気になるニュース(3/31)

・asahi.com：ａｕ携帯「Ｗ４２Ｋ」の電池発火、回収へ　京セラ機種 - 社会
・KDDI au: auからのお知らせ > auからのお知らせ詳細 > 京セラ製au携帯電話「W42K」をご利用中のお客様へのお詫び
　# 今度は京セラのが燃えるそうな

・ガソリンの買いだめダメ　消防法違反の恐れ (1/2ページ) - MSN産経ニュース
　# ガソリンをポリタンクに入れて持ち帰るのは違法です…ちゅうか、それ以前に危険です

・「セレナ」３１万台をリコール　日産 - MSN産経ニュース
　# セレナな方、ご確認を

・asahi.com：次長課長の河本さん、放送中にけが　骨折で全治１カ月 - 文化・芸能
　# うわっ…折れてたん？

・3G版のiPhoneは第2四半期に登場か - ITmedia News
・The Evidence for a 3G iPhone... June 2008 - Mac Rumors
　# 3G iPhoneが6月？そろそろ日本にもやってくるかしら？

・アップル、次世代「iPod」ではWolfson製オーディオチップを採用せず:ニュース - CNET Japan
　# なぬ？iPod nanoとiPod touchの新バージョンが9月に？マジですか？

・国際動物愛護団体PETA、「たこ焼きの販売やめて」と日本プロ野球に要請 国際ニュース : AFPBB News
　# 野球場でベジタリアンフードを売ることがなんで地球温暖化対策になるのか、いまいち意味不明

・中国でたばこを吸うカメが見つかる 国際ニュース : AFPBB News
　# この亀は禁煙できるんでしょうか

・「ウオンバットにレイプされた」、虚偽通報の男に奉仕活動75時間 国際ニュース : AFPBB News
　# ……何を思ってそんな通報したんだか……

・ 消費者が選ぶ最も影響力あるブランドは「アップル」＝ネット調査 | テクノロジー | Reuters
　# そりゃそうだわね

・アップル、iPhoneに手書き認識を導入？ - Engadget Japanese
　# Newtonの再来なるか？

・iPhone 2.0ベータがアップデート、正式に「Version 2.0」へ - Engadget Japanese
　# らしいです

・アップル、Windows版Safariのライセンス使用契約書で誤記:ニュース - CNET Japan
　# Windows版Safariの使用制限を「Apple-labeled computer」にしたら、一台もあらへんがな

・エミレーツ航空、世界初、飛行中の機内から自分の携帯が使えるシステム導入:モバイルチャンネル - CNET Japan
　# げ…そんなもの、御大に知れたらえらいこっちゃ…

・Google社ロゴはどう作られたか | WIRED VISION
　# Googleロゴの変遷です

・カード番号を入れても大丈夫？【お答えします100題】：日経パソコンオンライン
　# 慣れてくるとついついチェックし忘れちゃうんだよね

・iモード普及の立役者、夏野剛氏がドコモを退職するとの報道 - ITmedia D モバイル
　# な、なんと…

・暗闇コミュニケーション体験リポート：“目隠し”しながら手探りで食事を－－上司と仲良くなれる「クラヤミ食堂」 - ITmedia Biz.ID
　# 面白そうだな

・次世代携帯電話、通信方式統一で端末に互換性へ : 経済ニュース : マネー・経済 : YOMIURI ONLINE（読売新聞）
　# ようやっとSIMロックが解除されるんですね

・高卒認定ミス、１９００人に７千万円賠償へ…文科省方針 : 社会 : YOMIURI ONLINE（読売新聞）
　# これ、酷い話だな

・asahi.com：カンボジア大虐殺を生き抜いたディス・プランさん死去 - おくやみ
・「キリング・フィールド」モデルのディス・プラン氏が死去 : 国際 : YOMIURI ONLINE（読売新聞）
　# 「キリング・フィールド」…大好きな映画の一つです…ご冥福をお祈りします

・asahi.com：魔法のキス、ピンチ救う　智弁和歌山バッテリー - スポーツ
　# ………

・「手がきブログ」が人気　本文もコメントも手書き　「ユーザーは遊びの天才」 - ITmedia News
　# 手書きには手書きの良さがある…が、それなりに暇もいる…

・アニメ「めぐみ」をコピーフリーでネット公開　政府、拉致問題訴え - ITmedia News
　# 素晴らしい試みだと思います

・故障診断チャート | お客様サポート | NTTドコモ
　# どうも携帯の調子が…という方、ご確認を

Science News | March 31(2), 2007

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日本野鳥の会：巣から落ちたヒナ、拾わないで－－呼び掛け - 毎日ｊｐ(毎日新聞)
　# 可哀想だからって拾ってしまうと余計なお世話なんだそうです

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大腸がん：高率発症のＤＮＡ配列を解析－－７カ国共同チーム - 毎日ｊｐ(毎日新聞)

Genome-wide association scan identifies a colorectal cancer susceptibility locus on 11q23 and replicates risk loci at 8q24 and 18q21.
Albert Tenesa, Susan M Farrington, James G D Prendergast, Mary E Porteous, Marion Walker, Naila Haq, Rebecca A Barnetson, Evropi Theodoratou, Roseanne Cetnarskyj, Nicola Cartwright, Colin Semple, Andrew J Clark, Fiona J L Reid, Lorna A Smith, Kostas Kavoussanakis, Thibaud Koessler, Paul D P Pharoah, Stephan Buch, Clemens Schafmayer, Jürgen Tepel, Stefan Schreiber, Henry Völzke, Carsten O Schmidt, Jochen Hampe, Jenny Chang-Claude, Michael Hoffmeister, Hermann Brenner, Stefan Wilkening, Federico Canzian, Gabriel Capella, Victor Moreno, Ian J Deary, John M Starr, Ian P M Tomlinson, Zoe Kemp, Luis Carvajal-Carmona, Emily Webb, Peter Broderick, Jayaram Vijayakrishnan, Richard S Houlston, Gad Rennert, Dennis Ballinger, Laura Rozek, Stephen B Gruber, Koichi Matsuda, Tomohide Kidokoro, Yusuke Nakamura, Brent W Zanke, Celia M T Greenwood, Jagadish Rangrej, Rafal Kustra, Alexandre Montpetit, Thomas J Hudson, Steven Gallinger, Harry Campbell, Malcolm G Dunlop.
Nature Genetics, Advance online publication | doi:10.1038/ng.133

In a genome-wide association study to identify loci associated with colorectal cancer (CRC) risk, we genotyped 555,510 SNPs in 1,012 early-onset Scottish CRC cases and 1,012 controls (phase 1). In phase 2, we genotyped the 15,008 highest-ranked SNPs in 2,057 Scottish cases and 2,111 controls. We then genotyped the five highest-ranked SNPs from the joint phase 1 and 2 analysis in 14,500 cases and 13,294 controls from seven populations, and identified a previously unreported association, rs3802842 on 11q23 (OR = 1.1; P = 5.8 × 10^-10), showing population differences in risk. We also replicated and fine-mapped associations at 8q24 (rs7014346; OR = 1.19; P = 8.6 × 10^-26) and 18q21 (rs4939827; OR = 1.2; P = 7.8 × 10^-28). Risk was greater for rectal than for colon cancer for rs3802842 (P <0.008) and rs4939827 ( <0.009). Carrying all six possible risk alleles yielded OR = 2.6 (95% CI = 1.75–3.89) for CRC. These findings extend our understanding of the role of common genetic variation in CRC etiology.

