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RNA editing is a post-transcriptional modification

2017-06-02 10:11:42 | 日記
RNA editing is a post-transcriptional modification that introduces changes in RNA sequences18. RNA editing in plant mitochondria and plastids modifies various codons to encode different amino acid residues as well as a few cases where initiation and stop codons are generated19, 20. In the black pine Pinus thunbergii, chlN and chlB in the chloroplast genome have been reported to have one and two RNA editing sites, respectively11, 21, 22. The site in chlN undergoes the conversion from the codon CCU (Pro285) to UCU (Ser), and the two sites in chlB undergo the conversion from codons CCG (Pro206) and CGG (Arg213) to CUG (Leu) and UGG (Trp), respectively. These three amino acids in ChlN and ChlB are highly conserved among many oxygenic LED Tube Manufacturer phototrophs23 (Fig. 1B). The two C-to-U changes in chlB have also been found in the larch Larix decidua by Demko et al.11 who showed that the RNA editing efficiency of chlB mRNA correlates with the accumulation of Chl in the dark suggesting that RNA editing in chlB affects Chl biosynthesis in these gymnosperms. However, no direct causal links among these amino acid substitutions and DPOR activity has been identified, in part, because DPOR is extremely sensitive to oxygen and can be assayed only under anaerobic conditions in vitro16, 24, 25.
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