サイコロにもてあそばれる日々

統計学に関連する内容を備忘録代わりに書いていきます。

系統樹作成ソフトウエア - POPTREE2

2011-07-04 23:26:11 | 日記
系統樹作成ソフトウエアにはPhylipやPopulationsがあります。 が、今回ご紹介するのがPOPTREE2です。 POPTREE2は遺伝マーカーから得られたデータから集団系統樹を描画するソフトです。 このソフトの機能は 1. 5種類の遺伝距離(根井の遺伝距離Da, 根井の標準遺伝距離Ds, Fst*, デルタミュー2乗, Dsw)について、 計算、系統樹の作成、ブートストラップ検定 . . . 本文を読む