Differential effects of oncogenic K-Ras and N-Ras on proliferation, differentiation and tumor progression in the colon.
Kevin M Haigis, Krystle R Kendall, Yufang Wang, Ann Cheung, Marcia C Haigis, Jonathan N Glickman, Michiko Niwa-Kawakita, Alejandro Sweet-Cordero, Judith Sebolt-Leopold, Kevin M Shannon, Jeffrey Settleman, Marco Giovannini, Tyler Jacks.
Nature Genetics, Advance online publication | doi:10.1038/ng.115

Kras is commonly mutated in colon cancers, but mutations in Nras are rare. We have used genetically engineered mice to determine whether and how these related oncogenes regulate homeostasis and tumorigenesis in the colon. Expression of K-Ras^G12D in the colonic epithelium stimulated hyperproliferation in a Mek-dependent manner. N-Ras^G12D did not alter the growth properties of the epithelium, but was able to confer resistance to apoptosis. In the context of an Apc-mutant colonic tumor, activation of K-Ras led to defects in terminal differentiation and expansion of putative stem cells within the tumor epithelium. This K-Ras tumor phenotype was associated with attenuated signaling through the MAPK pathway, and human colon cancer cells expressing mutant K-Ras were hypersensitive to inhibition of Raf, but not Mek. These studies demonstrate clear phenotypic differences between mutant Kras and Nras, and suggest that the oncogenic phenotype of mutant K-Ras might be mediated by noncanonical signaling through Ras effector pathways.

A genome-wide association study identifies colorectal cancer susceptibility loci on chromosomes 10p14 and 8q23.3.
Ian PM Tomlinson, Emily Webb, Luis Carvajal-Carmona, Peter Broderick, Kimberley Howarth, Alan M Pittman, Sarah Spain, Steven Lubbe, Axel Walther, Kate Sullivan, Emma Jaeger, Sarah Fielding, Andrew Rowan, Jayaram Vijayakrishnan, Enric Domingo, Ian Chandler, Zoe Kemp, Mobshra Qureshi, Susan M Farrington, Albert Tenesa, James GD Prendergast, Rebecca A Barnetson, Steven Penegar, Ella Barclay, Wendy Wood, Lynn Martin, Maggie Gorman, Huw Thomas, Julian Peto, D Timothy Bishop, Richard Gray, Eamonn R Maher, Anneke Lucassen, David Kerr, D Gareth R Evans, The CORGI Consortium, Clemens Schafmayer, Stephan Buch, Henry Völzke, Jochen Hampe, Stefan Schreiber, Ulrich John, Thibaud Koessler, Paul Pharoah, Tom van Wezel, Hans Morreau, Juul T Wijnen, John L Hopper, Melissa C Southey, Graham G Giles, Gianluca Severi, Sergi Castellví-Bel, Clara Ruiz-Ponte, Angel Carracedo, Antoni Castells, The EPICOLON Consortium, Asta Försti, Kari Hemminki, Pavel Vodicka, Alessio Naccarati, Lara Lipton, Judy WC Ho, K K Cheng, Pak C Sham, J Luk, Jose AG Agúndez, Jose M Ladero, Miguel de la Hoya, Trinidad Caldés, Iina Niittymäki, Sari Tuupanene, Auli Karhu, Lauri Aaltonen, Jean-Baptiste Cazier, Harry Campbell, Malcolm G Dunlop, Richard S Houlston.
Nature Genetics, Advance online publication | doi:10.1038/ng.111

To identify colorectal cancer (CRC) susceptibility alleles, we conducted a genome-wide association study. In phase 1, we genotyped 550,163 tagSNPs in 940 familial colorectal tumor cases (627 CRC, 313 high-risk adenoma) and 965 controls. In phase 2, we genotyped 42,708 selected SNPs in 2,873 CRC cases and 2,871 controls. In phase 3, we evaluated 11 SNPs showing association at P <10 in a joint analysis of phases 1 and 2 in 4,287 CRC cases and 3,743 controls. Two SNPs were taken forward to phase 4 genotyping (10,731 CRC cases and 10,961 controls from eight centers). In addition to the previously reported 8q24, 15q13 and 18q21 CRC risk loci, we identified two previously unreported associations: rs10795668, located at 10p14 (P = 2.5 × 10^-13 overall; P = 6.9 × 10^-12 replication), and rs16892766, at 8q23.3 (P = 3.3 × 10^-18 overall; P = 9.6 × 10^-17 replication), which tags a plausible causative gene, EIF3H. These data provide further evidence for the 'common-disease common-variant' model of CRC predisposition.

　# っちゅうか、大腸ガン関連の論文が一気にどさっと…

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二酸化炭素：地中貯留、豪州の火力発電所で実証実験 - 毎日ｊｐ(毎日新聞)
　# ま、地中から掘り出したものを地中に戻すというのは理に適っているんだが…
　# もの凄い高圧でキープしたら漏れてこないのかしら？

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太陽観測機「SOHO」がとらえた黒点 国際ニュース : AFPBB News

Sunspots | SOHO
　# ん？今って活動が活発になってきているんだっけ？

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ストレスや不安、心臓血管疾患発症リスクを倍増 米研究報告 国際ニュース : AFPBB News

Anxiety Worsens Prognosis in Patients With Coronary Artery Disease.
Woldecherkos A. Shibeshi, Yinong Young-Xu, Charles M. Blatt.
J Am Coll Cardiol 49, 2021-2027 (2007) | doi:10.1016/j.jacc.2007.03.007

Objectives: This study examined the effect of anxiety on mortality and nonfatal myocardial infarction (MI) in patients with coronary artery disease (CAD).

Background: Inconsistent data exist regarding the impact of anxiety on the prognosis of patients with CAD.

Methods: The authors conducted a prospective cohort study at an outpatient cardiology clinic of 516 patients with CAD (mean age 68 years at entry, 82% male) by administering the Kellner Symptom Questionnaire annually. The primary outcome was the composite of nonfatal MI or all-cause mortality.

Results: During an average follow-up of 3.4 years, we documented 44 nonfatal MIs and 19 deaths. A high cumulative anxiety score was associated with an increased risk of nonfatal MI or death. Comparing the highest to lowest tertile of anxiety score, the age-adjusted hazard ratio was 1.97 (95% confidence interval 1.03 to 3.78, p = 0.04). In a multivariate Cox model after adjusting for age, gender, education, marital status, smoking, hypertension, diabetes mellitus, previous MI, body mass index, and total cholesterol, each unit increase in the cumulative mean anxiety score was associated with increased risk of nonfatal MI or total mortality; the hazard ratio was 1.06 (95% confidence interval 1.01 to 1.12, p = 0.02).

