ゲノムを含む
トランスクリプトーム
プロテオームといった
網羅的分子情報を応用した
以下に挙げる医療の将来に
興味があります。
ゲノム制御医科学
生体防御医学研究
分子腫瘍学
腫瘍・分子病理
ゲノム医学研究
薬理ゲノミクス
癌研究ゲノム
ゲノム科学研究
遺伝子多型研究
トランスクリプトーム
プロテオームといった
網羅的分子情報を応用した
以下に挙げる医療の将来に
興味があります。
ゲノム制御医科学
生体防御医学研究
分子腫瘍学
腫瘍・分子病理
ゲノム医学研究
薬理ゲノミクス
癌研究ゲノム
ゲノム科学研究
遺伝子多型研究
GenePixのデータを「R+BioConductor」で
処理するのに苦労しています。
２色法で
Dye swap用に取ったデータ（2枚）を
preprocessingしています。
以前はGeneSpringでしていた処理を
BioConductorでしたいのです。
Gpr fileを２つ読み込み（read.GenePix）、
dye swapとLowessにより正規化したいのです。
Lowessでは、
20％のデータをsmoothingに使う設定と
低い値のcutoffを0.01に設定しています。
これにより、正規化した１組のratioと
raw, controlの値を欲しいのです。
“Bioinformatics and Computational
Biology Solutions using R and Bioconductor”を
読む限り、
それぞれはmarray, limmaでできると思うのですが
一連のコマンドを組み合わせるのに悩んでいます。