前回に引き続き、リ・メン・ヤン博士の論文「自然進化ではなく実験室での高度な改変を示唆する、SARS-CoV-2ゲノムの特異な特徴とその合成経路の解明」の日本語訳です。今回は序論の部分だけです。おかしな訳が見つかったらちょくちょく手を加えるかもしれません。解説も少しずつ増えるかもしれません。リ・メン・ヤン博士の無料論文から本文は読めるのでよろしく。
序論
COVID-19は世界的なパンデミックを引き起こし、その規模と深刻さは前例のないものとなっています。国際社会による多大な努力にもかかわらず、このパンデミックの管理と制御は依然として困難であり興味をそそられる。
SARS-CoV-2 はコロナウイルスとして、他の呼吸器系ウイルスや人獣共通感染症ウイルスと大きく異なる点は、多臓器を攻撃すること、無症状の感染期間が長いこと、感染性が高く、リスクの高い集団では致死的であること、出現当初からヒトによく適応していること1、ヒト ACE2 受容体（hACE2）との結合能が高く、他の宿主の ACE2 との結合能よりも親和性が高いこと2,3などである。
SARS-CoV-2の起源については、現在も多くの議論がなされている。広く引用されているNature Medicineの論文では、SARS-CoV-2は自然界から来た可能性が高いと主張している4。しかし、その論文とこの中心的な結論は現在、世界中の科学者によって挑戦されている5-15。さらに、このNature Medicineの論文の著者は利益相反の兆候を示している16,17。
自然起源説を支持する既存の科学論文は、SARS-CoV-218と96％の塩基配列同一性を持つ、以前に発見されたコウモリコロナウイルスRaTG13という単一の証拠に大きく依存している。しかし、RaTG13が自然界に存在し、報告されている配列の真実性は広く疑問視されている6-9,19-21。注目すべきは、科学雑誌がSARS-CoV-28,22の非自然起源を示唆する反対意見を明確に検閲していることである。この検閲のため、SARS-CoV-2の自然起源やRaTG13の実在性に疑問を呈する論文は、科学的には高品質であるにもかかわらず、プレプリント5-9,19-21や、様々なオンラインプラットフォーム10-13,23で公開されている非査読論文としてしか存在できない。それにもかかわらず、これらの報告書を分析すると、RaTG13の報告に関連した重大な問題と不正の可能性が繰り返し指摘されている6,8,9,19-21。したがって、SARS-CoV-2の起源を追跡する世界の努力を誤解させるために捏造された科学的データが発表されたという説は、SARS-CoV-2が非自然起源であるという考え方と連動して、かなりの説得力を持つようになってきた。
この考え方と一致するように、ゲノム、構造、および文献からも、SARS-CoV-2が非自然起源であることが示唆されている。さらに、ウイルスゲノムを精密に操作して、ユニークな特性を持つ新規コロナウイルスを作製することができるようになるまでには、機能獲得研究が進んでいることが多くの文献から示唆されている。本報告書では、そのようなエビデンスと関連する解析結果を紹介する。本報告書の第1部では、SARS-CoV-のゲノムと構造の特徴について述べている。その存在は、単純な連続的なウイルスの推移によって得られるものを超えて、ウイルスが実験室で改変された産物であるという理論と一致している可能性がある。本報告書の第2部では、SARS-CoV-2が実験室で作られた可能性の高い経路を説明しており、その主要なステップはウイルスゲノムに存在する証拠によって裏付けられている。重要なことは、第2部で入手可能な材料と十分に文書化された技術を用いて、SARS-CoV-2を実験室で短時間に簡便に作製できることを示したということである。本報告書は、ウイルス学、分子生物学、構造生物学、計算生物学、ワクチン開発、医学の各分野における経験豊富な科学者のチームによって作成された。
解説というかコメント
いかに人工的なウイルスであるかということを証明することはそもそも困難だが、自然起源説にはチャイナの息がかかっていること、コウモリコロナウイルスRaTG13がそもそも実在するか疑わしいこと、科学雑誌が不当な検閲を行っていることなど、疑問点を上げている。これだけではどうとでも言い逃れが出来ることではあるが（例えば作ったウイルスをコウモリに注射して、ほら見つかったというのは難しいことではないし、チャイニーズが論文を書いたり、科学雑誌の投稿論文の査読や編集をしてはいけないとしたら差別であると言われるに違いない）、筆者らは実験室で簡単にウイルスが作れることを示したと主張する。それが自然界での変異だとどれだけ時間がかかりそうだとかまで議論しているかは、読んでみないと分からない（読み終える前に訳し始めんなともいう）。「ウイルス学、分子生物学、構造生物学、計算生物学、ワクチン開発、医学の各分野における経験豊富な科学者のチーム」と言っているが、著者は4人しかいない。実は謝辞でも彼らが言っているが、”anonymous scientists”が結構いるらしい。
ここの部分の参照文献（後でリンクに跳べるようにするとか、何とかする予定）
- Zhan, S.H., Deverman, B.E. & Chan, Y.A. SARS-CoV-2 is well adapted for humans. What does this mean for re-emergence? bioRxiv, https://doi.org/10.1101/2020.05.01.073262 (2020).