　# やっぱり不安とかストレスとか抱え込んでると心臓に悪いってのは本当なんだよね

Science News | March 31(1), 2007

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asahi.com： 痛み伝える仕組み解明　岡山大 - サイエンス

痛みの“運び屋”発見　頭痛治療に期待　岡山大チーム - MSN産経ニュース

Identification of a vesicular nucleotide transporter.
Keisuke Sawada, Noriko Echigo, Narinobu Juge, Takaaki Miyaji, Masato Otsuka, Hiroshi Omote, Akitsugu Yamamoto, Yoshinori Moriyama.
Proc. Natl. Acad. Sci. USA, Early Edition | doi:10.1073/pnas.0800141105

ATP is a major chemical transmitter in purinergic signal transmission. Before secretion, ATP is stored in secretory vesicles found in purinergic cells. Although the presence of active transport mechanisms for ATP has been postulated for a long time, the proteins responsible for its vesicular accumulation remains unknown. The transporter encoded by the human and mouse SLC17A9 gene, a novel member of an anion transporter family, was predominantly expressed in the brain and adrenal gland. The mouse and bovine counterparts were associated with adrenal chromaffin granules. Proteoliposomes containing purified transporter actively took up ATP, ADP, and GTP by using membrane potential as the driving force. The uptake properties of the reconstituted transporter were similar to that of the ATP uptake by synaptic vesicles and chromaffin granules. Suppression of endogenous SLC17A9 expression in PC12 cells decreased exocytosis of ATP. These findings strongly suggest that SLC17A9 protein is a vesicular nucleotide transporter and should lead to the elucidation of the molecular mechanism of ATP secretion in purinergic signal transmission.

　# 25日付のPNASだそうな誰が25日やねん
　# 12回膜貫通型トランスポーターらしい

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asahi.com： 肥満に関係するたんぱく質の構造解明 - サイエンス (4/1追加)

生活習慣病に関連するタンパク質複合体の結晶構造を世界で初めて決定 | 独立行政法人 理化学研究所プレスリリース

Protein biotinylation visualized by a complex structure of biotin protein ligase with a substrate.
Bagautdin Bagautdinov, Yoshinori Matsuura, Svetlana Bagautdinova, Naoki Kunishima.
J. Biol. Chem, Papers In Press | doi:10.1074/jbc.M709116200

Biotin protein ligase (BPL) catalyzes the biotinylation of the biotin carboxyl carrier protein (BCCP) only at a special lysine residue. Here we report the first structure of BPL:BCCP complex crystals which are prepared using two BPL mutants: R48A and R48A&K111A. From a detailed structural characterization, it is likely that the mutants retain functionality as enzymes but have a reduced activity to produce the reaction intermediate biotinyl-5’-AMP. The observed biotin and partly disordered ATP in the mutant structures may act as a nonreactive analog of the substrates or biotinyl-5’-AMP, thereby providing the complex crystals. The four crystallographically independent BPL:BCCP complexes obtained can be classified structurally into three groups: the formation stages 1 and 2 with apo-BCCP and the product stage with biotinylated holo-BCCP. Residues responsible for the complex formation as well as for the biotinylation reaction have been identified. The C-terminal domain of BPL shows especially large conformational changes to accommodate BCCP, suggesting its functional importance. The formation stage 1 complex shows the closest distance between the carboxyl carbon of biotin and the special lysine of BCCP, suggesting its relevance to the unobserved reaction stage. Interestingly, bound ATP and biotin are also seen in the product stage, indicating that the substrates may be recruited into the product stage complex before the release of holo-BCCP, probably for the next reaction cycle. The existence of formation and product stages before and after the reaction stage would be favorable to ensure both the reaction efficiency and the extreme substrate specificity of the biotinylation reaction.

　# よくまぁ、こんな複合体が結晶になったもんだ

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科学なニュースとニュースの科学：クルマの渋滞はなぜ起こる？ - ITmedia アンカーデスク

Traffic jams without bottlenecks―experimental evidence for the physical mechanism of the formation of a jam.
Yuki Sugiyama, Minoru Fukui, Macoto Kikuchi, Katsuya Hasebe, Akihiro Nakayama, Katsuhiro Nishinari, Shin-ichi Tadaki, Satoshi Yukawa.
New J. Phys. 10 033001 (2008) | doi: 10.1088/1367-2630/10/3/033001

A traffic jam on a highway is a very familiar phenomenon. From the physical viewpoint, the system of vehicular flow is a non-equilibrium system of interacting particles (vehicles). The collective effect of the many-particle system induces the instability of a free flow state caused by the enhancement of fluctuations, and the transition to a jamming state occurs spontaneously if the average vehicle density exceeds a certain critical value. Thus, a bottleneck is only a trigger and not the essential origin of a traffic jam. In this paper, we present the first experimental evidence that the emergence of a traffic jam is a collective phenomenon like 'dynamical' phase transitions and pattern formation in a non-equilibrium system. We have performed an experiment on a circuit to show the emergence of a jam with no bottleneck. In the initial condition, all the vehicles are moving, homogeneously distributed on the circular road, with the same velocity. The average density of the vehicles is prepared for the onset of the instability. Even a tiny fluctuation grows larger and then the homogeneous movement cannot be maintained. Finally, a jam cluster appears and propagates backward like a solitary wave with the same speed as that of a jam cluster on a highway.

　# 実証ビデオ付の論文…説得力あるなぁ

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asahi.com： 肝硬変の新薬実験に成功　札幌医大チーム - サイエンス

マウスの肝硬変治った、治療薬の実用化も…札幌医科大グループ : 科学 : YOMIURI ONLINE（読売新聞）

肝硬変：原因細胞を抑制…札幌医大が「新薬」近く臨床試験 - 毎日ｊｐ(毎日新聞)

【竹内薫の科学・時事放談】肝硬変　治療薬生んだ畑違いの実験 (1/2ページ) - MSN産経ニュース (4/14追加)

Resolution of liver cirrhosis using vitamin A–coupled liposomes to deliver siRNA against a collagen-specific chaperone.
Yasushi Sato, Kazuyuki Murase, Junji Kato, Masayoshi Kobune, Tsutomu Sato, Yutaka Kawano, Rishu Takimoto, Kouichi Takada, Koji Miyanishi, Takuya Matsunaga, Tetsuji Takayama, Yoshiro Niitsu.
Nature Biotechnology, Advance online publication | doi:10.1038/nbt1396

There are currently no approved antifibrotic therapies for liver cirrhosis. We used vitamin A–coupled liposomes to deliver small interfering RNA (siRNA) against gp46, the rat homolog of human heat shock protein 47, to hepatic stellate cells. Our approach exploits the key roles of these cells in both fibrogenesis as well as uptake and storage of vitamin A. Five treatments with the siRNA-bearing vitamin A–coupled liposomes almost completely resolved liver fibrosis and prolonged survival in rats with otherwise lethal dimethylnitrosamine-induced liver cirrhosis in a dose- and duration-dependent manner. Rescue was not related to off-target effects or associated with recruitment of innate immunity. Receptor-specific siRNA delivery was similarly effective in suppressing collagen secretion and treating fibrosis induced by CCl₄ or bile duct ligation. The efficacy of the approach using both acute and chronic models of liver fibrosis suggests its therapeutic potential for reversing human liver cirrhosis.

