裏 RjpWiki

Julia ときどき R, Python によるコンピュータプログラム,コンピュータ・サイエンス,統計学

度数0を含む度数分布図を描く

2011年04月05日 | ブログラミング

たとえば,x <- c(5, 5, 7, 6, 5, 2, 4, 4, 4, 1, 6, 5, 1, 7, 5) のようなデータがある。このデータは 0~7までの値を取るはずだが,0 と 3 は出現しない。棒グラフを描くときに,barplot(table(x)) としたのでは,データの存在する,1, 2, 4, 5, 6, 7 に対応する棒しか描かれない。0 と 3 も描いて欲しいのにというときには,以下のようにする。levels 引数に,描き始めと描き終わりの数値を指定する。

barplot(table(factor(x, levels=0:7)))

実際のデータにある最小値と最大値だけをカバーする(あたりまえ)だけでよいなら,barplot(table(factor(x, levels=min(x):max(x)))) とすればよい。

その他,どこまでが決め打ちで,どこまでが汎用かを決める塩梅が難しい。

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グラフの名前

2011年04月01日 | 裏 RjpWiki

このグラフの呼び名

K? (2011-04-01 (金) 03:58:55)

こちらの論文(PDF) の図4のようなグラフはなんと呼ぶのでしょうか? また、このグラフをRで作成するパッケージはありますでしょうか?
名前だけでも分かれば検索できるようになると思うので、どうぞよろしくお願いします。

聞く場所(相手)が違う。その文書を書いた人に聞けばすぐにわかることであろう。

それに,こんなところで聞いて回答を待っている間に,プログラムを書けばよい。

func <- function(x, factor=1, threshold=NA, color="gray")
{
    nr <- nrow(x)
    nc <- ncol(x)
    if (is.na(threshold)) threshold <- mean(x)+sd(x)
    threshold <- factor*sqrt(threshold)
    x <- factor*sqrt(x[nr:1,])
    theta <- seq(0, 2*pi, length=100)
    cos.x <- cos(theta)
    sin.y <- sin(theta)
    plot(c(0, nc+1), c(0, nr+1), type="n", axes=FALSE, xlab="", ylab="", asp=1)
    for (i in 1:nr) {
        segments(0, i, nc+1, i)
        for (j in 1:nc) {
            polygon(j+x[i, j]*cos.x, i+x[i, j]*sin.y, col=color[j], lwd=(x[i, j] > threshold)+1)
        }
    }
    text(0, 1:nr, labels=rownames(x), pos=2, xpd=TRUE)
    text(1:nc, nr+1, labels=colnames(x), pos=3, xpd=TRUE)
}
# test data
nc <- 12
nr <- 26
set.seed(123456789)
x <- matrix(sample(20, nr*nc, replace=TRUE), nr, nc)
color <- c("white", "gray", "white", "gray", "gray", "white", "gray", "gray", "white", "gray", "gray", "white")
colnames(x) <- letters[1:nc]
rownames(x) <- sapply(1:nr, function(i) paste(rep(LETTERS[i], sample(1:10, 1)), collapse=""))
# factor:円の大きさの縮小率,threshold:その値より大きければ太線で描く,color:色
func(x, factor=0.06, threshold=18, color=color)

 

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