臺灣と瀬田で數理生態學と妄想

翹首望東天, 神馳奈良邊. 三笠山頂上, 想又皎月圓(阿倍仲麻呂). 明日できることは今日しない

multiple alignmentメモ

2009-10-04 20:07:09 | 設定メモ
Clustalw-mpiでも遅いし、メモリーを食ってうまくいきません(5000個ー16000個)。

MUSCLEという別のアルゴリズムのソフトを
とりあえずマックで試すも超はやーい(5000個の場合)。
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2 コメント

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今の定番 ()
2009-10-05 18:47:53
MUSCLEとMAFFTが2大定番になりつつあると思います。特にMUSCLEは良くできていますね。
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Unknown (miki)
2009-10-07 10:39:57
情報ありがとうございます。もう一つの方も試してみます。
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