PHPでデータベースを抽象化するPDOついての詳細記事を見つけたので紹介します。
http://codezine.jp/a/article.aspx?aid=433
PDOはデータベースへの接続、操作を抽象化するクラスライブラリです。PEAR等はPHPのネイティブ関数をラッピングした物なので速度的には余り期待できませんが、PDOはPHP拡張(PHPExtension)なので速度的も十分期待できます。
カラムが多いテーブルに対しInsertやUpdate操作を行う場合や、複数データベースへのアクセス等のシチュエーションで役に立つと思います。ちなみに、PDPはデータベースへのアクセス、操作を抽象化してくれるだけで、ORマッパーのようなデータベース自体を抽象化してくれるレイヤーは提供してくれません、そこらへん勘違いなされないように・・・w