　# siRNAがここまで劇的に効くとは…あとは副作用として何が現れるかだな

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「コレステロール値、低いと危険」富山大調査で死亡率高め : 科学 : YOMIURI ONLINE（読売新聞）

ＬＤＬコレステロール：本当に悪玉？　少な過ぎると死亡率上昇－－メタボ基準の一つ - 毎日ｊｐ(毎日新聞)
　# コレステロール値が高い以外に異常がなければ、むしろ健康かも知れないそうな
　# ちなみに、何処に発表したんでしょう？

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百日ぜき患者が倍増、過去１０年間で最速ペース : 科学 : YOMIURI ONLINE（読売新聞）
　# 百日咳はBordetella pertussisもしくはBordetella parapertussisを病原菌とする細菌感染症です

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噴火警戒レベル、三宅島は「レベル２」 : 科学 : YOMIURI ONLINE（読売新聞）

気象庁 | 噴火予報・警報 : 三宅島

気象庁 | 噴火予報・警報 : 御嶽山
　# 三宅島は分かるが、御嶽もですか…と思ったら、平常レベルの代表例にでもされたのね

惜別

とうとうやってきてしまった年度末…。しかも、今回は、組織改編が伴ったために、いつもにも増して去っていく人が多く、残される人数が数人になるという、今まで想像だにしなかった状況に、愕然とするばかりで何も出来ず…。

思いがけなかったのは、十年来同じ研究室でやってきて、そのうちの半分は同じプロジェクトで頑張ってきたHO君が去っていくこと…。特に何かをいわれていたわけでもなく、ある日突然、改変後の職場には応募しないといわれ、そのまま…。てっきり次の組織でも一緒に新しい仕事をやっていけるんじゃないかと思いこんでいたので、まさに青天の霹靂…。けど、引き留めることなんて出来やしないし、この先の進路を決めるのは自分自身なんだから、HO君が自分の進むべき道を見つけてくれるのを端から祈るくらいしかできない自分…。HO君、今まで本当にありがとう。そしてご苦労様でした。

FF(旧FI)さんは、本来のプロジェクトが終了するのと組織改編がちょうど同時だったし、結婚してからずっと離ればなれで、思わず自分がそうだった頃を思い出しそうな感じだったし、きっとようやく本来あるべき状況になれるんだろうから、祝福すべきなんでしょう。どうぞお幸せに。

ROさんには、もの凄くお世話になっていました。日常の話し相手から、出身が同じ学科ということもあって、いろいろと頼んでしまって、申し訳なかったと反省しています。今度行く先は、異動などないでしょうから、しっかりと腰を落ち着けて成果を出していってくれることを祈っています。

YKさんは、どんな仕事でも、どんな状況でも笑顔を振りまいてくれて、何度助かったことか…。色んな意味で困らせてしまったような気がするけれども、最後まで笑顔で対応してくれた上に、「何か分からないことがあったら、連絡ください」とまで言ってくれた…。本当に感謝しています。

いつも、こうして年度末を迎える度に、別れを経験するけれども、どうにもこの惜別感というのは慣れることはないようで、どうしていいのか分かりません。人生というのは、出会いと別れの連続なのですが、歳と共に別れがどんどんつらくなりつつあるようです。

研究室を去られる皆様、今まで本当にご苦労さまでした＆ありがとうございました。心より、皆様の進む道が明るく開けていますようお祈り申し上げます。

# それにしても、本当に別れの挨拶メールが多いな…。

最後のラボ花見

先週土曜日、WKの研究室で行う最後の花見をしました。

最後の花見くらい、YKの人も来やすいように昼間にやろうということで、初めて土曜日の真っ昼間にお花見をしました。しかも、いつもならば桜が満開の土曜日は一般に開放するのですが、如何せん今年の桜はペースが速すぎて、さすがに手配が追いつかなかったらしく、開放期日が次の土曜日になっておりまして、今回は場所取りの心配もすることなく、見事なほどに満開の桜の下でお花見を開くことが出来ました。

結局集まった人数は20人に満たなかったのですが、YKからも何人か駆けつけてきてくれまして、楽しいお花見が出来たんじゃないかと思います。昼間なのにちょっと寒かったのが玉に瑕…。で、日曜日から続く雨のおかげで、散ってしまうかと思われた満開の桜も、咲き始めてから間もない雨と花冷えのおかげであまり散ることもなく、しばらく持ちこたえてくれそうです。

来年は、有志でするか、家族でこぢんまりとやることになりそうです。ま、如何せん花粉症一家ですので、家族だけだとやる気も失せちゃうんですけどね。

ご参加いただきました皆様、ありがとうございました。

過剰寂寞感

職場組織改編に伴う急激な別離の増加で、耐え難い寂寞感に襲われてどうしようもない…。まるで深海の底にでも沈んでしまったかのような…。

気になるニュース(3/28)

・締め切りまであと何分？　Googleカレンダーと連携した「D3timer」 - ITmedia Biz.ID
　# これ、いいかも…

・「W43S」「W44S」にメール送信履歴が消える不具合――ケータイアップデートで対応 - ITmedia D モバイル
　# W43S、W44Sな方、ご確認を

・MS、iPhoneやiPod touch対応のOfficeソフト開発か!? - Fortuneが報道 | 経営 | マイコミジャーナル
　# なんだかどえらいプラットホームになりつつあるな、iPhone & iPod touch

・「しつけ」とバットで頭殴る　自分の子供２人を暴行 - MSN産経ニュース
　# ひどい…

・中国製レーザー玩具など失明の恐れ　経産省が回収呼びかけ - MSN産経ニュース
　# 複数製品あるようですので、心当たりのある方はご確認を

・「すべてやらせだ」直訴のチベット僧らＴＶ映像に : 国際 : YOMIURI ONLINE（読売新聞）
　# 外国による調査が必須だと思います

・ガソリン値下げ確実に…首相の新提案、野党は拒否へ : 政治 : YOMIURI ONLINE（読売新聞）
　# 暫定税率撤廃による収入減の代替も示さないままに撤廃しようとする野党の責任はどう問うたらいいのですか？

・高校野球、女子も出場検討を…文科相が高野連に要望 : 選抜高校野球08 : スポーツ : YOMIURI ONLINE（読売新聞）
　# ていうか、野球は男子、ソフトボールは女子などという分け方もいっそのことやめて、野球男子・女子、ソフトボール男子・女子ってしたらいいのに

・ＴＢＳ番組に会津若松激怒、鶴ヶ城開城「不衛生だから」？ : 社会 : YOMIURI ONLINE（読売新聞）
　# 理由の一つなんだったら仕方がないだろうな

・温室ガス排出量、鉄鋼など１４社は非開示 : 社会 : YOMIURI ONLINE（読売新聞）
　# 全情報が集まらなきゃ意味ないじゃん

・asahi.com：蘇我氏の武器庫？発見　入鹿邸とほぼ確定　奈良・甘樫丘 - 文化・芸能
・蘇我入鹿邸、甘樫丘を要塞に　奈良・明日香村 - MSN産経ニュース
・蘇我入鹿邸に武器庫？大型倉庫群出土　奈良・明日香村 - MSN産経ニュース
　# 蘇我入鹿邸が確定ですか

・asahi.com：市岐阜商廃止、市教委「やむを得ず」　立命館移管へ道筋 - 暮らし
　# え…市岐商なくなるの？

・asahi.com：東京メトロ副都心線の「急行」に東武や西武も対抗 - コミミ口コミ
　# おぉ！頼もしいことを！

・Apple、iPhone SDKを改訂しInterface Builderを追加 - ITmedia News
　# iPhone SDKに興味のある方、ご確認を

・抑えきれない愛情がにじみ出る、『Mac開封式』の動画 | WIRED VISION
　# Mac以外で、開封がこんなにたくさん取り上げられるのを見たことがありません

