まずは、こちらのグラフを比較して頂きたいと思います。
１つは、厚生労働省オープンデータ、
国内の発生状況に示された「PCR検査の実施件数」のグラフ。
（2021/9/28 スクリーンショット）
下記ページの最後の方に掲載
https://www.mhlw.go.jp/stf/covid-19/kokunainohasseijoukyou.html#h2_1
もう１つは、同じく厚生労働省オープンデータ（以後、厚労省OPD）、
「PCR検査の実施件数（pcr_case_daily.csv）」のデータより、
自分で作成したグラフ。（csvファイルの参照は、2021/9/28 時点）
https://www.mhlw.go.jp/content/pcr_case_daily.csv
出来るだけ、縮尺を近づけたうえで、項目の色味も寄せてみましたので、そこそこ比較し易いかとは思います。
ご覧頂ければ、一見して大きな違いが分かるかと思います。それは、
・厚労省OPDに掲載されているグラフ → 民間検査会社（主に自費検査）の項目が無い
・厚労省OPDのcsvから作成したグラフ → 民間検査会社（主に自費検査）の項目が有る
と、いうことです。
今年の7/12以降、厚労省OPDの「PCR検査の実施件数」csvファイルには、
突如として「民間検査会社（主に自費検査）」 （以後、民間・自費検査）という検査機関の項目が登場し、
PCR検査件数全体の、およそ４０％を占めるほどの検査件数の母数が、
特に何の説明もないまま、新たに追加されたました。
この 掲載グラフ と csvファイル のデータ取り扱いに違いについては、注釈で
※３ 民間検査会社について、グラフでは「主に行政検査」を行う検査所による検査件数を掲載している。
これに加えて、令和3年7月12日分以降、「主に自費検査」を行う検査所による検査件数を、上記のオープンデータに掲載している。
と、簡単に触れられているだけです。
問題なのは、この 民間・自費検査 で判定された分の新規陽性者の数が、
同じ厚労省OPDの「新規陽性者数の推移（日別）（newly_confirmed_cases_daily.csv）」に反映されているのか否か？
どこにも説明が無いことなのです。
ちなみに「PCR検査の実施件数」と同様に、「新規陽性者数の推移（日別）」についても、
厚労省OPD掲載のグラフ と csvから作成したグラフ を並べて比較してみます。
厚労省OPD掲載グラフ
「新規陽性者数の推移（日別）（newly_confirmed_cases_daily.csv）」より作成のグラフ
グラフの期間と縮尺をして合わせて比較してみますと、
こちらは２つのグラフの間に相違はありません。
厚労省OPD掲載グラフは、そのままcsvファイルを反映したデータと言えます。
どうして厚労省は 「PCR検査の実施件数」民間・自費検査 の分については、グラフとデータで扱いが違うのでしょうか？
民間・自費検査による新規陽性者数は、公表されている「新規陽性者数の推移（日別）」に、
どのように影響与えているのか（または、いないのか）、考察していきたいと思います。
こちらのグラフをご覧下さい。
「PCR検査の実施件数（pcr_case_daily.csv）」より、各検査機関ごとの検査件数と、
「新規陽性者数の推移（日別）（newly_confirmed_cases_daily.csv）」の数字とを、
同一グラフ内に折れ線で表示しました。
（※国立感染症研究所 と 検疫所 の検査数は、該当期間内の検査数は微少なので、見易さ優先で省略しました。）
合わせて同一期間内で、２種類の陽性率、
・陽性率① … 民間・自費検査 を含めない
・陽性率② … 民間・自費検査 を含める
のグラフを併記しました。
極めて重要なことですが、
7/12以降の民間・自費検査の分を、データに含めるか否かで、
今年、７月中旬～オリンピック開催期間に激増した新規陽性者数の意味合いが、全く変わります。
・突如としてPCR検査数が倍近く増えれば → 新規陽性者数も相関して増える（但し、急な感染拡大とは言い切れない）
でしょうし、
・PCR検査数がさほど変わらず、新規陽性者数が急激にに増えれば → 陽性率が激増した（潜在的感染が増加）
（陽性率①と② の違いの意味）
と、言えるでしょう。
さてもう一度、PCR検査機関ごとの検査件数 と 新規陽性者数 のグラフをご覧下さい。
7/12以降、PCR検査「民間・自費検査」の登場と共に、新規陽性者数は急増し、
8/18には過去最高を記録します。
素朴にグラフを眺めれば、7/12以降の新規陽性者数の急増は、
民間・自費検査の上乗せ分が大きな要因となった、と見る人が多いのではないでしょうか？
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【補足・追加】
