PubchemQC Project 10万分子突破! 116869分子

PubchemQC 10万分子突破!

* 10万分子計算出来ました! 116869分子すごい
* サーバーを新しく立ち上げた。
* ログを綺麗にするため一旦再計算し直すことにした。
** ログに警告が多く入るものがあり、無駄にサイズが大きくなっていたものがどうしようもない。
** 再計算する、しないにかかわらず、インプットファイルがわずかに書きなおされていた。
** 構造最適化は数段階経ているため、その部分は再計算不要なのでそこまで時間はかからないと思われる...ただTDDFTが結構時間がかかるものがある。

Run GAMESS 2013 May01 R1 on Fujitsu FX10

I have just uploaded build script for GAMESS 2013 May01 R1 version

* go.gamess.fx10.sh : build script
* patch-gamess-fx10 : patch file

This patch and script is based on http://trac.cms-initiative.jp/wakate6/wiki/FreeSoftwareの導入方法

Known Issues:
* Only MPI is supported; no native DDI is supported.
* One Sparc64 IXfx has 16 cores and on each node, data server and compute process should be
launched in a pair. so only 8 compute process will run on each node. Is it a correct configuration??