・一般人が立ち入れない「米国の秘密の場所」写真ギャラリー | WIRED VISION
　# 確かに、かなりレアな写真です

・モトローラ、携帯端末事業の分離を決定:モバイルチャンネル - CNET Japan
　# モトローラ、どこへ行く？

・すべての道は「Vista」へ通ずる--移行は避けがたい必然:コラム - CNET Japan
・「Windows XP」の提供期間、再延長の可能性が濃厚に:コラム - CNET Japan
　# 「全ての道がWindows Vistaに通じる」＝「全てのWIndowsが破滅に通じる」…なぁんてね

・「822P」に電源が入らなくなる不具合、預かり修理・交換で対応――店頭販売は一時停止 - ITmedia +D モバイル
・ソフトバンク：パナソニック製携帯を無償修理 - 毎日ｊｐ(毎日新聞)
　# 822Pな方、ご確認を

・「歌姫」「セレブ」からのポルノスパムに注意　トロイの木馬に感染の恐れ - ITmedia エンタープライズ
　# 基本的にスパムのリンクには一切触れてはいけません

・「PLAYSTATION Store」に不正アクセスの可能性　ユーザーのパスワードが勝手に変更された恐れ - ITmedia News
　# PLAYSTATION Storeご利用の方、ご確認を

・Adobe、無料のオンライン版Photoshopをβ公開 - ITmedia News
・オンラインでどこまでできる？　Photoshop Expressを使ってみた - ITmedia Biz.ID
・アドビの無料オンライン画像編集ソフト『Photoshop Express』 | WIRED VISION
・Adobe - Adobe Press Room: For immediate release
　# これは使わねば…

・デジモノ家電を読み解くキーワード：「Bluetooth」――携帯からゲーム機まで、広がる活用範囲 - ITmedia +D LifeStyle
　# 未だにMac OS XがA2DPに対応していないのが不可思議…

・つい口に出る「微妙」な日本語：第8回 「オレの若い頃は」――過去はどうでもいいの！ - ITmedia Biz.ID
　# う………昔話はやめようっと…

・3分LifeHacking：登録不要ですぐ使えて、無料――最大400Mバイト～5Gバイトの大容量ファイル転送サービス4選 - ITmedia Biz.ID
・ユーザー登録不要で100Mバイトまでファイル送信　「ビッグメール」 - ITmedia News
・ビッグメール【BIGMAIL】-無料で大容量ファイルを転送・送信できる
　# これは要チェック！

・Mac向け偽セキュリティソフトが改名？　「iMunizator」が出現 - ITmedia News
　# Macな皆様、十分にご注意を…

・YouTubeに初の音楽著作権包括許諾・JRC　スピッツやラルクもOK - ITmedia News
　# あとはJASRACか…

・“相手の声が聞こえない”などの不具合を改善――「W56T」「W54S」「W54SA」の最新ケータイアップデート - ITmedia +D モバイル
　# W56T、W54S、W54SAな方、ご確認を

・実写版『ドラゴンボール』は3部作? 早くも続編決定か | エンタテインメント | マイコミジャーナル
　# まずは一作目…

・Firefox 2.0系の最新版「Firefox 2.0.0.13」が公開 | パソコン | マイコミジャーナル
　# なんか勝手にアップしてました

・ブログの4割は「迷惑ブログ」――ニフティ調査 - ITmedia エンタープライズ
　# そうそう、やたらと無意味なTBやコメント入れてくるスパムブログが多すぎます

・山田祥平の「こんなノートを使ってみたい」：アップルが考える「ポータブルバリュー」 (1/2) - ITmedia D PC USER
　# やっぱりサブノートMacが出るのを待つよりもiPod touchを早く活用すべきかな

Science News | March 28(3), 2007

約30万個の分散データベース群を高速に統合検索する技術を開発 | 独立行政法人 理化学研究所プレスリリース

PosMed - Positional MEDLINE

Statistical search on the Semantic Web.
Norio Kobayashi, Tetsuro Toyoda.
Bioinformatics 24, 1002-1010 (2008) | doi:10.1093/bioinformatics/btn054

Motivation: Statistical analysis of links on the Semantic Webis important for various evaluation purposes such as quantifyingan individual's scientific research output based on citationlinks. SPARQL has been proposed as a standardized query languagefor the Semantic Web and is intuitively understandable; however,it does not adequately support statistical evaluation of semanticlinks.

Results: We have extended SPARQL to a novel Resource DescriptionFramework (RDF) query language termed General and Rapid AssociationStudy Query Language (GRASQL) to generate inferences connectingsemantic Boolean-based deduction and statistical evaluationof RDF resources. We have verified the descriptive capabilityof GRASQL by writing GRASQL queries for practical biomedicalsearch patterns including in silico positional cloning studiesand for ranking researchers in a specific domain of expertiseby introducing k index, the number of papers containing specifickeywords that are published in a fixed period by a researcher.We have also developed a search engine termed General and RapidAssociation Study Engine (GRASE), which executes a restrictedvariety of GRASQL queries by requesting a dynamic and comprehensiveevaluation of statistical significance of intersections betweeneach group of documents assigned to URIs and those documentsmatching user-specified keywords and omics conditions. By performingpractical in silico positional cloning searches with GRASE,we show the relevance of our approach on the Semantic Web forbiomedical knowledge discovery problem solving.

　# へぇ…こんなのあるの知らなかった…

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ネムリユスリカ：幼虫が干からびても生き抜く謎、解明 - 毎日ｊｐ(毎日新聞) (4/7追加)

農業生物資源研究所 - プレスリリース - 干からびた生物(昆虫)が元どおりに生き返るメカニズムを物質科学の手法で解明

Vitrification is essential for anhydrobiosis in an African chironomid, Polypedilum vanderplanki.
Minoru Sakurai, Takao Furuki, Ken-ichi Akao, Daisuke Tanaka, Yuichi Nakahara, Takahiro Kikawada, Masahiko Watanabe, Takashi Okuda.
Proc. Natl. Acad. Sci. USA, Early Edition | doi:10.1073/pnas.0706197105

Anhydrobiosis is an extremely dehydrated state in which organismsshow no detectable metabolism but retain the ability to reviveafter rehydration. Thus far, two hypotheses have been proposedto explain how cells are protected during dehydration: (i) waterreplacement by compatible solutes and (ii) vitrification. Thepresent study provides direct physiological and physicochemicalevidence for these hypotheses in an African chironomid, Polypedilumvanderplanki, which is the largest multicellular animal capableof anhydrobiosis. Differential scanning calorimetry measurementsand Fourier-transform infrared (FTIR) analyses indicated thatthe anhydrobiotic larvae were in a glassy state up to as highas 65°C. Changing from the glassy to the rubbery state byeither heating or allowing slight moisture uptake greatly decreasedthe survival rate of dehydrated larvae. In addition, FTIR spectrashowed that sugars formed hydrogen bonds with phospholipidsand that membranes remained in the liquid-crystalline statein the anhydrobiotic larvae. These results indicate that larvaeof P. vanderplanki survive extreme dehydration by replacingthe normal intracellular medium with a biological glass. Whenentering anhydrobiosis, P. vanderplanki accumulated nonreducingdisaccharide trehalose that was uniformly distributed throughoutthe dehydrated body by FTIR microscopic mapping image. Therefore,we assume that trehalose plays important roles in water replacementand intracellular glass formation, although other compoundsare surely involved in these phenomena.