また興味深いのは、関連性の有無は別にしても、
それまで ほぼ 地方衛生研究所・保健所（以後、保健所）のPCR検査件数以下に収まっていた新規陽性者数が、
7/12を境として、保健所検査数を超えて、一気に急増していったことです。
実はこの「保健所検査件数を超過した分の新規陽性者数」という概念によって、
保健所の影響を除外した、それ以外の検査機関の ‘仮’陽性率 の分析が可能になります。
その結果として、
7/12以降の新規陽性者数の急増を成立させるには、
民間・自費検査の上乗せ分が存在しないと矛盾する、
といったことも、証明できそうなのですが…
…どうもこの辺りを簡便にweb上で説明するには、まだ力量不足で。
更に話が煩雑になりますので「保健所検査超過分・新規陽性者数」については、
縁が満ちたら、出来るかも知れません。（縁は、満ちないかも知れません。）
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それはさて置き、新規陽性者数の推移と、PCR検査機関ごとの検査件数 並びに 検査比率を、
前回の「陽性率の真実について考える」その② で行ったのと同じやり方で、
グラフ化してみましょう。
なお、ここからは、民間・自費検査ありきで、分析を進めていきます。
陽性率② と PCR検査機関ごとの検査比率（％）の推移（日別）
7/11以前を分析した前回と同様、
日曜・休日に 保健所の検査比率が増加 → 陽性率も増加
という基本構造は変わりません。
しかし、大きく変わったことは、
7/11以前で、日曜・休日に検査比率が増えるのは保健所だけでしたが、
7/12以降は、民間・自費検査が、日曜・休日の検査比率増加側に加わったことです。
まとめると、こうです。
日曜・休日（陽性率増加日）に検査比率にが増えているPCR検査機関
・地方衛生研究所・保健所
・民間検査会社（主に自費検査）
日曜・休日 に検査比率が減っているPCR検査機関
・民間検査会社（主に行政検査）
・大学等
・医療機関
保健所検査比率と陽性率の日別推移の連動は、
民間・自費検査という要素が増えたことで、7/11以前ほど露骨ではありませんが、
変わらず相関していることは把握できます。
また、民間・自費検査比率と陽性率については、保健所ほどはっきりはしませんが、
少なくとも、日曜・休日に 検査比率ピークが来ますので、
日曜・休日の陽性率ピークの押し上げに、一役担っている可能性は否定出来ません。
また、保健所／民間・自費検査 以外については、
7/11以前同様に、検査比率ピークが平日のまま、変わっておりません。
（下図参照）
民間・自費検査の検査件数が、他と比較して日曜・休日でも あまり減らないのは、
おそらく「自費」の都合上、個人での検査日が 休日 になる人が、そこそこ多いからでしょう。
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「 保健所 と 民間・自費検査 から感じた “違和感” 」 について （※あくま個人の感想です）
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まず前提として、PCR検査と新規陽性者数の関連性には、根幹に大きな疑問を感じています。
よく語られる “PCR検査の原理そのもの（※）” が孕む、不明瞭さ・不確実さ も関わってきますが、
（※ PCRプライマーの設定や、CT値の問題など、偽陽性を生み出すとされる、機構上・構造上の問題のこと。）
そもそも、
① PCR検査件数が増えるから → 新規陽性者数が増える
のか、それとも
② 潜在的陽性者（濃厚接触者等・要検査対象）が増えるから → PCR検査が増える
のか、良く整理しきれないのです。（鶏が先か？ 卵が先か？のような。）
① について
昨年の暮れなどに、帰省のための “念の為 PCR検査” の数が増えたことがありました。
こういった時には、PCR検査の増加によって陽性者数が急増するようなことはなかったと思います。（後でデータ検証します）
その際、一般の方々が利用したPCR検査機関は、時期的にクリニック等の “医療関係” が多かったはずです。（親戚もそうでした。）
そして “医療関係” による検査は、“検査件数が平日ピーク” の検査機関ですから、
陽性率の日曜・休日ピークとは繋がらない、いわば 陽性者が “薄い” 検査母体になります。
おそらく、民間・行政検査や大学等も、同様に 陽性者が “薄い” 検査母体 となるでしょう。
これら “薄い” 検査母体 のPCR検査数が増えても、単純に陽性者数の増加には直結しないと思われます。
つまりこちらのケースでは、①には当てはまっていない ことになります。
