中田真秀(なかたまほ)のブログ

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検索機能をつけました 巨大な小分子の最安定構造+波動関数データベース

2016-08-24 16:22:23 | 日記
PubchemQCに検索機能をつけました

とりあえずトップページの一番上の検索窓から"water"とか入力してみてください。
すると、データベースの中にある、水分子のgamess input/outputが出てきます。このinputでは、構造最適化を既に済ませてます。また、qchem, gaussian, nwchem, smash, fireflyのinputも機械的に生成してくれますので、自分の好みの量子化学計算のパッケージで確かめたい場合はどうぞ。

もし、データベースの中に無ければ(計算が失敗したり、計算がまだ流れていない場合など)、
下の方の検索窓から調べてください。とりあえずopenbabelで作った座標がでてきます。
さらに、同じように、inputも生成されて出てきます。ready-to-runもの、つまりそのまま計算流せます。ただ、座標を作るのは計算重めなので連続押しは禁止です。

とりあえずここで公開してみてどの程度まで負荷がかかるか見てみたいなと。

よろしくお願いいたします。