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WINGAMESSで量子化学計算(1)

2010-10-07 01:06:02 | 化学
今日もやってまいりました。趣味で量子計算のコーナー
って今回が一回目。

まずは必要なプログラムの紹介。

計算プログラム:WINGAMESS
モデリング、及び可視化プログラムWinmmostar
可視化プログラムはMacMolPltというのもあります。軌道の描画が美しいのでオヌヌメ。

基本的な計算方法として
1.Winmmostarを使ってモデリング、そこから入力ファイルの手修正
2.WINGAMESSで計算を行ない
3.可視化させて結果の評価。入力ファイルをさらに修正して1に戻る。
4.必要な分子軌道の描画、軌道エネルギーの値の評価なんかを行う。

今後の予定としては

・NMR計算を行い、化学シフトとNICS値の評価。
 これは結構ぐぐれば簡単に情報がでてきます。

・有機半導体を2分子置いて交換積分を計算し、Tight-Binding近似も交えてバンド構造を描く。
 これは少なくとも日本語のwebサイトでやってるところはないと思われる。
一応私の専門こっちだし。
 つってもまともに出来るか分からないなぁ。参考にできる文献を探してこなくっちゃ。

次はWINGAMESSじゃない別のプログラムで
・PWscfなんかの表面波基底を使ったプログラムで固体の電子状態計算なんかができれば。
 これはちょっと遠すぎる目標かも。


こういった計算プログラムが今後自分の武器として使えるようにしてみたい。
それがモチベーション。なるたけ、初心者が始めやすいような記事を書いてみようと思う。

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6 コメント(10/1 コメント投稿終了予定)

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Unknown (laughing chemist)
2010-10-09 23:27:44
とりあえず化学シフトはアテにならなすぎて笑える。
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Unknown (管理者)
2010-10-10 01:41:16
まぁ、完全に一致させようっていうのが無理よね>化学シフト

どちらかと言えば、共役系が伸びてて
環電流流れてるとおもいっきりマイナスシフトするよなぁという辺りを見るのが楽しいかなと。
返信する
Unknown (asikana321)
2011-01-25 15:09:23
カチオンとかアニオン状態を計算できるパソコンが欲しい。
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Unknown (管理者)
2011-02-08 01:05:28
>asikana321さん
えっと,分子にチャージがあったり,HF近似でやってると軌道に一つだけ電子が入ってる状態が有るとき設定ファイルがめんどいけど,gamessでもできた気が,やったこと無いからわからんけど。
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Unknown (asikana321)
2011-02-09 10:40:28
計算方法というよりは、計算の速さの問題。個人持ちのデスクトップだと6-31GのHFが限界だけど、それだとカチオンとかアニオンは議論できないんだよね。もちろん参考にはなるんだけど。
返信する
Unknown (管理者)
2011-02-09 22:50:26
>asikana321氏
あぁー,済まん勘違いしてた。
私の悪い癖でさ。

まぁ,いい。それならパソコンを買っちゃえばいいじゃないか。
という身も蓋もない解決法は置いといて。

ラジカルとかあんまり計算したこと無いからわかんないや。
機会があったら計算してみてベンチマーク記事でも書いてみますかね。
需要あるかしら。
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