分子構造表示形式

ご訪問ありがとうございます。


これまでに、幾つかの分子の構造を３Ｄ表示してきていますが、
どんな形式で表示出来るのかを纏めてみます。

機能制限は有るが無期限試用可の「Mercury」で調べてみました。
（「物質構造表示ツール一覧に載せてあります）


水分子(H2O)を表示させてみました。
以下の４種類でしょうか？

Wireframe：線モデル


Stick：棒モデル


Ball and stick：球棒モデル


Spacefill：空間充填モデル



＜紙＞にとっては、球棒(棒球？)モデルが分かりやすいです。


この球の大きさや棒の太さは、変更できますね。
球(原子)の大きさはファン・デル・ワールス半径の比率(0.1～0.8)で、
棒の太さはオングストローム単位(0～0.3)で、指定できる。


デフォルトは、それぞれ、0.25倍、0.1オングストロームですね。

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表示形式の種類だけなら、RasMol の方が沢山(９種類？)ありました。

でも、水分子に対しては、「Ribbons」では何も表示されません！？？？

表示形式の種類の多さでは無くて、
操作性面では「Rasmol なら RasTop かナ？」でしたっけ？


と云うことで、今日の 部活動(化学？) は終了です。　 　　　



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