　# トレハロースの局在部位とその物理的な状態を調べたそうです

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Biotechnology Japan | 日米の眼科研究者ら、塩基数21以上の二重鎖RNAがToll様受容体3と結合して加齢黄斑変性症で起こる異常な血管新生を抑制することを発見

Sequence- and target-independent angiogenesis suppression by siRNA via TLR3.
Mark E. Kleinman, Kiyoshi Yamada, Atsunobu Takeda, Vasu Chandrasekaran, Miho Nozaki, Judit Z. Baffi, Romulo J. C. Albuquerque, Satoshi Yamasaki, Masahiro Itaya, Yuzhen Pan, Binoy Appukuttan, Daniel Gibbs, Zhenglin Yang, Katalin Karikó, Balamurali K. Ambati, Traci A. Wilgus, Luisa A. DiPietro, Eiji Sakurai, Kang Zhang, Justine R. Smith, Ethan W. Taylor, Jayakrishna Ambati.
Nature, Advance online publication | doi:10.1038/nature06765

Clinical trials of small interfering RNA (siRNA) targeting vascular endothelial growth factor-A (VEGFA) or its receptor VEGFR1 (also called FLT1), in patients with blinding choroidal neovascularization (CNV) from age-related macular degeneration, are premised on gene silencing by means of intracellular RNA interference (RNAi). We show instead that CNV inhibition is a siRNA-class effect: 21-nucleotide or longer siRNAs targeting non-mammalian genes, non-expressed genes, non-genomic sequences, pro- and anti-angiogenic genes, and RNAi-incompetent siRNAs all suppressed CNV in mice comparably to siRNAs targeting Vegfa or Vegfr1 without off-target RNAi or interferon-α/β activation. Non-targeted (against non-mammalian genes) and targeted (against Vegfa or Vegfr1) siRNA suppressed CNV via cell-surface toll-like receptor 3 (TLR3), its adaptor TRIF, and induction of interferon-γ and interleukin-12. Non-targeted siRNA suppressed dermal neovascularization in mice as effectively as Vegfa siRNA. siRNA-induced inhibition of neovascularization required a minimum length of 21 nucleotides, a bridging necessity in a modelled 2:1 TLR3–RNA complex. Choroidal endothelial cells from people expressing the TLR3 coding variant 412FF were refractory to extracellular siRNA-induced cytotoxicity, facilitating individualized pharmacogenetic therapy. Multiple human endothelial cell types expressed surface TLR3, indicating that generic siRNAs might treat angiogenic disorders that affect 8% of the world's population, and that siRNAs might induce unanticipated vascular or immune effects.

　# ランダム配列によるsiRNAでも脈絡膜血管新生が抑制されたそうな

Science News | March 28(2), 2008

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asahi.com： 理研脳科学総合研究センター長に利根川進氏 - サイエンス

ノーベル受賞の利根川教授、理研センター長に : 科学 : YOMIURI ONLINE（読売新聞）

理研：次の脳科学総合研究センター長に利根川氏 - 毎日ｊｐ(毎日新聞)

脳科学総合研究センター次期センター長に利根川進MIT教授 | 独立行政法人 理化学研究所プレスリリース
　# へ？マジですか？…けど、センター長でMIT兼務ってOKなの？

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人類、定説より５０万年早く欧州へ…スペインで証拠の化石 : 科学 : YOMIURI ONLINE（読売新聞）

The first hominin of Europe.
Eudald Carbonell, José M. Bermúdez de Castro, Josep M. Parés, Alfredo Pérez-González, Gloria Cuenca-Bescós, Andreu Ollé, Marina Mosquera, Rosa Huguet, Jan van der Made, Antonio Rosas, Robert Sala, Josep Vallverdú, Nuria García, Darryl E. Granger, María Martinón-Torres, Xosé P. Rodríguez, Greg M. Stock, Josep M. Vergès, Ethel Allué, Francesc Burjachs, Isabel Cáceres, Antoni Canals, Alfonso Benito, Carlos Díez, Marina Lozano, Ana Mateos, Marta Navazo, Jesús Rodríguez, Jordi Rosell, Juan L. Arsuaga.
Nature 452, 465-469 (2008) | doi:10.1038/nature06815

The earliest hominin occupation of Europe is one of the most debated topics in palaeoanthropology. However, the purportedly oldest of the Early Pleistocene sites in Eurasia lack precise age control and contain stone tools rather than human fossil remains. Here we report the discovery of a human mandible associated with an assemblage of Mode 1 lithic tools and faunal remains bearing traces of hominin processing, in stratigraphic level TE9 at the site of the Sima del Elefante, Atapuerca, Spain. Level TE9 has been dated to the Early Pleistocene (approximately 1.2–1.1 Myr), based on a combination of palaeomagnetism, cosmogenic nuclides and biostratigraphy. The Sima del Elefante site thus emerges as the oldest, most accurately dated record of human occupation in Europe, to our knowledge. The study of the human mandible suggests that the first settlement of Western Europe could be related to an early demographic expansion out of Africa. The new evidence, with previous findings in other Atapuerca sites (level TD6 from Gran Dolina), also suggests that a speciation event occurred in this extreme area of the Eurasian continent during the Early Pleistocene, initiating the hominin lineage represented by the TE9 and TD6 hominins.

　# 思っていたよりも早い時期に応酬まで人類が到達していたということか

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北海道の冬、２１世紀末に３度上昇…気象庁が予測 : 科学 : YOMIURI ONLINE（読売新聞）

気温：１００年後、北海道で３度以上上昇－－気象庁予測 - 毎日ｊｐ(毎日新聞)
　# 近い将来、北海道にも梅雨がやってくるかもしれません

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バイオ燃料技術革新計画：協議会が正式発表 - 毎日ｊｐ(毎日新聞)
　# まさか食糧を原料に作ることを基本に策定していないだろうな

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筑波大：「笑いと遺伝子」研究で世界初の博士号　国際科学振興財団・林主任研究員 - 毎日ｊｐ(毎日新聞)

Laughter Regulates Gene Expression in Patients with Type 2 Diabetes.
Takashi Hayashi, Osamu Urayama, Koichi Kawai, Keiko Hayashi, Shizuko Iwanaga, Masayuki Ohta, Toshiro Saito, Kazuo Murakami.
Psychother Psychosom 75, 62-65 (2006) | DOI: 10.1159/000089228

Laughter modulates prorenin receptor gene expression in patients with type 2 diabetes.
Takashi Hayashi, Osamu Urayama, Miyo Hori, Shigeko Sakamoto, Uddin Mohammad Nasir, Shizuko Iwanaga, Keiko Hayashi, Fumiaki Suzuki, Koichi Kawai, Kazuo Murakami.
Journal of Psychosomatic Research 62, 703-706 (2007) | doi:10.1016/j.jpsychores.2007.01.010

Laughter up-regulates the genes related to NK cell activity in diabetes.
Takashi HAYASHI, Satoru TSUJII, Tadao IBURI, Tamiko TAMANAHA, Keiko YAMAGAMI, Rieko ISHIBASHI, Miyo HORI, Shigeko SAKAMOTO, Hitoshi ISHII, Kazuo MURAKAMI.
Biomedical Research 28, 281-285 (2007) | doi:10.2220/biomedres.28.281
　# いくつか論文は出ているようです

