました。

と云うことで、定例(?)の 最近の状況についてまとめます。



<閲覧履歴機能>
                    日当たりの数値は直近1週間の平均値

1.「gooあしあと

「友達」は、今4名です。(先月と同数:“友達”・“あしとも”について6)
(これくらいですね)
18人の方に「注目」されています。(先月から変わらず。)

「あしあと会員」分
日当たりのアクセス(PV)数:215(先月より59増)。
日当たりの訪問者(IP)数 :205(先月より54増)。
大幅増!!!

「あしあとランキング」では、5位前後?(大幅に上がった!!)


2.「あし@

「あし@」会員アクセス数:396PV/日(先月より176増)。
         ユーザ数:229UU/日(先月より82増)。
大幅増!!!


「あしとも」は、今4名です。(先月より1名減:“友達”・“あしとも”について6)
(これくらいかナ?)
「読者」には、108名載っています。(先月と変わらず。8名増で8名減。)

「アクセスランキング」
  カテゴリー「パソコン」、351件中1位(キープ)。
  総数は 83,049 件で、73位(かなり上がった!)
「読者ランキング」
  カテゴリー「パソコン」、251件中1位(キープ)。
  総数は 49,552 件で、148位(少し上がった!)。


<「gooブログ」標準アクセス>

日当たりアクセス数:1250PV(先月より336増)。
   IPベースでは、553IP(先月より111増)。
大幅増!!!
IPベースでは、あのとき以来、2回(494、381)を除き連日500超???。
(反動は無いのかな???)
7日移動平均では、503~554IPかな?
(PVベースではほぼ1,000越え。昨日がピークの1,354。)

ランキングでは、909~1,300位あたり(131万超 件中)。(少し上がった。)


IPベースの内訳で見ると、
gooアクセス(553)=gooあしあと(205)+あし@(229)+一般(119)
と云う状況でしょうか。(「gooあしあと」と「あし@」に重複がありますが・・・)

因みに
9月は、442=151+147+144
8月は、452=135+141+176
7月は、431=136+116+179
6月は、446=135+138+173
5月は、432=127+159+146
4月は、372=109+196+ 67

と云うことは、
合計・・・・・・・飛び跳ねた???
gooあしあと・・・大幅増加???
あし@・・・・・・飛び跳ねた???
一般・・・・・・・大幅減少?下り坂?
と云ったところでしょうか???
これからも頑張ります。     



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