CD4は白血球の種類の1つで、細菌やウイルスを攻撃する命令を出し、免疫全体を調整している。免疫の司令塔とも言われる。正しくはCD４陽性リンパ球と言い、数は多いほど良いとされる（通常７００～１５００程度）。
HIVは主にこのCD4陽性リンパ球に侵入、内部でウイルスが複製されるとCD4は壊されてしまう。
HIV感染者が無治療でいるとCD4はどんどん壊され、２００を切ると、日和見感染症というHIVに特有の症状を引き起こす確率が高まる。
２．HIVウイルス量
血漿１ml中にエイズウイルスがどれだけいるかを表わす。低い方が良い。検査データの誤差が大きく、例えば1万と2万でも誤差範囲のことがあり、2万は「２×１０4（１０の4乗）」と呼び、この「○乗」が増減した場合にウイルス量が増えた、減ったという判断をすることができる。
感染後６ヶ月を過ぎた頃からHIVのウイルス量は大体一定の値を示すようになり、この時点をセットポイントと呼ぶ。セットポイントの時点でのウイルス量が高いほど、病気の進行するスピードも速いといわれる。
このHIVウイルス量を抑えることが最近の抗HIV治療（HAART)の目的。治療中は検出限界以下（５０以下）を目指し、これが達成されれば耐性ウイルスの出現を抑え、免疫状態の悪化を防ぐことができると言われている。なお、検出限界以下の場合、データ表には"UD"（undetectable）と記される。
３．GOT（AST）
GPT（ALT）
それぞれ肝臓の細胞に含まれる酵素のこと。ウイルス性肝炎などで肝臓が攻撃され肝細胞が壊されると、これらの酵素も血中に流れてきて検査結果が上がる。つまり、これらの数値が高いほど肝臓が壊されていると言うことで、低く抑えるのが良い（正常値についてはいくつかの意見があるが、それぞれ３５以下、３０以下くらいが望ましい）。
HIV（エイズウイルス）とHCV（C型肝炎ウイルス）の両方に感染している重複感染者の場合、C型肝炎だけの人よりも肝炎の進行が速く、特にこれらの肝機能を表わす数値に注意が必要。現に、日本感染症学会は２００６年１月２６日、厚生労働省健康局疾病対策課からの報告の下、ホームページ上でまた，HIVに対する治療方法の進歩に伴い，HIV・HCV重複感染者の死因の約半数が，非AIDS関連死であり，特にその多くをHCVによる肝硬変が占めているとの報告があります．
という情報を示し、早期の肝臓治療の必要性を訴えている。
→（日本感染症学会の該当ページはこちらをクリック）
HIVとC型肝炎の重複感染の場合、GOT（AST）、GPT（ALT）が１００を越えている場合、肝臓治療を考慮する必要があると言われている。また、それより低い場合でも治療をしなければいけない場合もある。肝臓に負担をかける抗HIV治療を長く続けていくためにも、HIV感染者は肝臓の治療を最優先で行う必要がある。
さらに、エイズ予防情報ネットホームページ には厚生労働科学研究班（エイズ対策研究事業 主任研究者：小池和彦東京大学医学部教授）が作成した「HIV・HCV重複感染時の診療ガイドライン」がある。詳しくはそちらも参照のこと