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脳の「匂い地図」を形成する分子メカニズムの解明へ前進 | 独立行政法人 理化学研究所プレスリリース

BIG-2 Mediates Olfactory Axon Convergence to Target Glomeruli.
Tomomi Kaneko-Goto, Sei-ichi Yoshihara, Haruko Miyazaki, Yoshihiro Yoshihara.
Neuron 57, 834-846 (2008) | DOI:10.1016/j.neuron.2008.01.023

Olfactory sensory neurons expressing a given odorant receptor converge axons onto a few topographically fixed glomeruli in the olfactory bulb, leading to establishment of the odor map. Here, we report that BIG-2/contactin-4, an axonal glycoprotein belonging to the immunoglobulin superfamily, is expressed in a subpopulation of mouse olfactory sensory neurons. A mosaic pattern of glomerular arrangement is observed with strongly BIG-2-positive, weakly positive, and negative axon terminals in the olfactory bulb, which is overlapping but not identical with those of Kirrel2 and ephrin-A5. There is a close correlation between the BIG-2 expression level and the odorant receptor choice in individual sensory neurons. In BIG-2-deficient mice, olfactory sensory neurons expressing a given odorant receptor frequently innervate multiple glomeruli at ectopic locations. These results suggest that BIG-2 is one of the axon guidance molecules crucial for the formation and maintenance of functional odor map in the olfactory bulb.

　# 嗅覚は生物にとって非常に重要且つ原始的なセンサーの一つです

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B細胞の分化・増殖を制御する細胞内シグナルを解明 | 独立行政法人 理化学研究所プレスリリース

Erk Kinases Link Pre-B Cell Receptor Signaling to Transcriptional Events Required for Early B Cell Expansion.
Tomoharu Yasuda, Hideki Sanjo, Gilles Pagès, Yohei Kawano, Hajime Karasuyama, Jacques Pouysségur, Masato Ogata, Tomohiro Kurosaki.
Immunity, Online Ahead of Issue | doi:10.1016/j.immuni.2008.02.015

The pre-B cell receptor (pre-BCR) plays a crucial role in the development of immature B cells. Although certain aspects of proximal pre-BCR signaling have been studied, the intermediate signal transducers and the distal transcription modulators are poorly characterized. Here, we demonstrate that deletion of both Erk1 and Erk2 kinases was associated with defective pre-BCR-mediated cell expansion as well as a block in the transition of pro-B to pre-B cells. Phosphorylation of transcription factors Elk1 and CREB was mediated by Erk, and a dominant-negative mutation in the Erk-mediated phosphorylation sites of Elk1 or CREB suppressed pre-BCR-mediated cell expansion as well as expression of genes including Myc, which is involved in the cell-cycle progression. Together, our results identify a crucial role for Erk kinases in regulating B cell development by initiating transcriptional regulatory network and thereby pre-BCR-mediated cell expansion.

　# なんかよく眼にするようになってきたな、Erk1/2…

Science News | March 28(1), 2008

# 平日に溜めるとえらいことになると再認識…

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科学者が新発見！ ヘラ鹿の角の秘密 : Gizmodo Japan（ギズモード・ジャパン）

How giant amplifiers can help Mr Moose hear for miles | the Daily Mail
　# ま、一種の骨伝導…

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量子情報ネットワーク実現につながる新実験：画像ギャラリー | WIRED VISION

Mapping photonic entanglement into and out of a quantum memory.
K. S. Choi, H. Deng, J. Laurat, H. J. Kimble.
Nature 452, 67-71 (2008) | doi:10.1038/nature06670

Developments in quantum information science rely critically on entanglement―a fundamental aspect of quantum mechanics that causes parts of a composite system to show correlations stronger than can be explained classically. In particular, scalable quantum networks require the capability to create, store and distribute entanglement among distant matter nodes by means of photonic channels. Atomic ensembles can play the role of such nodes. So far, in the photon-counting regime, heralded entanglement between atomic ensembles has been successfully demonstrated through probabilistic protocols. But an inherent drawback of this approach is the compromise between the amount of entanglement and its preparation probability, leading to intrinsically low count rates for high entanglement. Here we report a protocol where entanglement between two atomic ensembles is created by coherent mapping of an entangled state of light. By splitting a single photon and performing subsequent state transfer, we separate the generation of entanglement and its storage. After a programmable delay, the stored entanglement is mapped back into photonic modes with overall efficiency of 17%. Together with improvements in single-photon sources, our protocol will allow 'on-demand' entanglement of atomic ensembles, a powerful resource for quantum information science.

　# こういう仕事をするにはこんな機械が必要…しかし凄いな

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覆面していても顔認識できる新しいアルゴリズム | WIRED VISION
　# これが実用化していたら、目の前の改札を通り過ぎる犯人を逃すような失態もなくなるだろうに

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人体内部を検索・動的表示できるマップ『BodyMaps』 | WIRED VISION

BodyMaps
　# 凄いな、これ…

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「工学部を選んだことを後悔する理由」トップ5 | WIRED VISION
　# 工学部出身の方、どう思われます？

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ポイントした物を持ってきてくれるロボット | WIRED VISION

GT | Robot Fetches Objects With Just a Point and a Click
　# いつからだっけ？こんなにめまぐるしくロボット工学が発達し始めたのは…

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昆虫を偵察サイボーグ化：成虫まで生かすことに成功 | WIRED VISION

Cyborg insects 'born' in DARPA project
　# DARPA、すげぇ…

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崩壊続く、南極の巨大棚氷 | WIRED VISION

Antarctic Ice Shelf Disintegrating As Result Of Climate Change, Scientists Say | News Center | University of Colorado at Boulder
　# 加速し始めた温暖化は、今すぐにCO₂排出を止めてもすぐに収まるものではありません

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『Segway』発明家による、高効率の蒸留型浄水器 | WIRED VISION
　# 「何か素晴らしいものを発明することは、問題を半分だけ解決するようなもので、残りの半分の問題は、必要とする人に役に立つ方法で発明品を渡すことだ」
　# 聞かせてやりたい人が何人も…

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“バイオチップ携帯”実現への第一歩──ドコモと東大が分子配送実験に世界初成功 - ITmedia +D モバイル

報道発表資料 : 分子通信の実現に向けた分子配送実験に成功 | お知らせ | NTTドコモ
　# 21st IEEE International Conference on Micro Electro Mechanical Systemsで発表したようです
　# Small 4(4) (2008)に載るようですが、Early Viewには未掲載です
　# いまいちこのプレスリリースの説明では理解不能…

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ニコン顕微鏡写真コンテストに入賞した10作品 | WIRED VISION

Nikon Small World - Photomicrography Competition
　# ご覧あれ！ミクロな世界の美しさ！

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asahi.com： マウスのｉＰＳ細胞、供給開始　理研 - サイエンス

京大・山中教授のｉＰＳ細胞、国内外の研究者に分配開始 : 科学 : YOMIURI ONLINE（読売新聞）

マウスからできた万能細胞を提供　京大と理研 - MSN産経ニュース

マウスiPS細胞の分配事業を3月26日から開始 | 独立行政法人 理化学研究所プレスリリース
　# マウスiPS細胞供給開始だそうです…ヒトはまだです

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asahi.com： シャトル「エンデバー」が帰還　土井さん乗せ - サイエンス

