臺灣と瀬田で數理生態學と妄想

翹首望東天, 神馳奈良邊. 三笠山頂上, 想又皎月圓(阿倍仲麻呂). 明日できることは今日しない

multiple alignmentメモ

2009-10-04 20:07:09 | 設定メモ
Clustalw-mpiでも遅いし、メモリーを食ってうまくいきません(5000個ー16000個)。

MUSCLEという別のアルゴリズムのソフトを
とりあえずマックで試すも超はやーい(5000個の場合)。
コメント (2)    この記事についてブログを書く
  • X
  • Facebookでシェアする
  • はてなブックマークに追加する
  • LINEでシェアする
« Rメモ | トップ | 八徳路電脳街 »
最新の画像もっと見る

2 コメント

コメント日が  古い順  |   新しい順
Unknown (miki)
2009-10-07 10:39:57
情報ありがとうございます。もう一つの方も試してみます。
返信する
今の定番 ()
2009-10-05 18:47:53
MUSCLEとMAFFTが2大定番になりつつあると思います。特にMUSCLEは良くできていますね。
返信する

コメントを投稿

設定メモ」カテゴリの最新記事