②について（保健所の場合）
一方②については、やはり 保健所 がキーになってくるかと思います。
地方衛生研究所・保健所 は、前回の考察を踏まえても、
“濃い” 検査母体 であることには間違いないとはずです。
では “濃い” 検査母体 である 保健所 のPCR検査件数が増えるのは、どういう状況でしょう？
おそらく、クラスターの発生等で、追跡しなければならない濃厚接触者の数が多い時、
保健所 が扱うPCR検査の数は増えるはずです。
当然、このような状況でのPCR検査は、一般のPCR検査状況よりも、陽性者の発生率が高くなるはずですから、
保健所 の検査比率が高くなる日曜・休日の陽性率増加は、こういった仕組みで起こってるものと推測出来ます。
この状況は、②に近いと思います。
但し②の結果が、 そのままシンプルに PCR検査増加 → 陽性者増加
とはならない可能性も、考慮しておく必要があろうかと思います。
それは “PCR検査自体の不明瞭さ” に起因するものです。
問題を単純に絞って、CT値についてだけ考えても、
未だに検査機関によって、CT値が35回であったり40回であったり、まちまちのようです。
この辺りは、イベルメクチンについての放映で一躍有名（？）になった、長尾医師のブログでも、
保健所 とクリニックでのPCR検査CT値の違いで、揉めた件について触れられていました。
↓↓↓↓↓
http://blog.drnagao.com/2021/09/post-7699.html
１人の陽性者から → 複数の濃厚接触者（PCR検査） → （陽性の場合）更に複数の濃厚接触者（PCR検査） → … → … → …
と、いわば指数関数的に陽性者の確認をする可能性がある 保健所 の場合、
PCR検査のCT値などの調整次第によっては、陽性／陰性の僅かな閾値の違い であっても、
最終的に、PCR検査数・陽性者数ともに、大きな違いとなって現れてくることもあるでしょう。
それに加えて、誰から誰までを濃厚接触者とするか、という判断の現場では、
マスク等の有無や接触時間の長短など、意外と関係者の主観に基づく判断に拠るところが多いとも聞きます。
おそらく、現場担当者ですら意に介さない程度の、検査方針や手順の細かな変更 によって、
保健所 のPCR結果は、微妙な調整 がされているのではないか、と邪推しています。
ですから、保健所 周辺の事情においては、①②の関係性は、もう少し複雑な様相を呈してると考えています。
そして、民間・自費検査 についてです。
7/12以降に唐突にデータ上に現れ、グラフ上で見ればどうしても、
その後の 新規陽性者数 の増加との関連を疑ってしまいます。
しかし、これほど堂々と厚生労働省のオープンデータには掲載されているにも関わらず、
同ホームページのグラフ上には一切反映させず、且つ、そのデータ取り扱い方については、
理由の説明が全くありません。
加えて、他の検査機関と違い、この 民間・自費検査 だけが、
保健所 の検査件数の推移と同様、検査比率のピークが日曜・休日に来ており、
日曜・休日の陽性率ピークの押し上げに、一役買っている可能性が否定出来ないのです。
（ つまり、程度の差はあれ、民間・自費検査 もまた“濃い” 検査母体 である可能性。）
民間・自費検査 の実態について、もう少し掘り下げることが出来れば、
何かもっと見えてくることもあるのでしょうが、いかんせん、そこまでの時間的余裕が流石ににありません。
９月に入り、新規陽性者数は急激に減少していますが、
同時に 保健所 の検査件数も減少しており、相関関係があるようにも見えます。
一方、民間・自費検査 については、検査件数に目立った減少傾向はまだ見えておりません。
（但し、民間・行政検査と医療機関については、減少傾向です。）
今のところは “減少して見える” 新規陽性者数ですが、今後の先行きは、まだまだ不明瞭だと思っています。
また個人的な心象ですが、現在のPCR検査体制によって喧伝されているコロナの感染状況は、
決して現実の状況を、真っ正直に反映したものだとは思ってはおりません。
少なからず、何らかの “脚色・演出” がなされているのではないかと、観察・推測しております。
その “演出家” なる者が、一体何者なのか？ ここで言及するつもりは一切ありませんが、
どうも 保健所 とその方向に、何がしかの “伏魔殿” があるような気がしてならないのです。
（※ 勿論、現場職員の方々の御尽力には、微塵も疑念はありません。日々敬意を評しております。）
なお、今回のグラフ作成に使用したエクセルデータ。
↓↓↓↓↓
厚労省OPD pcr_case_daily_20210925_解析中02.xlsx
Microsoft Excel Workbook
（記事内未使用グラフもあって、とっ散らかってますが、あしからず。）