土井さん無事帰還…エンデバーがケネディ宇宙センターに : 科学 : YOMIURI ONLINE（読売新聞）
　# 無事のご帰還なによりでした…ご苦労様です

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ネズミにも“道具”の概念、理研グループが突き止める : 科学 : YOMIURI ONLINE（読売新聞）

ネズミ：道具使った！くま手でエサ　訓練５７日、成功率７５％－－理研チーム - 毎日ｊｐ(毎日新聞)

ネズミが道具を使った！　くま手で餌引き寄せ、パクッ - MSN産経ニュース

ネズミの一種“デグー”を訓練して道具機能を理解させることに成功 | 独立行政法人 理化学研究所プレスリリース

Tool-Use Training in a Species of Rodent: The Emergence of an Optimal Motor Strategy and Functional Understanding.
Kazuo Okanoya, Naoko Tokimoto, Noriko Kumazawa, Sayaka Hihara, Atsushi Iriki.
PLoS ONE 3, e1860 (2008) | doi:10.1371/journal.pone.0001860

Background
Tool use is defined as the manipulation of an inanimate object to change the position or form of a separate object. The expansion of cognitive niches and tool-use capabilities probably stimulated each other in hominid evolution. To understand the causes of cognitive expansion in humans, we need to know the behavioral and neural basis of tool use. Although a wide range of animals exhibit tool use in nature, most studies have focused on primates and birds on behavioral or psychological levels and did not directly address questions of which neural modifications contributed to the emergence of tool use. To investigate such questions, an animal model suitable for cellular and molecular manipulations is needed.

Methodology/Principal Findings
We demonstrated for the first time that rodents can be trained to use tools. Through a step-by-step training procedure, we trained degus (Octodon degus) to use a rake-like tool with their forelimbs to retrieve otherwise out-of-reach rewards. Eventually, they mastered effective use of the tool, moving it in an elegant trajectory. After the degus were well trained, probe tests that examined whether they showed functional understanding of the tool were performed. Degus did not hesitate to use tools of different size, colors, and shapes, but were reluctant to use the tool with a raised nonfunctional blade. Thus, degus understood the functional and physical properties of the tool after extensive training.

Conclusions/Significance
Our findings suggest that tool use is not a specific faculty resulting from higher intelligence, but is a specific combination of more general cognitive faculties. Studying the brains and behaviors of trained rodents can provide insights into how higher cognitive functions might be broken down into more general faculties, and also what cellular and molecular mechanisms are involved in the emergence of such cognitive functions.

　# フィンチなんかには枝を道具として使いこなすのもいますけど、短い習得期間や応用性まで含めると凄いですね

戦友亦一人去

今日、YSさんが退職の挨拶に来た。終了したプロジェクトや、WKラボの運営、特許、その他諸々でやたらと世話になりつつ、返せた恩は皆無に等しい…。本当に優秀な、まさに戦友だった。本当にご苦労さまでした、といつもにも増して心底伝えたいと思った。

年度最後のラボセミナー

本日、今年度最後のラボセミナーを終えてきました。

今回は、あまりたくさんの論文をフィーチャーせず、一本の論文のストーリーを紹介することで、あまり複雑にせずに分かりやすく紹介しようと思ったのですが、如何せんあまり時間もとれず、おまけに昨晩の突然のミーティング招集といつものダラダラ進行のおかげでさらに時間をとられて、あまり広範なところまで調べておくことが出来なかったのが心残りです。

お題は「SATB1 reprogrammes gene expression to promote breast tumour growth and metastasis. Nature 452, 187-193 (2008) | doi:10.1038/nature06781」。以下使用スライドです。
# きっと前回よりは分かりやすかったんじゃないかと勝手に想像…

Security Update 2008-002 1.1

Security Update 2008-002に変更があったようで、1.1にバージョンアップしています。
Aperture 2.0をMac OS X 10.5.2上で使用する際に「プリンター設定...」ボタンに問題があった模様です。
対象は

• Mac OS X 10.5.2でAperture 2.0インストール済み且つSecurity Update 2008-002 1.0を適用している
• Mac OS X 10.5.2でSecurity Update 2008-002 1.0を適用していない

場合だそうです。以下、Apple Product Securityからのメールを引用。

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Apple-SA-2008-03-26 Security Update 2008-002 v1.1

Security Update 2008-002 v1.1 addresses reliability issues with the "Printer Settings..." button in Aperture 2.0 on systems running Mac OS X v10.5.2. No applications other than Aperture 2.0 are affected.

This update is only for systems with:
- - Mac OS X v10.5.2 and Aperture 2.0 and Security Update 2008-002
- - Mac OS X v10.5.2, but Security Update 2008-002 has not been installed

There is no change to the security content provided in Security Update 2008-002. The security content of Security Update 2008-002 and Security Update 2008-002 v1.1 is available from: http://support.apple.com/kb/HT1249

Security Update 2008-002 v1.1 is available from the Software Update pane in System Preferences for systems with:
- - Mac OS X v10.5.2 and Aperture 2.0 and Security Update 2008-002
- - Mac OS X v10.5.2, but Security Update 2008-002 has not been installed

Security Update 2008-002 v1.1 may also be obtained from Apple's Software Downloads web site: http://www.apple.com/support/downloads/

For Mac OS X v10.5.2
The download file is named: "SecUpd2008-002.v1.1.dmg"
Its SHA-1 digest is: 9e50032326611245bb5382099a60cbcd4d1852c9

For Mac OS X Server v10.5.2
The download file is named: "SecUpdSrvr2008-002.v1.1.dmg"
Its SHA-1 digest is: 73f6085ab0660018635fef28df0589754f50a69a

Information will also be posted to the Apple Security Updates web site: http://support.apple.com/kb/HT1222

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立て込んでおりまして…

いろいろと立て込んでおりまして、思うように情報が得られない状況です。
金曜日には、復活出来ると思いますので、しばし、ご猶予くださいませ。

仕事ML閉鎖

今日、終了したプロジェクトのMLを閉鎖しました。

このプロジェクトは、異様なほど野心的でかつ後発であったので、チャレンジングだったことは確かだったのですが、成功すれば相当に大きなリターンを期待できるものでした。ただ、知れば知るほど、その難しさへの理解が深まり、さらに成果が残せない不安との戦いとなって、いつしか最大の敵はストレスとなっていました。そして、今回の会社での組織改編という大きな壁に当たり、敢えなく終了となりました。

ただ、納得できないのは、御大はこのプロジェクトが高リスク・高リターンであったことを本当に理解していたのか、ということ。最後には他人事のように、我々メンバーが成功しなかったことが悪いんだと、いや「俺の夢をぶちこわしやがって」といわんばかりに、やんわりと攻めの言葉を投げかけてくるのを聞くにつけ、もはやこの人と一緒には冒険的な研究は出来ないのだ、と深く心に刻みました。敢えて言うならば、それが最大の成果だったのかもしれません。

これから一週間のうちに人が激減し、組織も変わり、年度が替わります。来週の今日には全てが変わってしまいます。そんなことを思うと、異様なほど気分が憂鬱になってきてしまう今日この頃です。せめてもの救いは、日々恐ろしいほどの勢いで咲き乱れ始めた会社の桜の花…。