バイオの故里から

バイオ塾主宰・Dr.Kawanoの日々、収集している情報(DB原稿)をバイオ塾メンバー向けて公開しています。

DNAメチル化測定方法

2008年11月13日 | BioTech生物工学 遺伝子工学
出願番号 : 特許出願2008-77970 出願日 : 2008年3月25日
公開番号 : 特許公開2008-263963 公開日 : 2008年11月6日
出願人 : 住友化学株式会社 発明者 : 冨ヶ原 祥隆 外2名

発明の名称 : DNAメチル化測定方法

【課題】生物由来検体中に含まれるゲノムDNAが有する目的とするDNA領域におけるメチル化されたDNAの含量を簡便に測定する方法等を提供する。
【解決手段】生物由来検体中に含まれるゲノムDNA由来のDNA試料から一本鎖DNAを取得する第一工程、(i)第一工程で取得された一本鎖DNA、(ii)メチル化DNA抗体、及び、(iii)前記のメチル化DNA抗体と目的とするDNA領域においてメチル化されたDNAとの結合を阻害せず且つ前記の一本鎖DNAと結合し得るオリゴヌクレオチド、を混合することによりメチル化された目的とするDNA領域を含む一本鎖DNAと、メチル化DNA抗体と、前記のオリゴヌクレオチドとの複合体を形成させると同時に若しくは形成させた後、当該複合体を分離する第二工程等を有するメチル化されたDNAを検出若しくは定量する方法等を提供する。

出願番号 : 特許出願2008-77969 出願日 : 2008年3月25日
公開番号 : 特許公開2008-263962 公開日 : 2008年11月6日
出願人 : 住友化学株式会社 発明者 : 冨ヶ原 祥隆 外2名

発明の名称 : DNAメチル化測定方法

【課題】生物由来検体中に含まれるゲノムDNAが有する目的とするDNA領域におけるメチル化されたDNAの含量を簡便に測定する方法等を提供する。
【解決手段】(1)生物由来検体中に含まれるゲノムDNA由来のDNA試料からメチル化された一本鎖DNAを取得し、該一本鎖DNAと、固定化メチル化DNA抗体とを結合させて一本鎖DNAを選択する第一工程、(2)第一工程で選択された一本鎖DNAと、メチル化感受性制限酵素の認識部位の塩基配列と相補的な塩基配列からなるマスキング用オリゴヌクレオチドとを混合し、少なくとも1種類以上のメチル化感受性制限酵素で選択された一本鎖DNAを消化処理する第二工程等を有する生物由来検体中に含まれるゲノムDNAが有する目的とするDNA領域におけるメチル化されたDNAの含量を測定する方法等を提供する。

出願番号 : 特許出願2008-77968 出願日 : 2008年3月25日
公開番号 : 特許公開2008-263961 公開日 : 2008年11月6日
出願人 : 住友化学株式会社 発明者 : 冨ヶ原 祥隆 外2名

発明の名称 : DNAメチル化測定方法

【課題】生物由来検体中に含まれるゲノムDNAが有する目的とするDNA領域におけるメチル化されたDNAの含量を簡便に測定する方法等を提供する。
【解決手段】(1)生物由来検体中に含まれるゲノムDNA由来のDNA試料からメチル化された一本鎖DNAを取得し、該一本鎖DNAと、固定化メチル化DNA抗体とを結合させて一本鎖DNAを選択する第一工程、(2)第一工程で選択された一本鎖DNAを少なくとも1種類の一本鎖DNAを消化できるメチル化感受性制限酵素で消化処理する第二工程、及び、(3)下記の各本工程の前工程として、第二工程で得られた未消化物である一本鎖DNAを、前記の固定化メチル化DNA抗体から分離して一本鎖状態であるDNA(正鎖)にする工程(第三(前A)工程)等を有する生物由来検体中に含まれるゲノムDNAが有する目的とするDNA領域におけるメチル化されたDNAの含量を測定する方法等を提供する。

出願番号 : 特許出願2007-21171 出願日 : 2007年1月31日
公開番号 : 特許公開2008-182985 公開日 : 2008年8月14日
出願人 : 住友化学株式会社 発明者 : 冨ヶ原 祥隆 外1名

