感染症内科への道標

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ノカルジア属の表現型・遺伝子型薬剤耐性解析(イスラエル)

2023-10-15 | 微生物:細菌・真菌

 ノカルジア感染症:概要(2022:国立国際医療研究センター)

日本の25施設からの臨床分離株の解析 2021
Identifcation and antimicrobial susceptibility profles of Nocardia species clinically isolated in Japan Scientific reports, 2021

ノカルジア症 Review (2021)
How do I manage nocardiosis? Clinical microbiology and infection, 2021

本論文の要点:
・ノカルジアの臨床分離株をイスラエル(2020-2022)9施設から収集/解析
・N. cyriacigeorgica (36%), N. farcinica (16%), N. wallacei (13%), 
   N. abscessus (9%)
・リネゾリドは全て感性、アミカシン91%、ST合剤93%で感性

要約:
・イスラエル(2020-2022)9施設から収集/解析
同定:MALDI-TOF MS (VITEK MS) , WGS(同定・薬剤耐性遺伝子解析)
薬剤感受性:Sensititre RAPMYCO microdilution panel

・累計138 株:
Norcardia cyriacigeorgica (36%:50),
N. farcinica (16%: 22),
N. wallacei (13%, 18),
N. abscessus (9%: 13) ,
N.brasiliensis (8%: 11),
N. carnea (7%: 9),
・由来 呼吸器検体(75%), 軟部組織(19%), 血液(6%)
・菌名はMALDI-TOFとWGSで99%一致
(1株のみ MALDI-TOFでN.neocaledoniensis→WGS: N. otitidiscaviarum)

・リネゾリド:全株で感性
・アミノグリコシド(amikacin/tobramycin)Amikacin: 91%で感性
:Tobramycin: N.farcinica/N.wallacei で耐性(aph(2”))
:Amicacin: N.wallacei (72%で耐性) 16S r RNA m1A1408 methyltransferase

・ST合剤:93%で感性
:N.wallacei, 7株, N.farcinica 2株で耐性

・βラクタム:Amoxicillin/clavulanate, ceftriaxone, imipenem
:N. farcinica :全株でceftriaxone耐性(bla FAR-1),
N.cyriacigeorgia:Amoxicillin/clavulanate耐性 (bla AST-1)

・Fluoroquinolones (Ciprofloxacin, moxifloxacin)
:moxifloxacin N.farcinica (80%), N. brasiliensis (100%), N. wallacei (100%), N. cyriacigeorgica (5%), N. abscessus (0%)
: Ciprofloxacin N. carnea (100%), N. wallacei (83%), N. cyriacigeorgica (5%), N. farcinica (55%), N. brasiliensis (0%), N. abscessus (0%)

・Macrolides: Clarithromycin 12%のみ感性


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