- Mou, H. et al. Mutations from bat ACE2 orthologs markedly enhance ACE2-Fc neutralization of SARSCoV-2. bioRxiv, https://doi.org/10.1101/2020.06.29.178459 (2020).
- Piplani, S., Singh, P.K., Winkler, D.A. & Petrovsky, N. In silico comparison of spike protein-ACE2 binding affinities across species; significance for the possible origin of the SARS-CoV-2 virus. arXiv, arXiv:2005.06199 (2020).
- Andersen, K.G., Rambaut, A., Lipkin, W.I., Holmes, E.C. & Garry, R.F. The proximal origin of SARSCoV-2. Nat Med 26, 450-452 (2020).
- Maiti, A.K. On The Origin of SARS-CoV-2 Virus. Preprint (authorea.com), DOI: 10.22541/au.159355977.76503625 (2020).
- Lin, X. & Chen, S. Major Concerns on the Identification of Bat Coronavirus Strain RaTG13 and Quality of Related Nature Paper. Preprints, 2020060044 (2020).
- Bengston, D. All journal articles evaluating the origin or epidemiology of SARS-CoV-2 that utilize the RaTG13 bat strain genomics are potentially flawed and should be retracted. OSFPreprints, DOI: 10.31219/osf.io/wy89d (2020).
- Segreto, R. & Deigin, Y. Is considering a genetic-manipulation origin for SARS-CoV-2 a conspiracy theory that must be censored? Preprint (Researchgate) DOI: 10.13140/RG.2.2.31358.13129/1 (2020).
- Rahalkar, M.C. & Bahulikar, R.A. Understanding the Origin of ‘BatCoVRaTG13’, a Virus Closest to SARS-CoV-2. Preprints, 2020050322 (2020).
- Robinson, C. Was the COVID-19 virus genetically engineered? (https://gmwatch.org/en/news/latestnews/ 19383, 2020).
- Robinson, C. Another expert challenges assertions that SARS-CoV-2 was not genetically engineered. (https://gmwatch.org/en/news/latest-news/19383, 2020).
- Sorensen, B., Dalgleish, A. & Susrud, A. The Evidence which Suggests that This Is No Naturally Evolved Virus. Preprint, https://www.minervanett.no/files/2020/07/13/TheEvidenceNoNaturalEvol.pdf (2020).
- Zhang, B. SARS-CoV-2 Could Come from a Lab - A Critique of “The Proximal Origin of SARS-CoV-2” Published in Nature Medicine. (https://www.linkedin.com/pulse/sars-cov-2-could-come-from-labcritique-proximal-origin-billy-zhang?articleId=6651628681431175168#comments-6651628681431175168&trk=public_profile_article_view, 2020).
- Sirotkin, K. & Sirotkin, D. Might SARS‐CoV‐2 Have Arisen via Serial Passage through an Animal Host or Cell Culture? BioEssays, https://doi.org/10.1002/bies.202000091 (2020).
- Seyran, M. et al. Questions concerning the proximal origin of SARS-CoV-2. J Med Virol (2020).
- China Honors Ian Lipkin. (https://www.publichealth.columbia.edu/public-health-now/news/china-honorsian- lipkin, 2020).
- Holmes, E. Academic CV. (https://www.sydney.edu.au/AcademicProfiles/profile/resource?urlid=edward.holmes&type=cv, 2020).
- Zhou, P. et al. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature (2020).
- Rahalkar, M. & Bahulikar, R. The Abnormal Nature of the Fecal Swab Sample used for NGS Analysis of RaTG13 Genome Sequence Imposes a Question on the Correctness of the RaTG13 Sequence. Preprints.org, 2020080205 (2020).
- Singla, M., Ahmad, S., Gupta, C. & Sethi, T. De-novo Assembly of RaTG13 Genome Reveals Inconsistencies Further Obscuring SARS-CoV-2 Origins. Preprints, 2020080595 (doi: 10.20944/preprints202008.0595.v1) (2020).
- Zhang, D. Anomalies in BatCoV/RaTG13 sequencing and provenance. Preprint (zenodo.org), https://zenodo.org/record/3987503#.Xz9GzC-z3GI (2020).
- Robinson, C. Journals censor lab origin theory for SARS-CoV-2. (https://www.gmwatch.org/en/news/latest-news/19475-journals-censor-lab-origin-theory-for-sars-cov-2, 2020).
- Scientific evidence and logic behind the claim that the Wuhan coronavirus is man-made. https://nerdhaspower.weebly.com (2020).