発明の名称 : DNAメチル化測定方法

【課題】メチル化DNA:Xの含量の測定方法の提供。
【解決手段】Xの含量の測定方法で、組合せ工程(i)/(ii)で得られた未消化物Cを一本鎖状態に一旦分離し、且つ、生成した一本鎖状態DNA:CとBとを結合させてCを選択し、且つ、選択されたCを鋳型としBをプライマー:PRとしてCを1回伸長させて二本鎖を形成させ、形成した二本鎖:Dを一本鎖状態DNA(正鎖):E及び一本鎖状態DNA(負鎖):Fに一旦分離する。生成した一本鎖状態DNA(正鎖):EとBとを結合させてEを選択し、選択されたEを鋳型としBをPRとしてEを1回伸長させて二本鎖を形成させる。生成した一本鎖状態DNA(負鎖):Fを鋳型とし特定PR:GをPRとしてFを1回伸長させて二本鎖を形成させる。さらにこれら操作を伸長形成された二本鎖DNAを一本鎖状態に一旦分離後、繰返してXを増幅・定量する等。 明細書Text >> J-tokkyo

出願番号 : 特許出願2006-347301 出願日 : 2006年12月25日
公開番号 : 特許公開2008-154515 公開日 : 2008年7月10日
出願人 : 住友化学株式会社 発明者 : 冨ヶ原 祥隆 外1名

発明の名称 : DNAメチル化測定方法

【課題】メチル化DNAの含量の測定方法の提供。
【解決手段】試料から一本鎖DNA:Aと一本鎖固定化オリゴヌクレオチドBとを結合させてAを選択して、Aを一本鎖DNAを消化できるメチル化感受性制限酵素で消化後、遊離消化物を除去し、未消化物であるAを一本鎖に一旦分離し、生成した遊離一本鎖DNAとBとを結合させて一本鎖DNAを選択し、選択された遊離一本鎖DNAを鋳型としBをプライマー:PRとしてBを1回伸長させて形成した二本鎖Cを一本鎖状態に一旦分離し、生成した遊離一本鎖DNAとBとを結合させて一本鎖DNAを選択し、一本鎖状態DNAを鋳型としBをPRとしてBを1回伸長させて二本鎖として形成させ、生成した固定一本鎖DNA:Dを鋳型とし特定PR:EをPRとしてEを1回伸長させてDを二本鎖として形成させ、さらにこれら操作を伸長形成された二本鎖DNAを一本鎖に一旦分離後、繰返して増幅・定量する。

出願番号 : 特許出願2006-347300 出願日 : 2006年12月25日
公開番号 : 特許公開2008-154514 公開日 : 2008年7月10日
出願人 : 住友化学株式会社 発明者 : 冨ヶ原 祥隆 外1名

発明の名称 : DNAメチル化測定方法

【課題】メチル化DNAの含量の測定方法の提供。
【解決手段】試料から一本鎖DNA:Aと一本鎖固定化オリゴヌクレオチドBとを結合させAを選択して二本鎖Cを形成させ、Cをメチル化感受性制限酵素で消化後、生成した遊離消化物を除去し、未消化物であるCを一本鎖状態に分離し、生成した遊離一本鎖DNAとBとを結合させて一本鎖DNAを選択し、選択した遊離一本鎖DNAを鋳型としBをプライマー:PRとしてBを1回伸長させて形成した二本鎖Dを一本鎖に一旦分離し、生成した一本鎖DNA(正鎖)とBとを結合させて一本鎖DNAを選択し、一本鎖DNAを鋳型としBをPRとしてBを1回伸長させて二本鎖として形成させ、生成した一本鎖DNA(負鎖):Eを鋳型とし特定PR:FをPRとしてFを1回伸長させてEを二本鎖として形成させ、さらに伸長形成された二本鎖DNAを一本鎖状態に一旦分離後、繰返して増幅・定量する。

出願番号 : 特許出願2006-347302 出願日 : 2006年12月25日
公開番号 : 特許公開2008-104443 公開日 : 2008年5月8日
出願人 : 住友化学株式会社 発明者 : 冨ヶ原 祥隆 外1名

発明の名称 : DNAメチル化測定方法

【課題】メチル化DNA:Xの含量の測定方法の提供。
【解決手段】Xの含量の測定方法で、試料から一本鎖DNA:Aと一本鎖固定化オリゴヌクレオチド:Bとを結合させてAを選択し、これを鋳型としBをプライマー:PRとしてBを1回伸長させて二本鎖:Cとして形成させ、Cをメチル化感受性制限酵素で消化処理後、生成した遊離消化物を除去し、前工程として未消化物であるCを一本鎖状態に一旦分離し、且つ、生成した一本鎖状態DNA(正鎖):DとBとを結合させて一本鎖状態DNA:Eを選択し、選択されたEを鋳型としBをPRとしてBを1回伸長させて二本鎖として形成させ、生成した一本鎖状態DNA(負鎖):Fを鋳型とし特定PR:GをPRとしてGを1回伸長させてFを二本鎖として形成させ、さらにこれら操作を伸長形成された二本鎖DNAを一本鎖状態に一旦分離後、繰返してXを増幅・定量する。

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