ginkgolide の構造データは？

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「ギンコライド(ginkgolide)」の構造式は、C20H24O9 であった。
構造図も見えていた。
もっと正確な構造データ(座標データ)はないものか。
そうだ、「日化辞Ｗｅｂ」で検索してみよう。

大変だ、６６件も見つかった。



一番最初の「ギンクゴリドＡ」でいってみるか。（また、違った呼び方ダ！）


こんな構造？


では、MOLデータをダウンロードっと。「J37.103C.MOL」として。


でも、Ｚ座標値は全てゼロ？？？


平面状でしかない。困ったな。


さらに、原子数が足りない？？？
20+24+9＝５３のはず。だが、・・・・・
「J37.103C.MOL」ファイルには、３５しか無い？？？

調べました：「MOL format」
　　MOLフォーマット表記の特徴
　　・水素は省略する
　　明示的に水素原子を記述しても問題はありませんが、
　　通常、水素原子はMOLフォーマットに記入しません。
　　水素の数は各原子における結合の数と価数から割り出します。

MOLデータって、Ｈ(水素)は省略するのが一般的だって。
つまり、53-35＝18ヶのＨが省略されている。

え～と、
端にある４ヶのＣに各３ヶ、
端にある２ヶのＯに各１ヶ、
途中にある２ヶのＣに各２ヶ、
で、合計１８ヶになるナ。

困ったナ。面倒だナ。どうしようか？

と云うことで、今日の 部活動 は終了？？？　 　　　



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